RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517979.1

CCDC25-202, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC25, Length 877 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25-202ENST00000517979 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC25-202ENST00000517979 RAPGEF3O95398 923 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC25-202ENST00000517979 KIF14Q15058 1648 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC25-202ENST00000517979 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC25-202ENST00000517979 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC25-202ENST00000517979 AKNAQ7Z591 1439 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC25-202ENST00000517979 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC25-202ENST00000517979 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CCDC25-202ENST00000517979 PLCH2O75038 1416 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC25-202ENST00000517979 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC25-202ENST00000517979 RICTORQ6R327 1708 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC25-202ENST00000517979 CEP162Q5TB80 1403 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC25-202ENST00000517979 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC25-202ENST00000517979 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC25-202ENST00000517979 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC25-202ENST00000517979 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.04■■□□□ 1.12
CCDC25-202ENST00000517979 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.02■■□□□ 1.12
CCDC25-202ENST00000517979 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.02■■□□□ 1.12
CCDC25-202ENST00000517979 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.99■■□□□ 1.11
CCDC25-202ENST00000517979 PREX2Q70Z35 1606 aa21.98■■□□□ 1.11
CCDC25-202ENST00000517979 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CCDC25-202ENST00000517979 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.97■■□□□ 1.11
CCDC25-202ENST00000517979 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.97■■□□□ 1.11
CCDC25-202ENST00000517979 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.96■■□□□ 1.11
CCDC25-202ENST00000517979 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.95■■□□□ 1.1
CCDC25-202ENST00000517979 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.93■■□□□ 1.1
CCDC25-202ENST00000517979 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.93■■□□□ 1.1
CCDC25-202ENST00000517979 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.93■■□□□ 1.1
CCDC25-202ENST00000517979 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.92■■□□□ 1.1
CCDC25-202ENST00000517979 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.91■■□□□ 1.1
CCDC25-202ENST00000517979 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CCDC25-202ENST00000517979 ABCC1P33527 1531 aa21.9■■□□□ 1.1
CCDC25-202ENST00000517979 KDM5CP41229 1560 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 AFAP1Q8N556 730 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 MADDQ8WXG6 1647 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 ATP10AO60312 1499 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 PTPRMP28827 1452 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC25-202ENST00000517979 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC25-202ENST00000517979 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC25-202ENST00000517979 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CCDC25-202ENST00000517979 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CCDC25-202ENST00000517979 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.8■■□□□ 1.08
CCDC25-202ENST00000517979 TIAM1Q13009 1591 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC25-202ENST00000517979 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC25-202ENST00000517979 MLECQ14165 292 aa21.79■■□□□ 1.08
CCDC25-202ENST00000517979 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.78■■□□□ 1.08
CCDC25-202ENST00000517979 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CCDC25-202ENST00000517979 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.77■■□□□ 1.07
CCDC25-202ENST00000517979 ABCA6Q8N139 1617 aa21.77■■□□□ 1.07
CCDC25-202ENST00000517979 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CCDC25-202ENST00000517979 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.74■■□□□ 1.07
CCDC25-202ENST00000517979 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.73■■□□□ 1.07
CCDC25-202ENST00000517979 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
CCDC25-202ENST00000517979 REREQ9P2R6 1566 aa21.73■■□□□ 1.07
CCDC25-202ENST00000517979 NCOA2Q15596 1464 aa21.72■■□□□ 1.07
CCDC25-202ENST00000517979 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.72■■□□□ 1.07
CCDC25-202ENST00000517979 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CCDC25-202ENST00000517979 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.68■■□□□ 1.06
CCDC25-202ENST00000517979 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CCDC25-202ENST00000517979 ATP7AQ04656 1500 aa21.66■■□□□ 1.06
CCDC25-202ENST00000517979 AGLP35573 1532 aa21.65■■□□□ 1.06
CCDC25-202ENST00000517979 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CCDC25-202ENST00000517979 MAP3K1Q13233 1512 aa21.65■■□□□ 1.06
CCDC25-202ENST00000517979 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CCDC25-202ENST00000517979 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.62■■□□□ 1.05
CCDC25-202ENST00000517979 MBD5Q9P267 1494 aa21.61■■□□□ 1.05
CCDC25-202ENST00000517979 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.59■■□□□ 1.05
CCDC25-202ENST00000517979 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CCDC25-202ENST00000517979 APLP2Q06481 763 aa21.58■■□□□ 1.05
CCDC25-202ENST00000517979 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CCDC25-202ENST00000517979 A2MP01023 1474 aa21.57■■□□□ 1.04
CCDC25-202ENST00000517979 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.57■■□□□ 1.04
CCDC25-202ENST00000517979 PLXNC1O60486 1568 aa21.56■■□□□ 1.04
CCDC25-202ENST00000517979 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.54■■□□□ 1.04
CCDC25-202ENST00000517979 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CCDC25-202ENST00000517979 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC25-202ENST00000517979 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC25-202ENST00000517979 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC25-202ENST00000517979 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC25-202ENST00000517979 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC25-202ENST00000517979 C3P01024 1663 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC25-202ENST00000517979 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC25-202ENST00000517979 HSPA2P54652 639 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC25-202ENST00000517979 MIA2Q96PC5 1412 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC25-202ENST00000517979 TSPY4P0CV99 314 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC25-202ENST00000517979 TSPY10P0CW01 314 aa21.45■■□□□ 1.02
CCDC25-202ENST00000517979 MROH2AA6NES4 1674 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC25-202ENST00000517979 GGT6Q6P531 493 aa21.44■■□□□ 1.02
CCDC25-202ENST00000517979 POTEDQ86YR6 584 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms