RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522556.1

CLK4-211, Transcript of CDC like kinase 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLK4, Length 1,249 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4-211ENST00000522556 TIAM1Q13009 1591 aa28.5■■■□□ 2.15
CLK4-211ENST00000522556 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.5■■■□□ 2.15
CLK4-211ENST00000522556 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.5■■■□□ 2.15
CLK4-211ENST00000522556 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.47■■■□□ 2.15
CLK4-211ENST00000522556 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.44■■■□□ 2.14
CLK4-211ENST00000522556 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.44■■■□□ 2.14
CLK4-211ENST00000522556 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.44■■■□□ 2.14
CLK4-211ENST00000522556 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.43■■■□□ 2.14
CLK4-211ENST00000522556 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CLK4-211ENST00000522556 ABCC1P33527 1531 aa28.42■■■□□ 2.14
CLK4-211ENST00000522556 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.42■■■□□ 2.14
CLK4-211ENST00000522556 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.41■■■□□ 2.14
CLK4-211ENST00000522556 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.41■■■□□ 2.14
CLK4-211ENST00000522556 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.39■■■□□ 2.14
CLK4-211ENST00000522556 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.37■■■□□ 2.13
CLK4-211ENST00000522556 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.37■■■□□ 2.13
CLK4-211ENST00000522556 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CLK4-211ENST00000522556 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.34■■■□□ 2.13
CLK4-211ENST00000522556 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.34■■■□□ 2.13
CLK4-211ENST00000522556 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.34■■■□□ 2.13
CLK4-211ENST00000522556 NCOA2Q15596 1464 aa28.34■■■□□ 2.13
CLK4-211ENST00000522556 KDM5CP41229 1560 aa28.33■■■□□ 2.13
CLK4-211ENST00000522556 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.33■■■□□ 2.13
CLK4-211ENST00000522556 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CLK4-211ENST00000522556 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.32■■■□□ 2.12
CLK4-211ENST00000522556 MAP3K1Q13233 1512 aa28.31■■■□□ 2.12
CLK4-211ENST00000522556 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.3■■■□□ 2.12
CLK4-211ENST00000522556 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CLK4-211ENST00000522556 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CLK4-211ENST00000522556 AFAP1Q8N556 730 aa28.29■■■□□ 2.12
CLK4-211ENST00000522556 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.26■■■□□ 2.11
CLK4-211ENST00000522556 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.25■■■□□ 2.11
CLK4-211ENST00000522556 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CLK4-211ENST00000522556 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CLK4-211ENST00000522556 ABCA6Q8N139 1617 aa28.23■■■□□ 2.11
CLK4-211ENST00000522556 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.21■■■□□ 2.11
CLK4-211ENST00000522556 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.21■■■□□ 2.11
CLK4-211ENST00000522556 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.2■■■□□ 2.11
CLK4-211ENST00000522556 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.19■■■□□ 2.1
CLK4-211ENST00000522556 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
CLK4-211ENST00000522556 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.15■■■□□ 2.1
CLK4-211ENST00000522556 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.15■■■□□ 2.1
CLK4-211ENST00000522556 ATP10AO60312 1499 aa28.15■■■□□ 2.1
CLK4-211ENST00000522556 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.15■■■□□ 2.1
CLK4-211ENST00000522556 MADDQ8WXG6 1647 aa28.14■■■□□ 2.1
CLK4-211ENST00000522556 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
CLK4-211ENST00000522556 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.14■■■□□ 2.09
CLK4-211ENST00000522556 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.13■■■□□ 2.09
CLK4-211ENST00000522556 MBD5Q9P267 1494 aa28.13■■■□□ 2.09
CLK4-211ENST00000522556 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CLK4-211ENST00000522556 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.09■■■□□ 2.09
CLK4-211ENST00000522556 ATP7AQ04656 1500 aa28.08■■■□□ 2.09
CLK4-211ENST00000522556 APLP2Q06481 763 aa28.07■■■□□ 2.08
CLK4-211ENST00000522556 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.06■■■□□ 2.08
CLK4-211ENST00000522556 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CLK4-211ENST00000522556 REREQ9P2R6 1566 aa28.05■■■□□ 2.08
CLK4-211ENST00000522556 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CLK4-211ENST00000522556 MLECQ14165 292 aa28.02■■■□□ 2.08
CLK4-211ENST00000522556 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28■■■□□ 2.07
CLK4-211ENST00000522556 PTPRMP28827 1452 aa28■■■□□ 2.07
CLK4-211ENST00000522556 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28■■■□□ 2.07
CLK4-211ENST00000522556 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.98■■■□□ 2.07
CLK4-211ENST00000522556 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.97■■■□□ 2.07
CLK4-211ENST00000522556 MIA2Q96PC5 1412 aa27.96■■■□□ 2.07
CLK4-211ENST00000522556 PLXNC1O60486 1568 aa27.95■■■□□ 2.07
CLK4-211ENST00000522556 AGLP35573 1532 aa27.95■■■□□ 2.06
CLK4-211ENST00000522556 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.95■■■□□ 2.06
CLK4-211ENST00000522556 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.91■■■□□ 2.06
CLK4-211ENST00000522556 A2MP01023 1474 aa27.9■■■□□ 2.06
CLK4-211ENST00000522556 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.87■■■□□ 2.05
CLK4-211ENST00000522556 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CLK4-211ENST00000522556 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.86■■■□□ 2.05
CLK4-211ENST00000522556 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CLK4-211ENST00000522556 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.85■■■□□ 2.05
CLK4-211ENST00000522556 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.85■■■□□ 2.05
CLK4-211ENST00000522556 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CLK4-211ENST00000522556 ABCC5O15440 1437 aa27.8■■■□□ 2.04
CLK4-211ENST00000522556 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.79■■■□□ 2.04
CLK4-211ENST00000522556 C3P01024 1663 aa27.77■■■□□ 2.04
CLK4-211ENST00000522556 DAPK1P53355 1430 aa27.76■■■□□ 2.04
CLK4-211ENST00000522556 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
CLK4-211ENST00000522556 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
CLK4-211ENST00000522556 TSPY4P0CV99 314 aa27.74■■■□□ 2.03
CLK4-211ENST00000522556 TSPY10P0CW01 314 aa27.74■■■□□ 2.03
CLK4-211ENST00000522556 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
CLK4-211ENST00000522556 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.72■■■□□ 2.03
CLK4-211ENST00000522556 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.69■■■□□ 2.02
CLK4-211ENST00000522556 GGT6Q6P531 493 aa27.68■■■□□ 2.02
CLK4-211ENST00000522556 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CLK4-211ENST00000522556 MROH2AA6NES4 1674 aa27.67■■■□□ 2.02
CLK4-211ENST00000522556 KIF3BO15066 747 aa27.65■■■□□ 2.02
CLK4-211ENST00000522556 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.63■■■□□ 2.01
CLK4-211ENST00000522556 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.62■■■□□ 2.01
CLK4-211ENST00000522556 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
CLK4-211ENST00000522556 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
CLK4-211ENST00000522556 KIF15Q9NS87 1388 aa27.61■■■□□ 2.01
CLK4-211ENST00000522556 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.61■■■□□ 2.01
CLK4-211ENST00000522556 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.61■■■□□ 2.01
CLK4-211ENST00000522556 PTPRKQ15262 1439 aa27.6■■■□□ 2.01
CLK4-211ENST00000522556 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.6■■■□□ 2.01
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