RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528617.5

PTDSS2-208, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, human

TSL 2

Gene PTDSS2, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTDSS2-208	ENST00000528617	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.96	■■■■□ 3.03
PTDSS2-208	ENST00000528617	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.95	■■■■□ 3.02
PTDSS2-208	ENST00000528617	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.94	■■■■□ 3.02
PTDSS2-208	ENST00000528617	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.92	■■■■□ 3.02
PTDSS2-208	ENST00000528617	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.86	■■■■□ 3.01
PTDSS2-208	ENST00000528617	MLEC	Q14165	292 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PTDSS2-208	ENST00000528617	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PTDSS2-208	ENST00000528617	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	33.85	■■■■□ 3.01
PTDSS2-208	ENST00000528617	KIF14	Q15058	1648 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PTDSS2-208	ENST00000528617	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PTDSS2-208	ENST00000528617	HSPA2	P54652	639 aa		33.82	■■■■□ 3
PTDSS2-208	ENST00000528617	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
PTDSS2-208	ENST00000528617	ATP10A	O60312	1499 aa		33.81	■■■■□ 3
PTDSS2-208	ENST00000528617	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.76	■■■■□ 3
PTDSS2-208	ENST00000528617	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PTDSS2-208	ENST00000528617	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PTDSS2-208	ENST00000528617	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PTDSS2-208	ENST00000528617	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PTDSS2-208	ENST00000528617	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PTDSS2-208	ENST00000528617	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PTDSS2-208	ENST00000528617	CLIP1	P30622	1438 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PTDSS2-208	ENST00000528617	KDM5C	P41229	1560 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PTDSS2-208	ENST00000528617	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
PTDSS2-208	ENST00000528617	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PTDSS2-208	ENST00000528617	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PTDSS2-208	ENST00000528617	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PTDSS2-208	ENST00000528617	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PTDSS2-208	ENST00000528617	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PTDSS2-208	ENST00000528617	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PTDSS2-208	ENST00000528617	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PTDSS2-208	ENST00000528617	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PTDSS2-208	ENST00000528617	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PTDSS2-208	ENST00000528617	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PTDSS2-208	ENST00000528617	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PTDSS2-208	ENST00000528617	ABCC1	P33527	1531 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PTDSS2-208	ENST00000528617	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PTDSS2-208	ENST00000528617	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PTDSS2-208	ENST00000528617	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PTDSS2-208	ENST00000528617	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PTDSS2-208	ENST00000528617	AGL	P35573	1532 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PTDSS2-208	ENST00000528617	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PTDSS2-208	ENST00000528617	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PTDSS2-208	ENST00000528617	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PTDSS2-208	ENST00000528617	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PTDSS2-208	ENST00000528617	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PTDSS2-208	ENST00000528617	C3	P01024	1663 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PTDSS2-208	ENST00000528617	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
PTDSS2-208	ENST00000528617	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
PTDSS2-208	ENST00000528617	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
PTDSS2-208	ENST00000528617	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PTDSS2-208	ENST00000528617	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PTDSS2-208	ENST00000528617	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PTDSS2-208	ENST00000528617	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PTDSS2-208	ENST00000528617	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.26	■■■□□ 2.91
PTDSS2-208	ENST00000528617	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PTDSS2-208	ENST00000528617	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
PTDSS2-208	ENST00000528617	PTPRT	O14522	1441 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PTDSS2-208	ENST00000528617	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PTDSS2-208	ENST00000528617	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
PTDSS2-208	ENST00000528617	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PTDSS2-208	ENST00000528617	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PTDSS2-208	ENST00000528617	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PTDSS2-208	ENST00000528617	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PTDSS2-208	ENST00000528617	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PTDSS2-208	ENST00000528617	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PTDSS2-208	ENST00000528617	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PTDSS2-208	ENST00000528617	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.89
PTDSS2-208	ENST00000528617	NPAT	Q14207	1427 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PTDSS2-208	ENST00000528617	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PTDSS2-208	ENST00000528617	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PTDSS2-208	ENST00000528617	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PTDSS2-208	ENST00000528617	A2M	P01023	1474 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PTDSS2-208	ENST00000528617	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PTDSS2-208	ENST00000528617	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
PTDSS2-208	ENST00000528617	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PTDSS2-208	ENST00000528617	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PTDSS2-208	ENST00000528617	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PTDSS2-208	ENST00000528617	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.01	■■■□□ 2.88
PTDSS2-208	ENST00000528617	GGT6	Q6P531	493 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PTDSS2-208	ENST00000528617	PTPRK	Q15262	1439 aa		33	■■■□□ 2.87
PTDSS2-208	ENST00000528617	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PTDSS2-208	ENST00000528617	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PTDSS2-208	ENST00000528617	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PTDSS2-208	ENST00000528617	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PTDSS2-208	ENST00000528617	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PTDSS2-208	ENST00000528617	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
PTDSS2-208	ENST00000528617	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PTDSS2-208	ENST00000528617	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PTDSS2-208	ENST00000528617	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PTDSS2-208	ENST00000528617	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
PTDSS2-208	ENST00000528617	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PTDSS2-208	ENST00000528617	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PTDSS2-208	ENST00000528617	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PTDSS2-208	ENST00000528617	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PTDSS2-208	ENST00000528617	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
PTDSS2-208	ENST00000528617	PKD2	Q13563	968 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PTDSS2-208	ENST00000528617	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PTDSS2-208	ENST00000528617	ILDR2	Q71H61	639 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PTDSS2-208	ENST00000528617	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PTDSS2-208	ENST00000528617	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.79	■■■□□ 2.84

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