RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529801.1

PUS3-202, Transcript of pseudouridylate synthase 3, humanhuman

TSL 4

Gene PUS3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3-202ENST00000529801 KIF14Q15058 1648 aa14.92□□□□□ -0.02
PUS3-202ENST00000529801 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PUS3-202ENST00000529801 ADGRL1O94910 1474 aa14.91□□□□□ -0.02
PUS3-202ENST00000529801 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.91□□□□□ -0.02
PUS3-202ENST00000529801 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.91□□□□□ -0.02
PUS3-202ENST00000529801 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.9□□□□□ -0.02
PUS3-202ENST00000529801 AKNAQ7Z591 1439 aa14.9□□□□□ -0.02
PUS3-202ENST00000529801 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PUS3-202ENST00000529801 PLCH2O75038 1416 aa14.89□□□□□ -0.03
PUS3-202ENST00000529801 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PUS3-202ENST00000529801 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.87□□□□□ -0.03
PUS3-202ENST00000529801 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.85□□□□□ -0.03
PUS3-202ENST00000529801 RAPGEF3O95398 923 aa14.84□□□□□ -0.03
PUS3-202ENST00000529801 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.84□□□□□ -0.03
PUS3-202ENST00000529801 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.83□□□□□ -0.03
PUS3-202ENST00000529801 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.83□□□□□ -0.04
PUS3-202ENST00000529801 RICTORQ6R327 1708 aa14.83□□□□□ -0.04
PUS3-202ENST00000529801 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.83□□□□□ -0.04
PUS3-202ENST00000529801 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.82□□□□□ -0.04
PUS3-202ENST00000529801 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.81□□□□□ -0.04
PUS3-202ENST00000529801 CEP162Q5TB80 1403 aa14.8□□□□□ -0.04
PUS3-202ENST00000529801 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.8□□□□□ -0.04
PUS3-202ENST00000529801 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.79□□□□□ -0.04
PUS3-202ENST00000529801 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.78□□□□□ -0.04
PUS3-202ENST00000529801 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.77□□□□□ -0.04
PUS3-202ENST00000529801 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PUS3-202ENST00000529801 PREX2Q70Z35 1606 aa14.77□□□□□ -0.05
PUS3-202ENST00000529801 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PUS3-202ENST00000529801 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.73□□□□□ -0.05
PUS3-202ENST00000529801 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.73□□□□□ -0.05
PUS3-202ENST00000529801 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.73□□□□□ -0.05
PUS3-202ENST00000529801 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.73□□□□□ -0.05
PUS3-202ENST00000529801 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.71□□□□□ -0.05
PUS3-202ENST00000529801 KDM5CP41229 1560 aa14.71□□□□□ -0.05
PUS3-202ENST00000529801 ABCC1P33527 1531 aa14.71□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 ATP10AO60312 1499 aa14.7□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.7□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.7□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.7□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.69□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 RNF39Q9H2S5 420 aa14.69□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.69□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.68□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.68□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.68□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.67□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 PTPRMP28827 1452 aa14.67□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 REREQ9P2R6 1566 aa14.66□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 MADDQ8WXG6 1647 aa14.66□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.66□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.66□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PUS3-202ENST00000529801 AFAP1Q8N556 730 aa14.64□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.63□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.62□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 TIAM1Q13009 1591 aa14.62□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.62□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.62□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 MAP3K1Q13233 1512 aa14.61□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.61□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.61□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 AGLP35573 1532 aa14.6□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 ABCA6Q8N139 1617 aa14.59□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.59□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PUS3-202ENST00000529801 NCOA2Q15596 1464 aa14.57□□□□□ -0.08
PUS3-202ENST00000529801 MLECQ14165 292 aa14.57□□□□□ -0.08
PUS3-202ENST00000529801 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.57□□□□□ -0.08
PUS3-202ENST00000529801 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.57□□□□□ -0.08
PUS3-202ENST00000529801 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.56□□□□□ -0.08
PUS3-202ENST00000529801 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PUS3-202ENST00000529801 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.56□□□□□ -0.08
PUS3-202ENST00000529801 ATP7AQ04656 1500 aa14.56□□□□□ -0.08
PUS3-202ENST00000529801 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
PUS3-202ENST00000529801 APLP2Q06481 763 aa14.55□□□□□ -0.08
PUS3-202ENST00000529801 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PUS3-202ENST00000529801 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PUS3-202ENST00000529801 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.53□□□□□ -0.08
PUS3-202ENST00000529801 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.52□□□□□ -0.08
PUS3-202ENST00000529801 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.5□□□□□ -0.09
PUS3-202ENST00000529801 MBD5Q9P267 1494 aa14.5□□□□□ -0.09
PUS3-202ENST00000529801 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.5□□□□□ -0.09
PUS3-202ENST00000529801 A2MP01023 1474 aa14.5□□□□□ -0.09
PUS3-202ENST00000529801 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.5□□□□□ -0.09
PUS3-202ENST00000529801 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.49□□□□□ -0.09
PUS3-202ENST00000529801 MIA2Q96PC5 1412 aa14.49□□□□□ -0.09
PUS3-202ENST00000529801 PLXNC1O60486 1568 aa14.48□□□□□ -0.09
PUS3-202ENST00000529801 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.48□□□□□ -0.09
PUS3-202ENST00000529801 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PUS3-202ENST00000529801 TSPY4P0CV99 314 aa14.46□□□□□ -0.09
PUS3-202ENST00000529801 TSPY10P0CW01 314 aa14.46□□□□□ -0.09
PUS3-202ENST00000529801 MROH2AA6NES4 1674 aa14.46□□□□□ -0.1
PUS3-202ENST00000529801 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.46□□□□□ -0.1
PUS3-202ENST00000529801 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
PUS3-202ENST00000529801 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.45□□□□□ -0.1
PUS3-202ENST00000529801 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms