RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521404.5

MEG3-217, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 1,426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-217ENST00000521404 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.28■■□□□ 1.64
MEG3-217ENST00000521404 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.26■■□□□ 1.63
MEG3-217ENST00000521404 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.25■■□□□ 1.63
MEG3-217ENST00000521404 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.22■■□□□ 1.63
MEG3-217ENST00000521404 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.19■■□□□ 1.62
MEG3-217ENST00000521404 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
MEG3-217ENST00000521404 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.17■■□□□ 1.62
MEG3-217ENST00000521404 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.16■■□□□ 1.62
MEG3-217ENST00000521404 PREX2Q70Z35 1606 aa25.15■■□□□ 1.62
MEG3-217ENST00000521404 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.15■■□□□ 1.62
MEG3-217ENST00000521404 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.13■■□□□ 1.61
MEG3-217ENST00000521404 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.13■■□□□ 1.61
MEG3-217ENST00000521404 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.11■■□□□ 1.61
MEG3-217ENST00000521404 ATP10AO60312 1499 aa25.1■■□□□ 1.61
MEG3-217ENST00000521404 KDM5CP41229 1560 aa25.1■■□□□ 1.61
MEG3-217ENST00000521404 AFAP1Q8N556 730 aa25.09■■□□□ 1.61
MEG3-217ENST00000521404 PTPRMP28827 1452 aa25.08■■□□□ 1.61
MEG3-217ENST00000521404 ABCC1P33527 1531 aa25.07■■□□□ 1.6
MEG3-217ENST00000521404 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
MEG3-217ENST00000521404 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.07■■□□□ 1.6
MEG3-217ENST00000521404 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.06■■□□□ 1.6
MEG3-217ENST00000521404 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.05■■□□□ 1.6
MEG3-217ENST00000521404 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.04■■□□□ 1.6
MEG3-217ENST00000521404 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.02■■□□□ 1.6
MEG3-217ENST00000521404 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.02■■□□□ 1.6
MEG3-217ENST00000521404 MADDQ8WXG6 1647 aa25.02■■□□□ 1.6
MEG3-217ENST00000521404 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.02■■□□□ 1.6
MEG3-217ENST00000521404 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.01■■□□□ 1.59
MEG3-217ENST00000521404 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
MEG3-217ENST00000521404 MYT1LQ9UL68 1186 aa25■■□□□ 1.59
MEG3-217ENST00000521404 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25■■□□□ 1.59
MEG3-217ENST00000521404 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25■■□□□ 1.59
MEG3-217ENST00000521404 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.99■■□□□ 1.59
MEG3-217ENST00000521404 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.99■■□□□ 1.59
MEG3-217ENST00000521404 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
MEG3-217ENST00000521404 REREQ9P2R6 1566 aa24.97■■□□□ 1.59
MEG3-217ENST00000521404 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.97■■□□□ 1.59
MEG3-217ENST00000521404 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.97■■□□□ 1.59
MEG3-217ENST00000521404 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.95■■□□□ 1.58
MEG3-217ENST00000521404 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
MEG3-217ENST00000521404 APLP2Q06481 763 aa24.92■■□□□ 1.58
MEG3-217ENST00000521404 MLECQ14165 292 aa24.92■■□□□ 1.58
MEG3-217ENST00000521404 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.92■■□□□ 1.58
MEG3-217ENST00000521404 TIAM1Q13009 1591 aa24.9■■□□□ 1.58
MEG3-217ENST00000521404 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
MEG3-217ENST00000521404 AGLP35573 1532 aa24.9■■□□□ 1.58
MEG3-217ENST00000521404 ABCA6Q8N139 1617 aa24.89■■□□□ 1.58
MEG3-217ENST00000521404 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
MEG3-217ENST00000521404 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.87■■□□□ 1.57
MEG3-217ENST00000521404 MAP3K1Q13233 1512 aa24.87■■□□□ 1.57
MEG3-217ENST00000521404 NCOA2Q15596 1464 aa24.86■■□□□ 1.57
MEG3-217ENST00000521404 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.85■■□□□ 1.57
MEG3-217ENST00000521404 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
MEG3-217ENST00000521404 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.83■■□□□ 1.56
MEG3-217ENST00000521404 ATP7AQ04656 1500 aa24.81■■□□□ 1.56
MEG3-217ENST00000521404 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
MEG3-217ENST00000521404 MBD5Q9P267 1494 aa24.8■■□□□ 1.56
MEG3-217ENST00000521404 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.8■■□□□ 1.56
MEG3-217ENST00000521404 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.79■■□□□ 1.56
MEG3-217ENST00000521404 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
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MEG3-217ENST00000521404 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.74■■□□□ 1.55
MEG3-217ENST00000521404 A2MP01023 1474 aa24.73■■□□□ 1.55
MEG3-217ENST00000521404 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.72■■□□□ 1.55
MEG3-217ENST00000521404 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
MEG3-217ENST00000521404 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.71■■□□□ 1.55
MEG3-217ENST00000521404 PLXNC1O60486 1568 aa24.71■■□□□ 1.55
MEG3-217ENST00000521404 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
MEG3-217ENST00000521404 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.68■■□□□ 1.54
MEG3-217ENST00000521404 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.68■■□□□ 1.54
MEG3-217ENST00000521404 MIA2Q96PC5 1412 aa24.67■■□□□ 1.54
MEG3-217ENST00000521404 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.66■■□□□ 1.54
MEG3-217ENST00000521404 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.65■■□□□ 1.54
MEG3-217ENST00000521404 TSPY4P0CV99 314 aa24.64■■□□□ 1.54
MEG3-217ENST00000521404 TSPY10P0CW01 314 aa24.64■■□□□ 1.54
MEG3-217ENST00000521404 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
MEG3-217ENST00000521404 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.63■■□□□ 1.53
MEG3-217ENST00000521404 HSPA2P54652 639 aa24.62■■□□□ 1.53
MEG3-217ENST00000521404 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
MEG3-217ENST00000521404 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.61■■□□□ 1.53
MEG3-217ENST00000521404 C3P01024 1663 aa24.61■■□□□ 1.53
MEG3-217ENST00000521404 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
MEG3-217ENST00000521404 MROH2AA6NES4 1674 aa24.6■■□□□ 1.53
MEG3-217ENST00000521404 ZMYM3Q14202 1370 aa24.58■■□□□ 1.53
MEG3-217ENST00000521404 GGT6Q6P531 493 aa24.58■■□□□ 1.53
MEG3-217ENST00000521404 NPATQ14207 1427 aa24.58■■□□□ 1.52
MEG3-217ENST00000521404 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.53■■□□□ 1.52
MEG3-217ENST00000521404 KIF3BO15066 747 aa24.52■■□□□ 1.52
MEG3-217ENST00000521404 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.51■■□□□ 1.51
MEG3-217ENST00000521404 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
MEG3-217ENST00000521404 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.49■■□□□ 1.51
MEG3-217ENST00000521404 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
MEG3-217ENST00000521404 PTPRKQ15262 1439 aa24.46■■□□□ 1.51
MEG3-217ENST00000521404 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.45■■□□□ 1.5
MEG3-217ENST00000521404 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.43■■□□□ 1.5
MEG3-217ENST00000521404 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.43■■□□□ 1.5
MEG3-217ENST00000521404 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
MEG3-217ENST00000521404 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.42■■□□□ 1.5
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