RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520574.1

SORBS3-210, Transcript of sorbin and SH3 domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SORBS3, Length 699 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3-210ENST00000520574 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.36■■■■□ 3.57
SORBS3-210ENST00000520574 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.32■■■■□ 3.57
SORBS3-210ENST00000520574 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.32■■■■□ 3.57
SORBS3-210ENST00000520574 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.31■■■■□ 3.56
SORBS3-210ENST00000520574 PREX2Q70Z35 1606 aa37.25■■■■□ 3.55
SORBS3-210ENST00000520574 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.24■■■■□ 3.55
SORBS3-210ENST00000520574 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.24■■■■□ 3.55
SORBS3-210ENST00000520574 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.22■■■■□ 3.55
SORBS3-210ENST00000520574 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.21■■■■□ 3.55
SORBS3-210ENST00000520574 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.2■■■■□ 3.55
SORBS3-210ENST00000520574 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
SORBS3-210ENST00000520574 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.17■■■■□ 3.54
SORBS3-210ENST00000520574 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.17■■■■□ 3.54
SORBS3-210ENST00000520574 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
SORBS3-210ENST00000520574 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.14■■■■□ 3.54
SORBS3-210ENST00000520574 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
SORBS3-210ENST00000520574 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.1■■■■□ 3.53
SORBS3-210ENST00000520574 AFAP1Q8N556 730 aa37.1■■■■□ 3.53
SORBS3-210ENST00000520574 KDM5CP41229 1560 aa37.09■■■■□ 3.53
SORBS3-210ENST00000520574 ABCC1P33527 1531 aa37.09■■■■□ 3.53
SORBS3-210ENST00000520574 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.09■■■■□ 3.53
SORBS3-210ENST00000520574 ATP10AO60312 1499 aa37.08■■■■□ 3.53
SORBS3-210ENST00000520574 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.05■■■■□ 3.52
SORBS3-210ENST00000520574 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.05■■■■□ 3.52
SORBS3-210ENST00000520574 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
SORBS3-210ENST00000520574 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.05■■■■□ 3.52
SORBS3-210ENST00000520574 MAP3K1Q13233 1512 aa37.04■■■■□ 3.52
SORBS3-210ENST00000520574 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.03■■■■□ 3.52
SORBS3-210ENST00000520574 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.03■■■■□ 3.52
SORBS3-210ENST00000520574 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.02■■■■□ 3.52
SORBS3-210ENST00000520574 TIAM1Q13009 1591 aa37.02■■■■□ 3.52
SORBS3-210ENST00000520574 HECW2Q9P2P5 1572 aa37■■■■□ 3.51
SORBS3-210ENST00000520574 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.99■■■■□ 3.51
SORBS3-210ENST00000520574 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.98■■■■□ 3.51
SORBS3-210ENST00000520574 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.98■■■■□ 3.51
SORBS3-210ENST00000520574 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
SORBS3-210ENST00000520574 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.95■■■■□ 3.51
SORBS3-210ENST00000520574 APLP2Q06481 763 aa36.94■■■■□ 3.5
SORBS3-210ENST00000520574 PTPRMP28827 1452 aa36.91■■■■□ 3.5
SORBS3-210ENST00000520574 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.91■■■■□ 3.5
SORBS3-210ENST00000520574 REREQ9P2R6 1566 aa36.91■■■■□ 3.5
SORBS3-210ENST00000520574 NCOA2Q15596 1464 aa36.9■■■■□ 3.5
SORBS3-210ENST00000520574 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.9■■■■□ 3.5
SORBS3-210ENST00000520574 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
SORBS3-210ENST00000520574 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.88■■■■□ 3.49
SORBS3-210ENST00000520574 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.88■■■■□ 3.49
SORBS3-210ENST00000520574 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
