RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527749.5

RELA-211, Transcript of RELA proto-oncogene, NF-kB subunit, human

TSL 5

Gene RELA, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RELA-211	ENST00000527749	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		43.44	■■■■■ 4.54
RELA-211	ENST00000527749	RAPGEF3	O95398	923 aa		43.41	■■■■■ 4.54
RELA-211	ENST00000527749	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.4	■■■■■ 4.54
RELA-211	ENST00000527749	ADGRL1	O94910	1474 aa		43.39	■■■■■ 4.54
RELA-211	ENST00000527749	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		43.39	■■■■■ 4.54
RELA-211	ENST00000527749	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	43.39	■■■■■ 4.54
RELA-211	ENST00000527749	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	43.38	■■■■■ 4.53
RELA-211	ENST00000527749	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		43.37	■■■■■ 4.53
RELA-211	ENST00000527749	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	43.36	■■■■■ 4.53
RELA-211	ENST00000527749	APLP2	Q06481	763 aa		43.34	■■■■■ 4.53
RELA-211	ENST00000527749	NCOA2	Q15596	1464 aa		43.33	■■■■■ 4.53
RELA-211	ENST00000527749	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		43.33	■■■■■ 4.53
RELA-211	ENST00000527749	RICTOR	Q6R327	1708 aa		43.32	■■■■■ 4.53
RELA-211	ENST00000527749	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		43.24	■■■■■ 4.51
RELA-211	ENST00000527749	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	43.23	■■■■■ 4.51
RELA-211	ENST00000527749	ABCC1	P33527	1531 aa		43.22	■■■■■ 4.51
RELA-211	ENST00000527749	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.22	■■■■■ 4.51
RELA-211	ENST00000527749	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.22	■■■■■ 4.51
RELA-211	ENST00000527749	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.21	■■■■■ 4.51
RELA-211	ENST00000527749	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.18	■■■■■ 4.5
RELA-211	ENST00000527749	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		43.16	■■■■■ 4.5
RELA-211	ENST00000527749	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.1	■■■■■ 4.49
RELA-211	ENST00000527749	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.1	■■■■■ 4.49
RELA-211	ENST00000527749	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43.09	■■■■■ 4.49
RELA-211	ENST00000527749	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.09	■■■■■ 4.49
RELA-211	ENST00000527749	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	43.07	■■■■■ 4.49
RELA-211	ENST00000527749	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		43.06	■■■■■ 4.48
RELA-211	ENST00000527749	KDM5C	P41229	1560 aa		43.05	■■■■■ 4.48
RELA-211	ENST00000527749	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		43.04	■■■■■ 4.48
RELA-211	ENST00000527749	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		43.03	■■■■■ 4.48
RELA-211	ENST00000527749	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	43.02	■■■■■ 4.48
RELA-211	ENST00000527749	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		43.02	■■■■■ 4.48
RELA-211	ENST00000527749	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		43.02	■■■■■ 4.48
RELA-211	ENST00000527749	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		43.01	■■■■■ 4.48
RELA-211	ENST00000527749	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.99	■■■■■ 4.47
RELA-211	ENST00000527749	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.96	■■■■■ 4.47
RELA-211	ENST00000527749	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.95	■■■■■ 4.47
RELA-211	ENST00000527749	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.9	■■■■■ 4.46
RELA-211	ENST00000527749	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.89	■■■■■ 4.46
RELA-211	ENST00000527749	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.88	■■■■■ 4.45
RELA-211	ENST00000527749	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.88	■■■■■ 4.45
RELA-211	ENST00000527749	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.84	■■■■■ 4.45
RELA-211	ENST00000527749	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.83	■■■■■ 4.45
RELA-211	ENST00000527749	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.81	■■■■■ 4.44
RELA-211	ENST00000527749	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.81	■■■■■ 4.44
RELA-211	ENST00000527749	ATP10A	O60312	1499 aa		42.81	■■■■■ 4.44
RELA-211	ENST00000527749	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.8	■■■■■ 4.44
RELA-211	ENST00000527749	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.8	■■■■■ 4.44
