RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529505.1

SMIM19-208, Transcript of small integral membrane protein 19, human

TSL 3

Gene SMIM19, Length 920 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMIM19-208	ENST00000529505	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.57	■■■□□ 2.97
SMIM19-208	ENST00000529505	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
SMIM19-208	ENST00000529505	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.57	■■■□□ 2.96
SMIM19-208	ENST00000529505	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.57	■■■□□ 2.96
SMIM19-208	ENST00000529505	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.57	■■■□□ 2.96
SMIM19-208	ENST00000529505	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.56	■■■□□ 2.96
SMIM19-208	ENST00000529505	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.55	■■■□□ 2.96
SMIM19-208	ENST00000529505	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.54	■■■□□ 2.96
SMIM19-208	ENST00000529505	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
SMIM19-208	ENST00000529505	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.51	■■■□□ 2.96
SMIM19-208	ENST00000529505	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.51	■■■□□ 2.95
SMIM19-208	ENST00000529505	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.5	■■■□□ 2.95
SMIM19-208	ENST00000529505	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SMIM19-208	ENST00000529505	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
SMIM19-208	ENST00000529505	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.41	■■■□□ 2.94
SMIM19-208	ENST00000529505	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SMIM19-208	ENST00000529505	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.39	■■■□□ 2.93
SMIM19-208	ENST00000529505	KDM5C	P41229	1560 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SMIM19-208	ENST00000529505	ATP10A	O60312	1499 aa		33.37	■■■□□ 2.93
SMIM19-208	ENST00000529505	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SMIM19-208	ENST00000529505	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SMIM19-208	ENST00000529505	ABCC1	P33527	1531 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SMIM19-208	ENST00000529505	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SMIM19-208	ENST00000529505	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SMIM19-208	ENST00000529505	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SMIM19-208	ENST00000529505	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SMIM19-208	ENST00000529505	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SMIM19-208	ENST00000529505	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
SMIM19-208	ENST00000529505	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SMIM19-208	ENST00000529505	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SMIM19-208	ENST00000529505	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SMIM19-208	ENST00000529505	MLEC	Q14165	292 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SMIM19-208	ENST00000529505	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SMIM19-208	ENST00000529505	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SMIM19-208	ENST00000529505	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SMIM19-208	ENST00000529505	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SMIM19-208	ENST00000529505	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
SMIM19-208	ENST00000529505	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SMIM19-208	ENST00000529505	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SMIM19-208	ENST00000529505	AGL	P35573	1532 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SMIM19-208	ENST00000529505	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SMIM19-208	ENST00000529505	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SMIM19-208	ENST00000529505	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SMIM19-208	ENST00000529505	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SMIM19-208	ENST00000529505	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SMIM19-208	ENST00000529505	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SMIM19-208	ENST00000529505	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SMIM19-208	ENST00000529505	HSPA2	P54652	639 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SMIM19-208	ENST00000529505	APLP2	Q06481	763 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SMIM19-208	ENST00000529505	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
SMIM19-208	ENST00000529505	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33	■■■□□ 2.87
SMIM19-208	ENST00000529505	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SMIM19-208	ENST00000529505	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SMIM19-208	ENST00000529505	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
SMIM19-208	ENST00000529505	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SMIM19-208	ENST00000529505	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
SMIM19-208	ENST00000529505	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.94	■■■□□ 2.86
SMIM19-208	ENST00000529505	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
SMIM19-208	ENST00000529505	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
SMIM19-208	ENST00000529505	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
SMIM19-208	ENST00000529505	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SMIM19-208	ENST00000529505	C3	P01024	1663 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SMIM19-208	ENST00000529505	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
SMIM19-208	ENST00000529505	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SMIM19-208	ENST00000529505	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SMIM19-208	ENST00000529505	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
SMIM19-208	ENST00000529505	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SMIM19-208	ENST00000529505	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SMIM19-208	ENST00000529505	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SMIM19-208	ENST00000529505	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SMIM19-208	ENST00000529505	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
SMIM19-208	ENST00000529505	A2M	P01023	1474 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SMIM19-208	ENST00000529505	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SMIM19-208	ENST00000529505	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SMIM19-208	ENST00000529505	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SMIM19-208	ENST00000529505	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SMIM19-208	ENST00000529505	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SMIM19-208	ENST00000529505	NPAT	Q14207	1427 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMIM19-208	ENST00000529505	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMIM19-208	ENST00000529505	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMIM19-208	ENST00000529505	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SMIM19-208	ENST00000529505	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
SMIM19-208	ENST00000529505	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SMIM19-208	ENST00000529505	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMIM19-208	ENST00000529505	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMIM19-208	ENST00000529505	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SMIM19-208	ENST00000529505	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
SMIM19-208	ENST00000529505	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SMIM19-208	ENST00000529505	GGT6	Q6P531	493 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SMIM19-208	ENST00000529505	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SMIM19-208	ENST00000529505	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SMIM19-208	ENST00000529505	PTPRT	O14522	1441 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SMIM19-208	ENST00000529505	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SMIM19-208	ENST00000529505	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SMIM19-208	ENST00000529505	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
SMIM19-208	ENST00000529505	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.51	■■■□□ 2.8
SMIM19-208	ENST00000529505	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SMIM19-208	ENST00000529505	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SMIM19-208	ENST00000529505	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SMIM19-208	ENST00000529505	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.47	■■■□□ 2.79

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