RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP162Q5TB80 1403 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27■■□□□ 1.91
HOXC-AS3-202ENST00000513165 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AFAP1Q8N556 730 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PREX2Q70Z35 1606 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP10AO60312 1499 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPRMP28827 1452 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KDM5CP41229 1560 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCC1P33527 1531 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MADDQ8WXG6 1647 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MLECQ14165 292 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 REREQ9P2R6 1566 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCA6Q8N139 1617 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TIAM1Q13009 1591 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AGLP35573 1532 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCOA2Q15596 1464 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAP3K1Q13233 1512 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MBD5Q9P267 1494 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP7AQ04656 1500 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A2MP01023 1474 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 APLP2Q06481 763 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLXNC1O60486 1568 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSPA2P54652 639 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSPY4P0CV99 314 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSPY10P0CW01 314 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MIA2Q96PC5 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GGT6Q6P531 493 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C3P01024 1663 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZMYM3Q14202 1370 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.38■■□□□ 1.81
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MROH2AA6NES4 1674 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPATQ14207 1427 aa26.33■■□□□ 1.81
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF3BO15066 747 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPRKQ15262 1439 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.2■■□□□ 1.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STRCQ7RTU9 1775 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCC5O15440 1437 aa26.16■■□□□ 1.78
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