RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518848.5

HOXA-AS3-201, HOXA cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXA-AS3, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
HOXA-AS3-201ENST00000518848 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CLIP1P30622 1438 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KIF14Q15058 1648 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ATP10AO60312 1499 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.98■■■□□ 2.07
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.97■■■□□ 2.07
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.95■■■□□ 2.07
HOXA-AS3-201ENST00000518848 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.91■■■□□ 2.06
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KDM5CP41229 1560 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AFAP1Q8N556 730 aa27.88■■■□□ 2.05
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MLECQ14165 292 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FBXO41Q8TF61 875 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.83■■■□□ 2.05
HOXA-AS3-201ENST00000518848 REREQ9P2R6 1566 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PREX2Q70Z35 1606 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HSPA2P54652 639 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ABCC1P33527 1531 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AGLP35573 1532 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.7■■■□□ 2.02
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ABCA6Q8N139 1617 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
HOXA-AS3-201ENST00000518848 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXA-AS3-201ENST00000518848 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.56■■■□□ 2
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.55■■■□□ 2
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CERKQ8TCT0 537 aa27.54■■■□□ 2
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.54■■■□□ 2
HOXA-AS3-201ENST00000518848 C3P01024 1663 aa27.52■■■□□ 2
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ATP7AQ04656 1500 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NPATQ14207 1427 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXA-AS3-201ENST00000518848 STRCQ7RTU9 1775 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MROH2AA6NES4 1674 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXA-AS3-201ENST00000518848 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PTPRTO14522 1441 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CEP162Q5TB80 1403 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXA-AS3-201ENST00000518848 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZMYM3Q14202 1370 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXA-AS3-201ENST00000518848 A2MP01023 1474 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PLXNC1O60486 1568 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.39■■□□□ 1.97
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TIAM1Q13009 1591 aa27.39■■□□□ 1.97
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MBD5Q9P267 1494 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NCOA1Q15788 1441 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXA-AS3-201ENST00000518848 GGT6Q6P531 493 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PTPRKQ15262 1439 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NCOA2Q15596 1464 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PLA2R1Q13018 1463 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXA-AS3-201ENST00000518848 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PKD2Q13563 968 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.2■■□□□ 1.95
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXA-AS3-201ENST00000518848 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TSPY4P0CV99 314 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TSPY10P0CW01 314 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KIF3BO15066 747 aa27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms