RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.19■■□□□ 1.78
HACE1-211ENST00000521962 MAP3K1Q13233 1512 aa26.19■■□□□ 1.78
HACE1-211ENST00000521962 PREX2Q70Z35 1606 aa26.18■■□□□ 1.78
HACE1-211ENST00000521962 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.17■■□□□ 1.78
HACE1-211ENST00000521962 RAPGEF3O95398 923 aa26.15■■□□□ 1.78
HACE1-211ENST00000521962 AKNAQ7Z591 1439 aa26.14■■□□□ 1.78
HACE1-211ENST00000521962 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.14■■□□□ 1.78
HACE1-211ENST00000521962 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.14■■□□□ 1.78
HACE1-211ENST00000521962 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.14■■□□□ 1.78
HACE1-211ENST00000521962 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.13■■□□□ 1.77
HACE1-211ENST00000521962 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.13■■□□□ 1.77
HACE1-211ENST00000521962 MADDQ8WXG6 1647 aa26.12■■□□□ 1.77
HACE1-211ENST00000521962 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
HACE1-211ENST00000521962 RICTORQ6R327 1708 aa26.11■■□□□ 1.77
HACE1-211ENST00000521962 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
HACE1-211ENST00000521962 NCOA2Q15596 1464 aa26.07■■□□□ 1.76
HACE1-211ENST00000521962 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HACE1-211ENST00000521962 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
HACE1-211ENST00000521962 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.05■■□□□ 1.76
HACE1-211ENST00000521962 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.04■■□□□ 1.76
HACE1-211ENST00000521962 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.04■■□□□ 1.76
HACE1-211ENST00000521962 ABCC1P33527 1531 aa26.04■■□□□ 1.76
HACE1-211ENST00000521962 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.03■■□□□ 1.76
HACE1-211ENST00000521962 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.03■■□□□ 1.76
HACE1-211ENST00000521962 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.03■■□□□ 1.76
HACE1-211ENST00000521962 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.02■■□□□ 1.76
HACE1-211ENST00000521962 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26■■□□□ 1.75
HACE1-211ENST00000521962 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.99■■□□□ 1.75
HACE1-211ENST00000521962 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.98■■□□□ 1.75
HACE1-211ENST00000521962 FBXO41Q8TF61 875 aa25.98■■□□□ 1.75
HACE1-211ENST00000521962 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
HACE1-211ENST00000521962 KDM5CP41229 1560 aa25.94■■□□□ 1.74
HACE1-211ENST00000521962 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.93■■□□□ 1.74
HACE1-211ENST00000521962 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
HACE1-211ENST00000521962 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HACE1-211ENST00000521962 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.92■■□□□ 1.74
HACE1-211ENST00000521962 APLP2Q06481 763 aa25.92■■□□□ 1.74
HACE1-211ENST00000521962 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.91■■□□□ 1.74
HACE1-211ENST00000521962 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.91■■□□□ 1.74
HACE1-211ENST00000521962 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.9■■□□□ 1.74
HACE1-211ENST00000521962 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
HACE1-211ENST00000521962 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.89■■□□□ 1.73
HACE1-211ENST00000521962 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.88■■□□□ 1.73
HACE1-211ENST00000521962 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
HACE1-211ENST00000521962 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.86■■□□□ 1.73
HACE1-211ENST00000521962 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.86■■□□□ 1.73
HACE1-211ENST00000521962 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.85■■□□□ 1.73
HACE1-211ENST00000521962 AFAP1Q8N556 730 aa25.85■■□□□ 1.73
HACE1-211ENST00000521962 MBD5Q9P267 1494 aa25.83■■□□□ 1.73
HACE1-211ENST00000521962 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.8■■□□□ 1.72
HACE1-211ENST00000521962 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.8■■□□□ 1.72
HACE1-211ENST00000521962 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
HACE1-211ENST00000521962 MIA2Q96PC5 1412 aa25.8■■□□□ 1.72
HACE1-211ENST00000521962 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.78■■□□□ 1.72
HACE1-211ENST00000521962 ABCA6Q8N139 1617 aa25.77■■□□□ 1.72
HACE1-211ENST00000521962 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
HACE1-211ENST00000521962 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.76■■□□□ 1.71
HACE1-211ENST00000521962 HSPA2P54652 639 aa25.74■■□□□ 1.71
HACE1-211ENST00000521962 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.73■■□□□ 1.71
HACE1-211ENST00000521962 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.73■■□□□ 1.71
HACE1-211ENST00000521962 ATP7AQ04656 1500 aa25.72■■□□□ 1.71
HACE1-211ENST00000521962 ATP10AO60312 1499 aa25.72■■□□□ 1.71
HACE1-211ENST00000521962 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.72■■□□□ 1.71
HACE1-211ENST00000521962 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.71■■□□□ 1.71
HACE1-211ENST00000521962 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.7■■□□□ 1.71
HACE1-211ENST00000521962 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
HACE1-211ENST00000521962 REREQ9P2R6 1566 aa25.68■■□□□ 1.7
HACE1-211ENST00000521962 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
HACE1-211ENST00000521962 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.67■■□□□ 1.7
HACE1-211ENST00000521962 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
HACE1-211ENST00000521962 MLECQ14165 292 aa25.63■■□□□ 1.69
HACE1-211ENST00000521962 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.62■■□□□ 1.69
HACE1-211ENST00000521962 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.61■■□□□ 1.69
HACE1-211ENST00000521962 PLXNC1O60486 1568 aa25.61■■□□□ 1.69
HACE1-211ENST00000521962 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.6■■□□□ 1.69
HACE1-211ENST00000521962 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.6■■□□□ 1.69
HACE1-211ENST00000521962 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.58■■□□□ 1.69
HACE1-211ENST00000521962 AGLP35573 1532 aa25.58■■□□□ 1.69
HACE1-211ENST00000521962 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
HACE1-211ENST00000521962 ABCC5O15440 1437 aa25.57■■□□□ 1.68
HACE1-211ENST00000521962 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.57■■□□□ 1.68
HACE1-211ENST00000521962 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.57■■□□□ 1.68
HACE1-211ENST00000521962 STRCQ7RTU9 1775 aa25.55■■□□□ 1.68
HACE1-211ENST00000521962 CERKQ8TCT0 537 aa25.55■■□□□ 1.68
HACE1-211ENST00000521962 DAPK1P53355 1430 aa25.54■■□□□ 1.68
HACE1-211ENST00000521962 A2MP01023 1474 aa25.54■■□□□ 1.68
HACE1-211ENST00000521962 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.54■■□□□ 1.68
HACE1-211ENST00000521962 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HACE1-211ENST00000521962 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
HACE1-211ENST00000521962 C3P01024 1663 aa25.48■■□□□ 1.67
HACE1-211ENST00000521962 TSPY4P0CV99 314 aa25.47■■□□□ 1.67
HACE1-211ENST00000521962 TSPY10P0CW01 314 aa25.47■■□□□ 1.67
HACE1-211ENST00000521962 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.46■■□□□ 1.67
HACE1-211ENST00000521962 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
HACE1-211ENST00000521962 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
HACE1-211ENST00000521962 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
HACE1-211ENST00000521962 PTPRKQ15262 1439 aa25.42■■□□□ 1.66
HACE1-211ENST00000521962 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
HACE1-211ENST00000521962 ADGRL2O95490 1459 aa25.4■■□□□ 1.66
HACE1-211ENST00000521962 KIF15Q9NS87 1388 aa25.38■■□□□ 1.65
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