SORBS3-210ENST00000520574 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.84■■■■□ 3.49
SORBS3-210ENST00000520574 MADDQ8WXG6 1647 aa36.83■■■■□ 3.49
SORBS3-210ENST00000520574 AGLP35573 1532 aa36.8■■■■□ 3.48
SORBS3-210ENST00000520574 MLECQ14165 292 aa36.79■■■■□ 3.48
SORBS3-210ENST00000520574 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.78■■■■□ 3.48
SORBS3-210ENST00000520574 ABCA6Q8N139 1617 aa36.77■■■■□ 3.48
SORBS3-210ENST00000520574 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.75■■■■□ 3.47
SORBS3-210ENST00000520574 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
SORBS3-210ENST00000520574 MBD5Q9P267 1494 aa36.74■■■■□ 3.47
SORBS3-210ENST00000520574 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.72■■■■□ 3.47
SORBS3-210ENST00000520574 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
SORBS3-210ENST00000520574 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
SORBS3-210ENST00000520574 ATP7AQ04656 1500 aa36.71■■■■□ 3.47
SORBS3-210ENST00000520574 MIA2Q96PC5 1412 aa36.68■■■■□ 3.46
SORBS3-210ENST00000520574 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
SORBS3-210ENST00000520574 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.67■■■■□ 3.46
SORBS3-210ENST00000520574 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.67■■■■□ 3.46
SORBS3-210ENST00000520574 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
SORBS3-210ENST00000520574 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.64■■■■□ 3.46
SORBS3-210ENST00000520574 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.62■■■■□ 3.45
SORBS3-210ENST00000520574 TSPY4P0CV99 314 aa36.62■■■■□ 3.45
SORBS3-210ENST00000520574 TSPY10P0CW01 314 aa36.62■■■■□ 3.45
SORBS3-210ENST00000520574 A2MP01023 1474 aa36.61■■■■□ 3.45
SORBS3-210ENST00000520574 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.59■■■■□ 3.45
SORBS3-210ENST00000520574 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.58■■■■□ 3.45
SORBS3-210ENST00000520574 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.57■■■■□ 3.44
SORBS3-210ENST00000520574 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.55■■■■□ 3.44
SORBS3-210ENST00000520574 PLXNC1O60486 1568 aa36.52■■■■□ 3.44
SORBS3-210ENST00000520574 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
SORBS3-210ENST00000520574 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.46■■■■□ 3.43
SORBS3-210ENST00000520574 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
SORBS3-210ENST00000520574 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.43■■■■□ 3.42
SORBS3-210ENST00000520574 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
SORBS3-210ENST00000520574 GGT6Q6P531 493 aa36.39■■■■□ 3.42
SORBS3-210ENST00000520574 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.39■■■■□ 3.42
SORBS3-210ENST00000520574 MROH2AA6NES4 1674 aa36.35■■■■□ 3.41
SORBS3-210ENST00000520574 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.34■■■■□ 3.41
SORBS3-210ENST00000520574 ZMYM3Q14202 1370 aa36.33■■■■□ 3.41
SORBS3-210ENST00000520574 KIF3BO15066 747 aa36.32■■■■□ 3.4
SORBS3-210ENST00000520574 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.32■■■■□ 3.4
SORBS3-210ENST00000520574 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.31■■■■□ 3.4
SORBS3-210ENST00000520574 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
SORBS3-210ENST00000520574 C3P01024 1663 aa36.3■■■■□ 3.4
SORBS3-210ENST00000520574 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.3■■■■□ 3.4
SORBS3-210ENST00000520574 NPATQ14207 1427 aa36.3■■■■□ 3.4
SORBS3-210ENST00000520574 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.3■■■■□ 3.4
SORBS3-210ENST00000520574 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.27■■■■□ 3.4
SORBS3-210ENST00000520574 ABCC5O15440 1437 aa36.22■■■■□ 3.39
SORBS3-210ENST00000520574 DAPK1P53355 1430 aa36.19■■■■□ 3.38
SORBS3-210ENST00000520574 HSPA2P54652 639 aa36.19■■■■□ 3.38
SORBS3-210ENST00000520574 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
SORBS3-210ENST00000520574 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.18■■■■□ 3.38
SORBS3-210ENST00000520574 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.17■■■■□ 3.38
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