RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527987.1

SIGIRR-210, Transcript of single Ig and TIR domain containing, humanhuman

TSL 2

Gene SIGIRR, Length 803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRR-210ENST00000527987 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.16■■■□□ 2.42
SIGIRR-210ENST00000527987 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.13■■■□□ 2.41
SIGIRR-210ENST00000527987 ADGRL1O94910 1474 aa30.12■■■□□ 2.41
SIGIRR-210ENST00000527987 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
SIGIRR-210ENST00000527987 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.1■■■□□ 2.41
SIGIRR-210ENST00000527987 RAPGEF3O95398 923 aa30.09■■■□□ 2.41
SIGIRR-210ENST00000527987 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.09■■■□□ 2.41
SIGIRR-210ENST00000527987 ABCC1P33527 1531 aa30.07■■■□□ 2.4
SIGIRR-210ENST00000527987 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.07■■■□□ 2.4
SIGIRR-210ENST00000527987 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.06■■■□□ 2.4
SIGIRR-210ENST00000527987 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
SIGIRR-210ENST00000527987 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.04■■■□□ 2.4
SIGIRR-210ENST00000527987 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SIGIRR-210ENST00000527987 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.03■■■□□ 2.4
SIGIRR-210ENST00000527987 KDM5CP41229 1560 aa30.02■■■□□ 2.4
SIGIRR-210ENST00000527987 MAP3K1Q13233 1512 aa30.01■■■□□ 2.4
SIGIRR-210ENST00000527987 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30■■■□□ 2.39
SIGIRR-210ENST00000527987 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.99■■■□□ 2.39
SIGIRR-210ENST00000527987 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.98■■■□□ 2.39
SIGIRR-210ENST00000527987 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.97■■■□□ 2.39
SIGIRR-210ENST00000527987 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.96■■■□□ 2.39
SIGIRR-210ENST00000527987 NCOA2Q15596 1464 aa29.94■■■□□ 2.38
SIGIRR-210ENST00000527987 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.94■■■□□ 2.38
SIGIRR-210ENST00000527987 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.93■■■□□ 2.38
SIGIRR-210ENST00000527987 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.92■■■□□ 2.38
SIGIRR-210ENST00000527987 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.92■■■□□ 2.38
SIGIRR-210ENST00000527987 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.91■■■□□ 2.38
SIGIRR-210ENST00000527987 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.9■■■□□ 2.38
SIGIRR-210ENST00000527987 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.88■■■□□ 2.37
SIGIRR-210ENST00000527987 ABCA6Q8N139 1617 aa29.87■■■□□ 2.37
SIGIRR-210ENST00000527987 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.87■■■□□ 2.37
SIGIRR-210ENST00000527987 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.85■■■□□ 2.37
SIGIRR-210ENST00000527987 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.85■■■□□ 2.37
SIGIRR-210ENST00000527987 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.85■■■□□ 2.37
SIGIRR-210ENST00000527987 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
SIGIRR-210ENST00000527987 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
SIGIRR-210ENST00000527987 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.79■■■□□ 2.36
SIGIRR-210ENST00000527987 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.79■■■□□ 2.36
SIGIRR-210ENST00000527987 AFAP1Q8N556 730 aa29.78■■■□□ 2.36
SIGIRR-210ENST00000527987 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.78■■■□□ 2.36
SIGIRR-210ENST00000527987 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
SIGIRR-210ENST00000527987 REREQ9P2R6 1566 aa29.76■■■□□ 2.35
SIGIRR-210ENST00000527987 MADDQ8WXG6 1647 aa29.75■■■□□ 2.35
SIGIRR-210ENST00000527987 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.74■■■□□ 2.35
SIGIRR-210ENST00000527987 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
SIGIRR-210ENST00000527987 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.73■■■□□ 2.35
SIGIRR-210ENST00000527987 ATP10AO60312 1499 aa29.73■■■□□ 2.35
SIGIRR-210ENST00000527987 MBD5Q9P267 1494 aa29.73■■■□□ 2.35
SIGIRR-210ENST00000527987 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
SIGIRR-210ENST00000527987 ATP7AQ04656 1500 aa29.7■■■□□ 2.34
SIGIRR-210ENST00000527987 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.67■■■□□ 2.34
SIGIRR-210ENST00000527987 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
SIGIRR-210ENST00000527987 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.66■■■□□ 2.34
SIGIRR-210ENST00000527987 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.66■■■□□ 2.34
SIGIRR-210ENST00000527987 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.65■■■□□ 2.34
SIGIRR-210ENST00000527987 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.64■■■□□ 2.34
SIGIRR-210ENST00000527987 PLXNC1O60486 1568 aa29.62■■■□□ 2.33
SIGIRR-210ENST00000527987 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
SIGIRR-210ENST00000527987 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.61■■■□□ 2.33
SIGIRR-210ENST00000527987 AGLP35573 1532 aa29.59■■■□□ 2.33
SIGIRR-210ENST00000527987 MIA2Q96PC5 1412 aa29.58■■■□□ 2.33
SIGIRR-210ENST00000527987 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.57■■■□□ 2.32
SIGIRR-210ENST00000527987 APLP2Q06481 763 aa29.57■■■□□ 2.32
SIGIRR-210ENST00000527987 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.56■■■□□ 2.32
SIGIRR-210ENST00000527987 PTPRMP28827 1452 aa29.56■■■□□ 2.32
SIGIRR-210ENST00000527987 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
SIGIRR-210ENST00000527987 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.52■■■□□ 2.32
SIGIRR-210ENST00000527987 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.5■■■□□ 2.31
SIGIRR-210ENST00000527987 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.5■■■□□ 2.31
SIGIRR-210ENST00000527987 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.49■■■□□ 2.31
SIGIRR-210ENST00000527987 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
SIGIRR-210ENST00000527987 A2MP01023 1474 aa29.47■■■□□ 2.31
SIGIRR-210ENST00000527987 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
SIGIRR-210ENST00000527987 MLECQ14165 292 aa29.42■■■□□ 2.3
SIGIRR-210ENST00000527987 C3P01024 1663 aa29.4■■■□□ 2.3
SIGIRR-210ENST00000527987 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.38■■■□□ 2.29
SIGIRR-210ENST00000527987 MROH2AA6NES4 1674 aa29.37■■■□□ 2.29
SIGIRR-210ENST00000527987 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.36■■■□□ 2.29
SIGIRR-210ENST00000527987 ABCC5O15440 1437 aa29.34■■■□□ 2.29
SIGIRR-210ENST00000527987 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
SIGIRR-210ENST00000527987 DAPK1P53355 1430 aa29.32■■■□□ 2.28
SIGIRR-210ENST00000527987 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
SIGIRR-210ENST00000527987 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
SIGIRR-210ENST00000527987 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
SIGIRR-210ENST00000527987 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.26■■■□□ 2.27
SIGIRR-210ENST00000527987 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.25■■■□□ 2.27
SIGIRR-210ENST00000527987 TSPY4P0CV99 314 aa29.24■■■□□ 2.27
SIGIRR-210ENST00000527987 TSPY10P0CW01 314 aa29.24■■■□□ 2.27
SIGIRR-210ENST00000527987 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.23■■■□□ 2.27
SIGIRR-210ENST00000527987 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.23■■■□□ 2.27
SIGIRR-210ENST00000527987 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.23■■■□□ 2.27
SIGIRR-210ENST00000527987 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.22■■■□□ 2.27
SIGIRR-210ENST00000527987 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
SIGIRR-210ENST00000527987 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.19■■■□□ 2.26
SIGIRR-210ENST00000527987 ADGRL2O95490 1459 aa29.17■■■□□ 2.26
SIGIRR-210ENST00000527987 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
SIGIRR-210ENST00000527987 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
SIGIRR-210ENST00000527987 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.16■■■□□ 2.26
SIGIRR-210ENST00000527987 DEPDC5O75140 1603 aa29.16■■■□□ 2.26
SIGIRR-210ENST00000527987 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.1 ms