RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527677.1

TSTA3-207, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-207ENST00000527677 MIA2Q96PC5 1412 aa25.81■■□□□ 1.72
TSTA3-207ENST00000527677 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.81■■□□□ 1.72
TSTA3-207ENST00000527677 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.81■■□□□ 1.72
TSTA3-207ENST00000527677 FANCAO15360 1455 aa25.8■■□□□ 1.72
TSTA3-207ENST00000527677 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
TSTA3-207ENST00000527677 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
TSTA3-207ENST00000527677 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.76■■□□□ 1.71
TSTA3-207ENST00000527677 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.75■■□□□ 1.71
TSTA3-207ENST00000527677 TSPOAP1O95153 1857 aa25.74■■□□□ 1.71
TSTA3-207ENST00000527677 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.71■■□□□ 1.71
TSTA3-207ENST00000527677 AKNAQ7Z591 1439 aa25.71■■□□□ 1.71
TSTA3-207ENST00000527677 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.7■■□□□ 1.7
TSTA3-207ENST00000527677 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
TSTA3-207ENST00000527677 ADGRL1O94910 1474 aa25.67■■□□□ 1.7
TSTA3-207ENST00000527677 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
TSTA3-207ENST00000527677 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.65■■□□□ 1.7
TSTA3-207ENST00000527677 ABCC1P33527 1531 aa25.64■■□□□ 1.7
TSTA3-207ENST00000527677 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.64■■□□□ 1.7
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
TSTA3-207ENST00000527677 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.64■■□□□ 1.69
TSTA3-207ENST00000527677 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.69
TSTA3-207ENST00000527677 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.63■■□□□ 1.69
TSTA3-207ENST00000527677 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
TSTA3-207ENST00000527677 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.61■■□□□ 1.69
TSTA3-207ENST00000527677 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.58■■□□□ 1.69
TSTA3-207ENST00000527677 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.57■■□□□ 1.68
TSTA3-207ENST00000527677 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.56■■□□□ 1.68
TSTA3-207ENST00000527677 KDM6BO15054 1643 aa25.56■■□□□ 1.68
TSTA3-207ENST00000527677 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.56■■□□□ 1.68
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
TSTA3-207ENST00000527677 MBD5Q9P267 1494 aa25.54■■□□□ 1.68
TSTA3-207ENST00000527677 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.53■■□□□ 1.68
TSTA3-207ENST00000527677 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.52■■□□□ 1.68
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TSTA3-207ENST00000527677 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
TSTA3-207ENST00000527677 RICTORQ6R327 1708 aa25.49■■□□□ 1.67
TSTA3-207ENST00000527677 KDM5CP41229 1560 aa25.49■■□□□ 1.67
TSTA3-207ENST00000527677 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.49■■□□□ 1.67
TSTA3-207ENST00000527677 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.49■■□□□ 1.67
TSTA3-207ENST00000527677 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TSTA3-207ENST00000527677 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.48■■□□□ 1.67
TSTA3-207ENST00000527677 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TSTA3-207ENST00000527677 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.47■■□□□ 1.67
TSTA3-207ENST00000527677 TSPY4P0CV99 314 aa25.46■■□□□ 1.67
TSTA3-207ENST00000527677 TSPY10P0CW01 314 aa25.46■■□□□ 1.67
TSTA3-207ENST00000527677 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.45■■□□□ 1.66
TSTA3-207ENST00000527677 RAPGEF3O95398 923 aa25.45■■□□□ 1.66
TSTA3-207ENST00000527677 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.45■■□□□ 1.66
TSTA3-207ENST00000527677 DAPK1P53355 1430 aa25.45■■□□□ 1.66
TSTA3-207ENST00000527677 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-207ENST00000527677 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-207ENST00000527677 AFAP1Q8N556 730 aa25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-207ENST00000527677 ABCC5O15440 1437 aa25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-207ENST00000527677 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.41■■□□□ 1.66
TSTA3-207ENST00000527677 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.41■■□□□ 1.66
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TSTA3-207ENST00000527677 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.38■■□□□ 1.65
TSTA3-207ENST00000527677 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
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TSTA3-207ENST00000527677 ROCK1Q13464 1354 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-207ENST00000527677 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-207ENST00000527677 ADGRL2O95490 1459 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-207ENST00000527677 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-207ENST00000527677 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-207ENST00000527677 PLXNC1O60486 1568 aa25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-207ENST00000527677 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.3■■□□□ 1.64
TSTA3-207ENST00000527677 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.29■■□□□ 1.64
TSTA3-207ENST00000527677 ATP10AO60312 1499 aa25.28■■□□□ 1.64
TSTA3-207ENST00000527677 REREQ9P2R6 1566 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-207ENST00000527677 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-207ENST00000527677 NCOA1Q15788 1441 aa25.26■■□□□ 1.63
TSTA3-207ENST00000527677 ITGAEP38570 1179 aa25.25■■□□□ 1.63
TSTA3-207ENST00000527677 PTPRKQ15262 1439 aa25.25■■□□□ 1.63
TSTA3-207ENST00000527677 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.25■■□□□ 1.63
TSTA3-207ENST00000527677 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.25■■□□□ 1.63
TSTA3-207ENST00000527677 ABCA6Q8N139 1617 aa25.23■■□□□ 1.63
TSTA3-207ENST00000527677 KIF15Q9NS87 1388 aa25.22■■□□□ 1.63
TSTA3-207ENST00000527677 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.22■■□□□ 1.63
TSTA3-207ENST00000527677 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.21■■□□□ 1.63
TSTA3-207ENST00000527677 A2MP01023 1474 aa25.21■■□□□ 1.63
TSTA3-207ENST00000527677 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
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TSTA3-207ENST00000527677 AGLP35573 1532 aa25.17■■□□□ 1.62
TSTA3-207ENST00000527677 HFM1A2PYH4 1435 aa25.16■■□□□ 1.62
TSTA3-207ENST00000527677 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.16■■□□□ 1.62
TSTA3-207ENST00000527677 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TSTA3-207ENST00000527677 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TSTA3-207ENST00000527677 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.12■■□□□ 1.61
TSTA3-207ENST00000527677 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.1■■□□□ 1.61
TSTA3-207ENST00000527677 NAIPQ13075 1403 aa25.1■■□□□ 1.61
TSTA3-207ENST00000527677 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.1■■□□□ 1.61
TSTA3-207ENST00000527677 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.05■■□□□ 1.6
TSTA3-207ENST00000527677 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TSTA3-207ENST00000527677 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.03■■□□□ 1.6
TSTA3-207ENST00000527677 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.03■■□□□ 1.6
TSTA3-207ENST00000527677 KIF3BO15066 747 aa25.02■■□□□ 1.6
TSTA3-207ENST00000527677 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TSTA3-207ENST00000527677 HRCP23327 699 aa25■■□□□ 1.59
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