RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524681.1

CTSW-202, Transcript of cathepsin W, humanhuman

TSL 2

Gene CTSW, Length 521 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-202ENST00000524681 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.55□□□□□ -0.56
CTSW-202ENST00000524681 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.55□□□□□ -0.56
CTSW-202ENST00000524681 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.54□□□□□ -0.56
CTSW-202ENST00000524681 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CTSW-202ENST00000524681 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CTSW-202ENST00000524681 FANCAO15360 1455 aa11.53□□□□□ -0.56
CTSW-202ENST00000524681 MBD5Q9P267 1494 aa11.53□□□□□ -0.56
CTSW-202ENST00000524681 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CTSW-202ENST00000524681 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.53□□□□□ -0.56
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CTSW-202ENST00000524681 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.52□□□□□ -0.57
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CTSW-202ENST00000524681 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
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CTSW-202ENST00000524681 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
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CTSW-202ENST00000524681 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
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CTSW-202ENST00000524681 POGZQ7Z3K3 1410 aa11.43□□□□□ -0.58
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CTSW-202ENST00000524681 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
CTSW-202ENST00000524681 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa11.39□□□□□ -0.59
CTSW-202ENST00000524681 MAST1Q9Y2H9 1570 aa11.39□□□□□ -0.59
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CTSW-202ENST00000524681 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
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CTSW-202ENST00000524681 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
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CTSW-202ENST00000524681 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.33□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.32□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 ABCA6Q8N139 1617 aa11.32□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 TSPY4P0CV99 314 aa11.32□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 TSPY10P0CW01 314 aa11.32□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.32□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 ITGAEP38570 1179 aa11.31□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 NAIPQ13075 1403 aa11.31□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 HFM1A2PYH4 1435 aa11.3□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 ATP10AO60312 1499 aa11.3□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 ADGBQ8N7X0 1667 aa11.3□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.29□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 REREQ9P2R6 1566 aa11.29□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.29□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa11.29□□□□□ -0.6
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CTSW-202ENST00000524681 KIF15Q9NS87 1388 aa11.28□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 A2MP01023 1474 aa11.27□□□□□ -0.6
CTSW-202ENST00000524681 DUOX2Q9NRD8 1548 aa11.27□□□□□ -0.61
CTSW-202ENST00000524681 AGLP35573 1532 aa11.26□□□□□ -0.61
CTSW-202ENST00000524681 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.26□□□□□ -0.61
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CTSW-202ENST00000524681 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.25□□□□□ -0.61
CTSW-202ENST00000524681 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.24□□□□□ -0.61
CTSW-202ENST00000524681 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.24□□□□□ -0.61
CTSW-202ENST00000524681 MROH1Q8NDA8 1641 aa11.24□□□□□ -0.61
CTSW-202ENST00000524681 HRCP23327 699 aa11.23□□□□□ -0.61
CTSW-202ENST00000524681 PCGF6Q9BYE7 350 aa11.23□□□□□ -0.61
CTSW-202ENST00000524681 DEPDC5O75140 1603 aa11.21□□□□□ -0.61
CTSW-202ENST00000524681 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CTSW-202ENST00000524681 VWDEQ8N2E2 1590 aa11.21□□□□□ -0.61
CTSW-202ENST00000524681 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.21□□□□□ -0.61
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