RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514834.1

ITGA3-214, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-214ENST00000514834 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.31■■□□□ 1.16
ITGA3-214ENST00000514834 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGA3-214ENST00000514834 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGA3-214ENST00000514834 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGA3-214ENST00000514834 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGA3-214ENST00000514834 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGA3-214ENST00000514834 PREX2Q70Z35 1606 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGA3-214ENST00000514834 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ITGA3-214ENST00000514834 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.25■■□□□ 1.15
ITGA3-214ENST00000514834 AFAP1Q8N556 730 aa22.24■■□□□ 1.15
ITGA3-214ENST00000514834 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.22■■□□□ 1.15
ITGA3-214ENST00000514834 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.22■■□□□ 1.15
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ITGA3-214ENST00000514834 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.21■■□□□ 1.15
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ITGA3-214ENST00000514834 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.19■■□□□ 1.14
ITGA3-214ENST00000514834 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.19■■□□□ 1.14
ITGA3-214ENST00000514834 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.18■■□□□ 1.14
ITGA3-214ENST00000514834 ABCC1P33527 1531 aa22.17■■□□□ 1.14
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.16■■□□□ 1.14
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ITGA3-214ENST00000514834 KDM5CP41229 1560 aa22.16■■□□□ 1.14
ITGA3-214ENST00000514834 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.15■■□□□ 1.14
ITGA3-214ENST00000514834 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.14■■□□□ 1.14
ITGA3-214ENST00000514834 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.14■■□□□ 1.14
ITGA3-214ENST00000514834 MADDQ8WXG6 1647 aa22.13■■□□□ 1.13
ITGA3-214ENST00000514834 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.12■■□□□ 1.13
ITGA3-214ENST00000514834 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.12■■□□□ 1.13
ITGA3-214ENST00000514834 ATP10AO60312 1499 aa22.12■■□□□ 1.13
ITGA3-214ENST00000514834 PTPRMP28827 1452 aa22.11■■□□□ 1.13
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ITGA3-214ENST00000514834 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.09■■□□□ 1.13
ITGA3-214ENST00000514834 MLECQ14165 292 aa22.09■■□□□ 1.13
ITGA3-214ENST00000514834 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.09■■□□□ 1.13
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ITGA3-214ENST00000514834 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.08■■□□□ 1.13
ITGA3-214ENST00000514834 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.08■■□□□ 1.12
ITGA3-214ENST00000514834 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGA3-214ENST00000514834 ABCA6Q8N139 1617 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGA3-214ENST00000514834 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.07■■□□□ 1.12
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ITGA3-214ENST00000514834 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGA3-214ENST00000514834 NCOA2Q15596 1464 aa22.04■■□□□ 1.12
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ITGA3-214ENST00000514834 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.99■■□□□ 1.11
ITGA3-214ENST00000514834 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.98■■□□□ 1.11
ITGA3-214ENST00000514834 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.98■■□□□ 1.11
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ITGA3-214ENST00000514834 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.86■■□□□ 1.09
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ITGA3-214ENST00000514834 PLXNC1O60486 1568 aa21.83■■□□□ 1.09
ITGA3-214ENST00000514834 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.82■■□□□ 1.08
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ITGA3-214ENST00000514834 HSPA2P54652 639 aa21.81■■□□□ 1.08
ITGA3-214ENST00000514834 APLP2Q06481 763 aa21.81■■□□□ 1.08
ITGA3-214ENST00000514834 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.8■■□□□ 1.08
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ITGA3-214ENST00000514834 C3P01024 1663 aa21.79■■□□□ 1.08
ITGA3-214ENST00000514834 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.78■■□□□ 1.08
ITGA3-214ENST00000514834 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.76■■□□□ 1.07
ITGA3-214ENST00000514834 MIA2Q96PC5 1412 aa21.76■■□□□ 1.07
ITGA3-214ENST00000514834 GGT6Q6P531 493 aa21.75■■□□□ 1.07
ITGA3-214ENST00000514834 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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ITGA3-214ENST00000514834 TSPY10P0CW01 314 aa21.71■■□□□ 1.07
ITGA3-214ENST00000514834 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.71■■□□□ 1.07
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ITGA3-214ENST00000514834 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.67■■□□□ 1.06
ITGA3-214ENST00000514834 ABCC5O15440 1437 aa21.64■■□□□ 1.06
ITGA3-214ENST00000514834 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.63■■□□□ 1.05
ITGA3-214ENST00000514834 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
ITGA3-214ENST00000514834 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.61■■□□□ 1.05
ITGA3-214ENST00000514834 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ITGA3-214ENST00000514834 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.6■■□□□ 1.05
ITGA3-214ENST00000514834 PTPRKQ15262 1439 aa21.6■■□□□ 1.05
ITGA3-214ENST00000514834 DAPK1P53355 1430 aa21.59■■□□□ 1.05
ITGA3-214ENST00000514834 STRCQ7RTU9 1775 aa21.59■■□□□ 1.05
ITGA3-214ENST00000514834 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
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