RELA-211	ENST00000527749	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.8	■■■■■ 4.44
RELA-211	ENST00000527749	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.77	■■■■■ 4.44
RELA-211	ENST00000527749	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.76	■■■■■ 4.44
RELA-211	ENST00000527749	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.75	■■■■■ 4.43
RELA-211	ENST00000527749	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.75	■■■■■ 4.43
RELA-211	ENST00000527749	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.75	■■■■■ 4.43
RELA-211	ENST00000527749	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
RELA-211	ENST00000527749	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.74	■■■■■ 4.43
RELA-211	ENST00000527749	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.74	■■■■■ 4.43
RELA-211	ENST00000527749	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.67	■■■■■ 4.42
RELA-211	ENST00000527749	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.66	■■■■■ 4.42
RELA-211	ENST00000527749	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.66	■■■■■ 4.42
RELA-211	ENST00000527749	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.64	■■■■■ 4.42
RELA-211	ENST00000527749	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.61	■■■■■ 4.41
RELA-211	ENST00000527749	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.59	■■■■■ 4.41
RELA-211	ENST00000527749	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.57	■■■■■ 4.41
RELA-211	ENST00000527749	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.54	■■■■■ 4.4
RELA-211	ENST00000527749	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.54	■■■■■ 4.4
RELA-211	ENST00000527749	MLEC	Q14165	292 aa		42.53	■■■■■ 4.4
RELA-211	ENST00000527749	ABCC5	O15440	1437 aa		42.51	■■■■■ 4.4
RELA-211	ENST00000527749	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.51	■■■■■ 4.4
RELA-211	ENST00000527749	AGL	P35573	1532 aa		42.51	■■■■■ 4.39
RELA-211	ENST00000527749	A2M	P01023	1474 aa		42.5	■■■■■ 4.39
RELA-211	ENST00000527749	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.5	■■■■■ 4.39
RELA-211	ENST00000527749	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.49	■■■■■ 4.39
RELA-211	ENST00000527749	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.49	■■■■■ 4.39
RELA-211	ENST00000527749	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
RELA-211	ENST00000527749	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.48	■■■■■ 4.39
RELA-211	ENST00000527749	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.47	■■■■■ 4.39
RELA-211	ENST00000527749	DAPK1	P53355	1430 aa		42.46	■■■■■ 4.39
RELA-211	ENST00000527749	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.42	■■■■■ 4.38
RELA-211	ENST00000527749	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.37
RELA-211	ENST00000527749	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
RELA-211	ENST00000527749	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.36	■■■■■ 4.37
RELA-211	ENST00000527749	PTPRM	P28827	1452 aa		42.33	■■■■■ 4.37
RELA-211	ENST00000527749	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.29	■■■■■ 4.36
RELA-211	ENST00000527749	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.24	■■■■■ 4.35
RELA-211	ENST00000527749	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.23	■■■■■ 4.35
RELA-211	ENST00000527749	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.22	■■■■■ 4.35
RELA-211	ENST00000527749	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.21	■■■■■ 4.35
RELA-211	ENST00000527749	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.2	■■■■■ 4.35
RELA-211	ENST00000527749	KIF3B	O15066	747 aa		42.2	■■■■■ 4.35
RELA-211	ENST00000527749	GGT6	Q6P531	493 aa		42.19	■■■■■ 4.34
RELA-211	ENST00000527749	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.19	■■■■■ 4.34
RELA-211	ENST00000527749	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.18	■■■■■ 4.34
RELA-211	ENST00000527749	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.17	■■■■■ 4.34
RELA-211	ENST00000527749	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.15	■■■■■ 4.34
RELA-211	ENST00000527749	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.14	■■■■■ 4.34
RELA-211	ENST00000527749	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.12	■■■■■ 4.33
RELA-211	ENST00000527749	ITGAE	P38570	1179 aa		42.11	■■■■■ 4.33
RELA-211	ENST00000527749	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.1	■■■■■ 4.33
RELA-211	ENST00000527749	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.08	■■■■■ 4.33

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