RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524555.3

SAA2-SAA4-201, Transcript of SAA2-SAA4 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene SAA2-SAA4, Length 743 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 KIF14Q15058 1648 aa18.7■□□□□ 0.58
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.67■□□□□ 0.58
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CD109Q6YHK3 1445 aa18.66■□□□□ 0.58
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 KCNH8Q96L42 1107 aa18.66■□□□□ 0.58
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.64■□□□□ 0.57
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.63■□□□□ 0.57
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.58■□□□□ 0.57
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MYO5CQ9NQX4 1742 aa18.53■□□□□ 0.56
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP18.53■□□□□ 0.56
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ITGAEP38570 1179 aa18.52■□□□□ 0.56
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PREX2Q70Z35 1606 aa18.52■□□□□ 0.55
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.5■□□□□ 0.55
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ARAP3Q8WWN8 1544 aa18.49■□□□□ 0.55
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TTC37Q6PGP7 1564 aa18.49■□□□□ 0.55
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.48■□□□□ 0.55
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 HRCP23327 699 aa18.46■□□□□ 0.55
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ABCA9Q8IUA7 1624 aa18.45■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PLCH2O75038 1416 aa18.45■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.45■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.44■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.44■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.44■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DAPK1P53355 1430 aa18.43■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 AKNAQ7Z591 1439 aa18.43■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FBXO41Q8TF61 875 aa18.42■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.41■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ARHGEF5Q12774 1597 aa18.41■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ROCK1Q13464 1354 aa18.41■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 HFM1A2PYH4 1435 aa18.4■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PTPRKQ15262 1439 aa18.4■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ABCC5O15440 1437 aa18.4■□□□□ 0.54
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CROCC2H7BZ55 1655 aa18.39■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RAPGEF3O95398 923 aa18.39■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.39■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NEO1Q92859 1461 aa18.39■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.38■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PTPRMP28827 1452 aa18.38■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.37■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.37■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.37■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.37■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TSPY4P0CV99 314 aa18.35■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TSPY10P0CW01 314 aa18.35■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.34■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NAIPQ13075 1403 aa18.34■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ADGRL2O95490 1459 aa18.33■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MBD5Q9P267 1494 aa18.33■□□□□ 0.53
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ADAMTSL3P82987 1691 aa18.33■□□□□ 0.52
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CLSPNQ9HAW4 1339 aa18.32■□□□□ 0.52
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.32■□□□□ 0.52
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CFAP74Q9C0B2 1584 aa18.32■□□□□ 0.52
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.31■□□□□ 0.52
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.3■□□□□ 0.52
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ABCC1P33527 1531 aa18.3■□□□□ 0.52
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FANCAO15360 1455 aa18.3■□□□□ 0.52
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NCOA1Q15788 1441 aa18.29■□□□□ 0.52
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.29■□□□□ 0.52
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MAST1Q9Y2H9 1570 aa18.29■□□□□ 0.52
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.28■□□□□ 0.52
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.26■□□□□ 0.51
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 POGZQ7Z3K3 1410 aa18.25■□□□□ 0.51
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MADDQ8WXG6 1647 aa18.23■□□□□ 0.51
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.23■□□□□ 0.51
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa18.22■□□□□ 0.51
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.21■□□□□ 0.51
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PLXNC1O60486 1568 aa18.21■□□□□ 0.51
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.2■□□□□ 0.5
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.2■□□□□ 0.5
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.19■□□□□ 0.5
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 KIF15Q9NS87 1388 aa18.17■□□□□ 0.5
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.17■□□□□ 0.5
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.17■□□□□ 0.5
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.17■□□□□ 0.5
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 AFAP1Q8N556 730 aa18.16■□□□□ 0.5
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa18.15■□□□□ 0.5
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MAGI2Q86UL8 1455 aa18.15■□□□□ 0.5
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RICTORQ6R327 1708 aa18.15■□□□□ 0.5
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 HSPA2P54652 639 aa18.14■□□□□ 0.49
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa18.13■□□□□ 0.49
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DUOX2Q9NRD8 1548 aa18.13■□□□□ 0.49
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TRIM52Q96A61 297 aa18.13■□□□□ 0.49
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa18.13■□□□□ 0.49
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MLECQ14165 292 aa18.11■□□□□ 0.49
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms