RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528068.5

ROBO3-209, Transcript of roundabout guidance receptor 3, humanhuman

TSL 4

Gene ROBO3, Length 572 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3-209ENST00000528068 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.14■■□□□ 1.61
ROBO3-209ENST00000528068 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.12■■□□□ 1.61
ROBO3-209ENST00000528068 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.12■■□□□ 1.61
ROBO3-209ENST00000528068 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.12■■□□□ 1.61
ROBO3-209ENST00000528068 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.12■■□□□ 1.61
ROBO3-209ENST00000528068 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
ROBO3-209ENST00000528068 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.1■■□□□ 1.61
ROBO3-209ENST00000528068 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.09■■□□□ 1.61
ROBO3-209ENST00000528068 PTPRMP28827 1452 aa25.09■■□□□ 1.61
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ROBO3-209ENST00000528068 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.05■■□□□ 1.6
ROBO3-209ENST00000528068 PREX2Q70Z35 1606 aa25.02■■□□□ 1.6
ROBO3-209ENST00000528068 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.02■■□□□ 1.6
ROBO3-209ENST00000528068 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.02■■□□□ 1.6
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ROBO3-209ENST00000528068 ATP10AO60312 1499 aa24.96■■□□□ 1.59
ROBO3-209ENST00000528068 AFAP1Q8N556 730 aa24.96■■□□□ 1.59
ROBO3-209ENST00000528068 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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ROBO3-209ENST00000528068 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.95■■□□□ 1.59
ROBO3-209ENST00000528068 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.94■■□□□ 1.58
ROBO3-209ENST00000528068 CEP162Q5TB80 1403 aa24.94■■□□□ 1.58
ROBO3-209ENST00000528068 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.93■■□□□ 1.58
ROBO3-209ENST00000528068 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.9■■□□□ 1.58
ROBO3-209ENST00000528068 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.9■■□□□ 1.58
ROBO3-209ENST00000528068 MLECQ14165 292 aa24.89■■□□□ 1.58
ROBO3-209ENST00000528068 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.88■■□□□ 1.57
ROBO3-209ENST00000528068 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
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ROBO3-209ENST00000528068 ABCA6Q8N139 1617 aa24.86■■□□□ 1.57
ROBO3-209ENST00000528068 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.85■■□□□ 1.57
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ROBO3-209ENST00000528068 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.84■■□□□ 1.57
ROBO3-209ENST00000528068 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.84■■□□□ 1.57
ROBO3-209ENST00000528068 REREQ9P2R6 1566 aa24.84■■□□□ 1.57
ROBO3-209ENST00000528068 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.83■■□□□ 1.57
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ROBO3-209ENST00000528068 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.8■■□□□ 1.56
ROBO3-209ENST00000528068 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.8■■□□□ 1.56
ROBO3-209ENST00000528068 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.78■■□□□ 1.56
ROBO3-209ENST00000528068 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ROBO3-209ENST00000528068 TIAM1Q13009 1591 aa24.76■■□□□ 1.55
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ROBO3-209ENST00000528068 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.74■■□□□ 1.55
ROBO3-209ENST00000528068 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.74■■□□□ 1.55
ROBO3-209ENST00000528068 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
ROBO3-209ENST00000528068 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
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ROBO3-209ENST00000528068 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
ROBO3-209ENST00000528068 NCOA2Q15596 1464 aa24.64■■□□□ 1.54
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ROBO3-209ENST00000528068 PLXNC1O60486 1568 aa24.61■■□□□ 1.53
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ROBO3-209ENST00000528068 A2MP01023 1474 aa24.58■■□□□ 1.53
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ROBO3-209ENST00000528068 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.56■■□□□ 1.52
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ROBO3-209ENST00000528068 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.54■■□□□ 1.52
ROBO3-209ENST00000528068 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.52■■□□□ 1.52
ROBO3-209ENST00000528068 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.52■■□□□ 1.52
ROBO3-209ENST00000528068 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.51■■□□□ 1.51
ROBO3-209ENST00000528068 MAP3K1Q13233 1512 aa24.51■■□□□ 1.51
ROBO3-209ENST00000528068 MROH2AA6NES4 1674 aa24.5■■□□□ 1.51
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ROBO3-209ENST00000528068 ZMYM3Q14202 1370 aa24.45■■□□□ 1.5
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ROBO3-209ENST00000528068 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.45■■□□□ 1.5
ROBO3-209ENST00000528068 GGT6Q6P531 493 aa24.44■■□□□ 1.5
ROBO3-209ENST00000528068 NPATQ14207 1427 aa24.44■■□□□ 1.5
ROBO3-209ENST00000528068 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
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ROBO3-209ENST00000528068 STRCQ7RTU9 1775 aa24.42■■□□□ 1.5
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ROBO3-209ENST00000528068 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.39■■□□□ 1.5
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ROBO3-209ENST00000528068 PTPRKQ15262 1439 aa24.36■■□□□ 1.49
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ROBO3-209ENST00000528068 TSPY4P0CV99 314 aa24.34■■□□□ 1.49
ROBO3-209ENST00000528068 TSPY10P0CW01 314 aa24.34■■□□□ 1.49
ROBO3-209ENST00000528068 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.33■■□□□ 1.49
ROBO3-209ENST00000528068 KIF3BO15066 747 aa24.33■■□□□ 1.49
ROBO3-209ENST00000528068 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.33■■□□□ 1.49
ROBO3-209ENST00000528068 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.32■■□□□ 1.48
ROBO3-209ENST00000528068 NCOA1Q15788 1441 aa24.32■■□□□ 1.48
ROBO3-209ENST00000528068 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.3■■□□□ 1.48
ROBO3-209ENST00000528068 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.3■■□□□ 1.48
ROBO3-209ENST00000528068 PTPRTO14522 1441 aa24.29■■□□□ 1.48
ROBO3-209ENST00000528068 APLP2Q06481 763 aa24.29■■□□□ 1.48
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