RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 MAPKBP1O60336 1514 aa23.5■■□□□ 1.35
TRPS1-206ENST00000517323 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.5■■□□□ 1.35
TRPS1-206ENST00000517323 MIA2Q96PC5 1412 aa23.49■■□□□ 1.35
TRPS1-206ENST00000517323 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.47■■□□□ 1.35
TRPS1-206ENST00000517323 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRPS1-206ENST00000517323 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.47■■□□□ 1.35
TRPS1-206ENST00000517323 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.46■■□□□ 1.35
TRPS1-206ENST00000517323 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
TRPS1-206ENST00000517323 PLCH2O75038 1416 aa23.42■■□□□ 1.34
TRPS1-206ENST00000517323 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.41■■□□□ 1.34
TRPS1-206ENST00000517323 TSPOAP1O95153 1857 aa23.39■■□□□ 1.34
TRPS1-206ENST00000517323 DIP2BQ9P265 1576 aa23.39■■□□□ 1.33
TRPS1-206ENST00000517323 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
TRPS1-206ENST00000517323 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.38■■□□□ 1.33
TRPS1-206ENST00000517323 CD109Q6YHK3 1445 aa23.38■■□□□ 1.33
TRPS1-206ENST00000517323 ABCC5O15440 1437 aa23.37■■□□□ 1.33
TRPS1-206ENST00000517323 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.37■■□□□ 1.33
TRPS1-206ENST00000517323 DAPK1P53355 1430 aa23.37■■□□□ 1.33
TRPS1-206ENST00000517323 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TRPS1-206ENST00000517323 FANCAO15360 1455 aa23.35■■□□□ 1.33
TRPS1-206ENST00000517323 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.35■■□□□ 1.33
TRPS1-206ENST00000517323 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.34■■□□□ 1.33
TRPS1-206ENST00000517323 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.34■■□□□ 1.33
TRPS1-206ENST00000517323 MBD5Q9P267 1494 aa23.32■■□□□ 1.32
TRPS1-206ENST00000517323 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.32■■□□□ 1.32
TRPS1-206ENST00000517323 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.3■■□□□ 1.32
TRPS1-206ENST00000517323 ABCC1P33527 1531 aa23.29■■□□□ 1.32
TRPS1-206ENST00000517323 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.28■■□□□ 1.32
TRPS1-206ENST00000517323 AFAP1Q8N556 730 aa23.26■■□□□ 1.31
TRPS1-206ENST00000517323 GLI2P10070 1586 aa23.26■■□□□ 1.31
TRPS1-206ENST00000517323 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.25■■□□□ 1.31
TRPS1-206ENST00000517323 KDM6BO15054 1643 aa23.25■■□□□ 1.31
TRPS1-206ENST00000517323 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.25■■□□□ 1.31
TRPS1-206ENST00000517323 ADGRL1O94910 1474 aa23.25■■□□□ 1.31
TRPS1-206ENST00000517323 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TRPS1-206ENST00000517323 AKNAQ7Z591 1439 aa23.24■■□□□ 1.31
TRPS1-206ENST00000517323 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.22■■□□□ 1.31
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.22■■□□□ 1.31
TRPS1-206ENST00000517323 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.22■■□□□ 1.31
TRPS1-206ENST00000517323 NAIPQ13075 1403 aa23.22■■□□□ 1.31
TRPS1-206ENST00000517323 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.22■■□□□ 1.31
TRPS1-206ENST00000517323 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.21■■□□□ 1.31
TRPS1-206ENST00000517323 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TRPS1-206ENST00000517323 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.19■■□□□ 1.3
TRPS1-206ENST00000517323 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.19■■□□□ 1.3
TRPS1-206ENST00000517323 TSPY4P0CV99 314 aa23.18■■□□□ 1.3
TRPS1-206ENST00000517323 TSPY10P0CW01 314 aa23.18■■□□□ 1.3
TRPS1-206ENST00000517323 HFM1A2PYH4 1435 aa23.18■■□□□ 1.3
TRPS1-206ENST00000517323 RAPGEF3O95398 923 aa23.18■■□□□ 1.3
TRPS1-206ENST00000517323 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.17■■□□□ 1.3
TRPS1-206ENST00000517323 NCOA1Q15788 1441 aa23.16■■□□□ 1.3
TRPS1-206ENST00000517323 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.15■■□□□ 1.3
TRPS1-206ENST00000517323 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TRPS1-206ENST00000517323 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.13■■□□□ 1.29
TRPS1-206ENST00000517323 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.13■■□□□ 1.29
TRPS1-206ENST00000517323 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.12■■□□□ 1.29
TRPS1-206ENST00000517323 ROCK1Q13464 1354 aa23.11■■□□□ 1.29
TRPS1-206ENST00000517323 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.1■■□□□ 1.29
TRPS1-206ENST00000517323 ADGRL2O95490 1459 aa23.1■■□□□ 1.29
TRPS1-206ENST00000517323 NEO1Q92859 1461 aa23.1■■□□□ 1.29
TRPS1-206ENST00000517323 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TRPS1-206ENST00000517323 KIF15Q9NS87 1388 aa23.09■■□□□ 1.29
TRPS1-206ENST00000517323 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.07■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.07■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.07■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.05■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 RICTORQ6R327 1708 aa23.05■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.04■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.04■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 ATP7AQ04656 1500 aa23.04■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.03■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.02■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 TRIM52Q96A61 297 aa23.02■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.02■■□□□ 1.28
TRPS1-206ENST00000517323 PLXNC1O60486 1568 aa23■■□□□ 1.27
TRPS1-206ENST00000517323 KDM5CP41229 1560 aa23■■□□□ 1.27
TRPS1-206ENST00000517323 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-206ENST00000517323 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.96■■□□□ 1.27
TRPS1-206ENST00000517323 ABCA6Q8N139 1617 aa22.95■■□□□ 1.26
TRPS1-206ENST00000517323 FOXD1Q16676 465 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-206ENST00000517323 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.94■■□□□ 1.26
TRPS1-206ENST00000517323 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
TRPS1-206ENST00000517323 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.91■■□□□ 1.26
TRPS1-206ENST00000517323 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.9■■□□□ 1.26
TRPS1-206ENST00000517323 HRCP23327 699 aa22.89■■□□□ 1.26
TRPS1-206ENST00000517323 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.88■■□□□ 1.25
TRPS1-206ENST00000517323 NUP155O75694 1391 aa22.86■■□□□ 1.25
TRPS1-206ENST00000517323 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.86■■□□□ 1.25
TRPS1-206ENST00000517323 PZPP20742 1482 aa22.85■■□□□ 1.25
TRPS1-206ENST00000517323 KIF3BO15066 747 aa22.85■■□□□ 1.25
TRPS1-206ENST00000517323 A2MP01023 1474 aa22.84■■□□□ 1.25
TRPS1-206ENST00000517323 ERBINQ96RT1 1412 aa22.84■■□□□ 1.25
TRPS1-206ENST00000517323 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.83■■□□□ 1.25
TRPS1-206ENST00000517323 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
TRPS1-206ENST00000517323 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.83■■□□□ 1.25
TRPS1-206ENST00000517323 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.83■■□□□ 1.25
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