RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512855.5

FAM200B-218, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM200B, Length 654 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-218ENST00000512855 PREX2Q70Z35 1606 aa36.26■■■■□ 3.39
FAM200B-218ENST00000512855 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.25■■■■□ 3.39
FAM200B-218ENST00000512855 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.25■■■■□ 3.39
FAM200B-218ENST00000512855 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.22■■■■□ 3.39
FAM200B-218ENST00000512855 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.21■■■■□ 3.39
FAM200B-218ENST00000512855 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.2■■■■□ 3.39
FAM200B-218ENST00000512855 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.19■■■■□ 3.38
FAM200B-218ENST00000512855 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.16■■■■□ 3.38
FAM200B-218ENST00000512855 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.13■■■■□ 3.38
FAM200B-218ENST00000512855 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.38
FAM200B-218ENST00000512855 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.11■■■■□ 3.37
FAM200B-218ENST00000512855 TIAM1Q13009 1591 aa36.1■■■■□ 3.37
FAM200B-218ENST00000512855 ABCC1P33527 1531 aa36.08■■■■□ 3.37
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.07■■■■□ 3.37
FAM200B-218ENST00000512855 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.07■■■■□ 3.36
FAM200B-218ENST00000512855 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.05■■■■□ 3.36
FAM200B-218ENST00000512855 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.05■■■■□ 3.36
FAM200B-218ENST00000512855 KDM5CP41229 1560 aa36.04■■■■□ 3.36
FAM200B-218ENST00000512855 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.03■■■■□ 3.36
FAM200B-218ENST00000512855 AFAP1Q8N556 730 aa36.01■■■■□ 3.36
FAM200B-218ENST00000512855 MAP3K1Q13233 1512 aa36.01■■■■□ 3.36
FAM200B-218ENST00000512855 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.01■■■■□ 3.35
FAM200B-218ENST00000512855 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36■■■■□ 3.35
FAM200B-218ENST00000512855 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
FAM200B-218ENST00000512855 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.97■■■■□ 3.35
FAM200B-218ENST00000512855 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
FAM200B-218ENST00000512855 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.95■■■■□ 3.35
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
FAM200B-218ENST00000512855 NCOA2Q15596 1464 aa35.93■■■■□ 3.34
FAM200B-218ENST00000512855 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.92■■■■□ 3.34
FAM200B-218ENST00000512855 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.91■■■■□ 3.34
FAM200B-218ENST00000512855 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.91■■■■□ 3.34
FAM200B-218ENST00000512855 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.91■■■■□ 3.34
FAM200B-218ENST00000512855 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.91■■■■□ 3.34
FAM200B-218ENST00000512855 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.9■■■■□ 3.34
FAM200B-218ENST00000512855 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.9■■■■□ 3.34
FAM200B-218ENST00000512855 ATP10AO60312 1499 aa35.9■■■■□ 3.34
FAM200B-218ENST00000512855 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.9■■■■□ 3.34
FAM200B-218ENST00000512855 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
FAM200B-218ENST00000512855 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.85■■■■□ 3.33
FAM200B-218ENST00000512855 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
FAM200B-218ENST00000512855 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.84■■■■□ 3.33
FAM200B-218ENST00000512855 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.82■■■■□ 3.32
FAM200B-218ENST00000512855 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
FAM200B-218ENST00000512855 ABCA6Q8N139 1617 aa35.79■■■■□ 3.32
FAM200B-218ENST00000512855 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.79■■■■□ 3.32
FAM200B-218ENST00000512855 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.79■■■■□ 3.32
FAM200B-218ENST00000512855 REREQ9P2R6 1566 aa35.76■■■■□ 3.32
FAM200B-218ENST00000512855 MADDQ8WXG6 1647 aa35.75■■■■□ 3.31
FAM200B-218ENST00000512855 MBD5Q9P267 1494 aa35.74■■■■□ 3.31
FAM200B-218ENST00000512855 APLP2Q06481 763 aa35.74■■■■□ 3.31
FAM200B-218ENST00000512855 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
FAM200B-218ENST00000512855 PTPRMP28827 1452 aa35.72■■■■□ 3.31
FAM200B-218ENST00000512855 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.69■■■■□ 3.3
FAM200B-218ENST00000512855 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
FAM200B-218ENST00000512855 ATP7AQ04656 1500 aa35.67■■■■□ 3.3
FAM200B-218ENST00000512855 AGLP35573 1532 aa35.65■■■■□ 3.3
FAM200B-218ENST00000512855 MLECQ14165 292 aa35.64■■■■□ 3.3
FAM200B-218ENST00000512855 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
FAM200B-218ENST00000512855 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.63■■■■□ 3.29
FAM200B-218ENST00000512855 MIA2Q96PC5 1412 aa35.6■■■■□ 3.29
FAM200B-218ENST00000512855 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.59■■■■□ 3.29
FAM200B-218ENST00000512855 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.58■■■■□ 3.29
FAM200B-218ENST00000512855 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.58■■■■□ 3.29
FAM200B-218ENST00000512855 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.57■■■■□ 3.28
FAM200B-218ENST00000512855 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.57■■■■□ 3.28
FAM200B-218ENST00000512855 PLXNC1O60486 1568 aa35.51■■■■□ 3.28
FAM200B-218ENST00000512855 A2MP01023 1474 aa35.51■■■■□ 3.28
FAM200B-218ENST00000512855 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.49■■■■□ 3.27
FAM200B-218ENST00000512855 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.4■■■■□ 3.26
FAM200B-218ENST00000512855 TSPY4P0CV99 314 aa35.4■■■■□ 3.26
FAM200B-218ENST00000512855 TSPY10P0CW01 314 aa35.4■■■■□ 3.26
FAM200B-218ENST00000512855 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.4■■■■□ 3.26
FAM200B-218ENST00000512855 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.38■■■■□ 3.25
FAM200B-218ENST00000512855 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
FAM200B-218ENST00000512855 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
FAM200B-218ENST00000512855 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.33■■■■□ 3.25
FAM200B-218ENST00000512855 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.32■■■■□ 3.24
FAM200B-218ENST00000512855 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
FAM200B-218ENST00000512855 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
FAM200B-218ENST00000512855 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.29■■■■□ 3.24
FAM200B-218ENST00000512855 C3P01024 1663 aa35.27■■■■□ 3.24
FAM200B-218ENST00000512855 ABCC5O15440 1437 aa35.27■■■■□ 3.24
FAM200B-218ENST00000512855 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.26■■■■□ 3.23
FAM200B-218ENST00000512855 MROH2AA6NES4 1674 aa35.25■■■■□ 3.23
FAM200B-218ENST00000512855 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
FAM200B-218ENST00000512855 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.24■■■■□ 3.23
FAM200B-218ENST00000512855 GGT6Q6P531 493 aa35.24■■■■□ 3.23
FAM200B-218ENST00000512855 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.23■■■■□ 3.23
FAM200B-218ENST00000512855 DAPK1P53355 1430 aa35.23■■■■□ 3.23
FAM200B-218ENST00000512855 KIF3BO15066 747 aa35.2■■■■□ 3.23
FAM200B-218ENST00000512855 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
FAM200B-218ENST00000512855 ZMYM3Q14202 1370 aa35.17■■■■□ 3.22
FAM200B-218ENST00000512855 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.16■■■■□ 3.22
FAM200B-218ENST00000512855 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
FAM200B-218ENST00000512855 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.12■■■■□ 3.21
FAM200B-218ENST00000512855 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
FAM200B-218ENST00000512855 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.11■■■■□ 3.21
FAM200B-218ENST00000512855 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
FAM200B-218ENST00000512855 NPATQ14207 1427 aa35.08■■■■□ 3.21
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