RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518088.5

HOXA-AS2-205, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXA-AS2, Length 509 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-205ENST00000518088 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXA-AS2-205ENST00000518088 KIF14Q15058 1648 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXA-AS2-205ENST00000518088 YEATS2Q9ULM3 1422 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CLIP1P30622 1438 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXA-AS2-205ENST00000518088 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
HOXA-AS2-205ENST00000518088 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXA-AS2-205ENST00000518088 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXA-AS2-205ENST00000518088 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXA-AS2-205ENST00000518088 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.61■□□□□ 0.57
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ATP10AO60312 1499 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXA-AS2-205ENST00000518088 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa18.6■□□□□ 0.57
HOXA-AS2-205ENST00000518088 KDM5CP41229 1560 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PREX2Q70Z35 1606 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXA-AS2-205ENST00000518088 MLECQ14165 292 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.54■□□□□ 0.56
HOXA-AS2-205ENST00000518088 FBXO41Q8TF61 875 aa18.53■□□□□ 0.56
HOXA-AS2-205ENST00000518088 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXA-AS2-205ENST00000518088 REREQ9P2R6 1566 aa18.52■□□□□ 0.56
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ABCC1P33527 1531 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXA-AS2-205ENST00000518088 AFAP1Q8N556 730 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXA-AS2-205ENST00000518088 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXA-AS2-205ENST00000518088 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.5■□□□□ 0.55
HOXA-AS2-205ENST00000518088 HSPA2P54652 639 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXA-AS2-205ENST00000518088 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ABCA6Q8N139 1617 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXA-AS2-205ENST00000518088 AGLP35573 1532 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXA-AS2-205ENST00000518088 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXA-AS2-205ENST00000518088 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa18.4■□□□□ 0.54
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
HOXA-AS2-205ENST00000518088 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.39■□□□□ 0.53
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.38■□□□□ 0.53
HOXA-AS2-205ENST00000518088 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXA-AS2-205ENST00000518088 C3P01024 1663 aa18.36■□□□□ 0.53
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
HOXA-AS2-205ENST00000518088 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.33■□□□□ 0.53
HOXA-AS2-205ENST00000518088 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXA-AS2-205ENST00000518088 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CERKQ8TCT0 537 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ATP7AQ04656 1500 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXA-AS2-205ENST00000518088 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXA-AS2-205ENST00000518088 STRCQ7RTU9 1775 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXA-AS2-205ENST00000518088 MROH2AA6NES4 1674 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PLXNC1O60486 1568 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXA-AS2-205ENST00000518088 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXA-AS2-205ENST00000518088 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.52
HOXA-AS2-205ENST00000518088 NPATQ14207 1427 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXA-AS2-205ENST00000518088 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HOXA-AS2-205ENST00000518088 A2MP01023 1474 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXA-AS2-205ENST00000518088 TIAM1Q13009 1591 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PTPRTO14522 1441 aa18.24■□□□□ 0.51
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CEP162Q5TB80 1403 aa18.23■□□□□ 0.51
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.22■□□□□ 0.51
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ZMYM3Q14202 1370 aa18.21■□□□□ 0.51
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
HOXA-AS2-205ENST00000518088 NCOA1Q15788 1441 aa18.2■□□□□ 0.5
HOXA-AS2-205ENST00000518088 MBD5Q9P267 1494 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXA-AS2-205ENST00000518088 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.18■□□□□ 0.5
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
HOXA-AS2-205ENST00000518088 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXA-AS2-205ENST00000518088 GGT6Q6P531 493 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PTPRKQ15262 1439 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PLA2R1Q13018 1463 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXA-AS2-205ENST00000518088 NCOA2Q15596 1464 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXA-AS2-205ENST00000518088 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
HOXA-AS2-205ENST00000518088 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXA-AS2-205ENST00000518088 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
HOXA-AS2-205ENST00000518088 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXA-AS2-205ENST00000518088 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXA-AS2-205ENST00000518088 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXA-AS2-205ENST00000518088 PKD2Q13563 968 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXA-AS2-205ENST00000518088 ARHGEF5Q12774 1597 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXA-AS2-205ENST00000518088 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
HOXA-AS2-205ENST00000518088 KDM5DQ9BY66 1539 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXA-AS2-205ENST00000518088 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXA-AS2-205ENST00000518088 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXA-AS2-205ENST00000518088 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms