RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519767.5

VEGFA-220, Transcript of vascular endothelial growth factor A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VEGFA, Length 970 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFA-220ENST00000519767 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
VEGFA-220ENST00000519767 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.9■■■■■ 4.14
VEGFA-220ENST00000519767 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.9■■■■■ 4.14
VEGFA-220ENST00000519767 PTPRMP28827 1452 aa40.9■■■■■ 4.14
VEGFA-220ENST00000519767 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.89■■■■■ 4.14
VEGFA-220ENST00000519767 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.87■■■■■ 4.13
VEGFA-220ENST00000519767 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.87■■■■■ 4.13
VEGFA-220ENST00000519767 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.87■■■■■ 4.13
VEGFA-220ENST00000519767 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.86■■■■■ 4.13
VEGFA-220ENST00000519767 AFAP1Q8N556 730 aa40.79■■■■■ 4.12
VEGFA-220ENST00000519767 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.78■■■■■ 4.12
VEGFA-220ENST00000519767 ATP10AO60312 1499 aa40.77■■■■■ 4.12
VEGFA-220ENST00000519767 MADDQ8WXG6 1647 aa40.72■■■■■ 4.11
VEGFA-220ENST00000519767 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.7■■■■■ 4.11
VEGFA-220ENST00000519767 MLECQ14165 292 aa40.68■■■■■ 4.1
VEGFA-220ENST00000519767 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.67■■■■■ 4.1
VEGFA-220ENST00000519767 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.67■■■■■ 4.1
VEGFA-220ENST00000519767 PREX2Q70Z35 1606 aa40.64■■■■■ 4.1
VEGFA-220ENST00000519767 KDM5CP41229 1560 aa40.63■■■■■ 4.09
VEGFA-220ENST00000519767 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.59■■■■■ 4.09
VEGFA-220ENST00000519767 CEP162Q5TB80 1403 aa40.59■■■■■ 4.09
VEGFA-220ENST00000519767 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
VEGFA-220ENST00000519767 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.57■■■■■ 4.08
VEGFA-220ENST00000519767 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.57■■■■■ 4.08
VEGFA-220ENST00000519767 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.56■■■■■ 4.08
VEGFA-220ENST00000519767 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.56■■■■■ 4.08
VEGFA-220ENST00000519767 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
VEGFA-220ENST00000519767 ABCC1P33527 1531 aa40.55■■■■■ 4.08
VEGFA-220ENST00000519767 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
VEGFA-220ENST00000519767 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
VEGFA-220ENST00000519767 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.51■■■■■ 4.08
VEGFA-220ENST00000519767 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.5■■■■■ 4.07
VEGFA-220ENST00000519767 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.49■■■■■ 4.07
VEGFA-220ENST00000519767 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.061e-12■■■■■ 34.3
VEGFA-220ENST00000519767 REREQ9P2R6 1566 aa40.43■■■■■ 4.06
VEGFA-220ENST00000519767 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.43■■■■■ 4.06
VEGFA-220ENST00000519767 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.42■■■■■ 4.06
VEGFA-220ENST00000519767 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.42■■■■■ 4.06
VEGFA-220ENST00000519767 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.42■■■■■ 4.06
VEGFA-220ENST00000519767 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.41■■■■■ 4.06
VEGFA-220ENST00000519767 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.4■■■■■ 4.06
VEGFA-220ENST00000519767 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
VEGFA-220ENST00000519767 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.38■■■■■ 4.06
VEGFA-220ENST00000519767 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.36■■■■■ 4.05
VEGFA-220ENST00000519767 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
VEGFA-220ENST00000519767 AGLP35573 1532 aa40.35■■■■■ 4.05
VEGFA-220ENST00000519767 ABCA6Q8N139 1617 aa40.34■■■■■ 4.05
VEGFA-220ENST00000519767 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
VEGFA-220ENST00000519767 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.32■■■■■ 4.04
VEGFA-220ENST00000519767 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.32■■■■■ 4.04
VEGFA-220ENST00000519767 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
VEGFA-220ENST00000519767 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.29■■■■■ 4.04
VEGFA-220ENST00000519767 HSPA2P54652 639 aa40.28■■■■■ 4.04
VEGFA-220ENST00000519767 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
VEGFA-220ENST00000519767 TIAM1Q13009 1591 aa40.18■■■■■ 4.02
VEGFA-220ENST00000519767 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.17■■■■■ 4.02
VEGFA-220ENST00000519767 ATP7AQ04656 1500 aa40.15■■■■■ 4.02
VEGFA-220ENST00000519767 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.15■■■■■ 4.02
VEGFA-220ENST00000519767 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.13■■■■■ 4.01
VEGFA-220ENST00000519767 NCOA2Q15596 1464 aa40.12■■■■■ 4.01
VEGFA-220ENST00000519767 MBD5Q9P267 1494 aa40.12■■■■■ 4.01
VEGFA-220ENST00000519767 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
VEGFA-220ENST00000519767 A2MP01023 1474 aa40.08■■■■■ 4.01
VEGFA-220ENST00000519767 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
VEGFA-220ENST00000519767 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
VEGFA-220ENST00000519767 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.06■■■■■ 4
VEGFA-220ENST00000519767 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.06■■■■■ 4
VEGFA-220ENST00000519767 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.05■■■■■ 4
VEGFA-220ENST00000519767 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.04■■■■■ 4
VEGFA-220ENST00000519767 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40■■■■□ 3.99
VEGFA-220ENST00000519767 FBXO41Q8TF61 875 aa40■■■■□ 3.99
VEGFA-220ENST00000519767 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.99■■■■□ 3.99
VEGFA-220ENST00000519767 ZMYM3Q14202 1370 aa39.98■■■■□ 3.99
VEGFA-220ENST00000519767 MAP3K1Q13233 1512 aa39.98■■■■□ 3.99
VEGFA-220ENST00000519767 GGT6Q6P531 493 aa39.98■■■■□ 3.99
VEGFA-220ENST00000519767 PLXNC1O60486 1568 aa39.97■■■■□ 3.99
VEGFA-220ENST00000519767 C3P01024 1663 aa39.97■■■■□ 3.99
VEGFA-220ENST00000519767 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
VEGFA-220ENST00000519767 TSPY4P0CV99 314 aa39.93■■■■□ 3.98
VEGFA-220ENST00000519767 TSPY10P0CW01 314 aa39.93■■■■□ 3.98
VEGFA-220ENST00000519767 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.93■■■■□ 3.98
VEGFA-220ENST00000519767 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.93■■■■□ 3.98
VEGFA-220ENST00000519767 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
VEGFA-220ENST00000519767 NPATQ14207 1427 aa39.91■■■■□ 3.98
VEGFA-220ENST00000519767 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.9■■■■□ 3.98
VEGFA-220ENST00000519767 APLP2Q06481 763 aa39.87■■■■□ 3.97
VEGFA-220ENST00000519767 MROH2AA6NES4 1674 aa39.86■■■■□ 3.97
VEGFA-220ENST00000519767 KIF3BO15066 747 aa39.8■■■■□ 3.96
VEGFA-220ENST00000519767 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.79■■■■□ 3.96
VEGFA-220ENST00000519767 MIA2Q96PC5 1412 aa39.78■■■■□ 3.96
VEGFA-220ENST00000519767 CERKQ8TCT0 537 aa39.76■■■■□ 3.96
VEGFA-220ENST00000519767 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.74■■■■□ 3.95
VEGFA-220ENST00000519767 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
VEGFA-220ENST00000519767 PTPRKQ15262 1439 aa39.73■■■■□ 3.95
VEGFA-220ENST00000519767 STRCQ7RTU9 1775 aa39.71■■■■□ 3.95
VEGFA-220ENST00000519767 PTPRTO14522 1441 aa39.7■■■■□ 3.95
VEGFA-220ENST00000519767 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa39.66■■■■□ 3.94
VEGFA-220ENST00000519767 NCOA1Q15788 1441 aa39.64■■■■□ 3.94
VEGFA-220ENST00000519767 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.6■■■■□ 3.93
VEGFA-220ENST00000519767 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.58■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms