RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.47■■□□□ 1.19
PDGFRB-202ENST00000517488 RICTORQ6R327 1708 aa22.45■■□□□ 1.18
PDGFRB-202ENST00000517488 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.43■■□□□ 1.18
PDGFRB-202ENST00000517488 AFAP1Q8N556 730 aa22.43■■□□□ 1.18
PDGFRB-202ENST00000517488 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.41■■□□□ 1.18
PDGFRB-202ENST00000517488 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PDGFRB-202ENST00000517488 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.41■■□□□ 1.18
PDGFRB-202ENST00000517488 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PDGFRB-202ENST00000517488 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.39■■□□□ 1.17
PDGFRB-202ENST00000517488 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.39■■□□□ 1.17
PDGFRB-202ENST00000517488 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.39■■□□□ 1.17
PDGFRB-202ENST00000517488 PREX2Q70Z35 1606 aa22.39■■□□□ 1.17
PDGFRB-202ENST00000517488 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.38■■□□□ 1.17
PDGFRB-202ENST00000517488 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.37■■□□□ 1.17
PDGFRB-202ENST00000517488 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.36■■□□□ 1.17
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.36■■□□□ 1.17
PDGFRB-202ENST00000517488 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PDGFRB-202ENST00000517488 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.36■■□□□ 1.17
PDGFRB-202ENST00000517488 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.35■■□□□ 1.17
PDGFRB-202ENST00000517488 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.34■■□□□ 1.17
PDGFRB-202ENST00000517488 ABCC1P33527 1531 aa22.33■■□□□ 1.17
PDGFRB-202ENST00000517488 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
PDGFRB-202ENST00000517488 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.31■■□□□ 1.16
PDGFRB-202ENST00000517488 KDM5CP41229 1560 aa22.3■■□□□ 1.16
PDGFRB-202ENST00000517488 TIAM1Q13009 1591 aa22.3■■□□□ 1.16
PDGFRB-202ENST00000517488 ATP10AO60312 1499 aa22.29■■□□□ 1.16
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PDGFRB-202ENST00000517488 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PDGFRB-202ENST00000517488 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.28■■□□□ 1.16
PDGFRB-202ENST00000517488 NCOA2Q15596 1464 aa22.27■■□□□ 1.16
PDGFRB-202ENST00000517488 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.26■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.26■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.26■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.25■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 MLECQ14165 292 aa22.25■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.25■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.25■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.23■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.23■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.23■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.22■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 MAP3K1Q13233 1512 aa22.22■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.22■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 PTPRMP28827 1452 aa22.22■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PDGFRB-202ENST00000517488 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.19■■□□□ 1.14
PDGFRB-202ENST00000517488 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PDGFRB-202ENST00000517488 MADDQ8WXG6 1647 aa22.18■■□□□ 1.14
PDGFRB-202ENST00000517488 APLP2Q06481 763 aa22.17■■□□□ 1.14
PDGFRB-202ENST00000517488 ABCA6Q8N139 1617 aa22.17■■□□□ 1.14
PDGFRB-202ENST00000517488 MBD5Q9P267 1494 aa22.16■■□□□ 1.14
PDGFRB-202ENST00000517488 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.13■■□□□ 1.13
PDGFRB-202ENST00000517488 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.12■■□□□ 1.13
PDGFRB-202ENST00000517488 REREQ9P2R6 1566 aa22.12■■□□□ 1.13
PDGFRB-202ENST00000517488 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.1■■□□□ 1.13
PDGFRB-202ENST00000517488 ATP7AQ04656 1500 aa22.09■■□□□ 1.13
PDGFRB-202ENST00000517488 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PDGFRB-202ENST00000517488 AGLP35573 1532 aa22.08■■□□□ 1.13
PDGFRB-202ENST00000517488 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.06■■□□□ 1.12
PDGFRB-202ENST00000517488 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.06■■□□□ 1.12
PDGFRB-202ENST00000517488 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.04■■□□□ 1.12
PDGFRB-202ENST00000517488 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PDGFRB-202ENST00000517488 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.04■■□□□ 1.12
PDGFRB-202ENST00000517488 A2MP01023 1474 aa22.03■■□□□ 1.12
PDGFRB-202ENST00000517488 MIA2Q96PC5 1412 aa22.03■■□□□ 1.12
PDGFRB-202ENST00000517488 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22■■□□□ 1.11
PDGFRB-202ENST00000517488 TSPY4P0CV99 314 aa22■■□□□ 1.11
PDGFRB-202ENST00000517488 TSPY10P0CW01 314 aa22■■□□□ 1.11
PDGFRB-202ENST00000517488 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PDGFRB-202ENST00000517488 PLXNC1O60486 1568 aa21.98■■□□□ 1.11
PDGFRB-202ENST00000517488 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.97■■□□□ 1.11
PDGFRB-202ENST00000517488 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PDGFRB-202ENST00000517488 GGT6Q6P531 493 aa21.95■■□□□ 1.1
PDGFRB-202ENST00000517488 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.95■■□□□ 1.1
PDGFRB-202ENST00000517488 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.92■■□□□ 1.1
PDGFRB-202ENST00000517488 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.91■■□□□ 1.1
PDGFRB-202ENST00000517488 HSPA2P54652 639 aa21.91■■□□□ 1.1
PDGFRB-202ENST00000517488 KIF3BO15066 747 aa21.9■■□□□ 1.1
PDGFRB-202ENST00000517488 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.89■■□□□ 1.1
PDGFRB-202ENST00000517488 ABCC5O15440 1437 aa21.88■■□□□ 1.09
PDGFRB-202ENST00000517488 ZMYM3Q14202 1370 aa21.87■■□□□ 1.09
PDGFRB-202ENST00000517488 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.87■■□□□ 1.09
PDGFRB-202ENST00000517488 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PDGFRB-202ENST00000517488 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.87■■□□□ 1.09
PDGFRB-202ENST00000517488 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.85■■□□□ 1.09
PDGFRB-202ENST00000517488 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PDGFRB-202ENST00000517488 C3P01024 1663 aa21.82■■□□□ 1.08
PDGFRB-202ENST00000517488 DAPK1P53355 1430 aa21.82■■□□□ 1.08
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PDGFRB-202ENST00000517488 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.8■■□□□ 1.08
PDGFRB-202ENST00000517488 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.8■■□□□ 1.08
PDGFRB-202ENST00000517488 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.79■■□□□ 1.08
PDGFRB-202ENST00000517488 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.79■■□□□ 1.08
PDGFRB-202ENST00000517488 KIF15Q9NS87 1388 aa21.78■■□□□ 1.08
PDGFRB-202ENST00000517488 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PDGFRB-202ENST00000517488 NPATQ14207 1427 aa21.77■■□□□ 1.08
PDGFRB-202ENST00000517488 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.77■■□□□ 1.07
PDGFRB-202ENST00000517488 PTPRKQ15262 1439 aa21.76■■□□□ 1.07
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