RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-223ENST00000512131 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.66■■■□□ 2.02
SH3BP2-223ENST00000512131 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.66■■■□□ 2.02
SH3BP2-223ENST00000512131 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
SH3BP2-223ENST00000512131 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.64■■■□□ 2.02
SH3BP2-223ENST00000512131 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP2-223ENST00000512131 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.61■■■□□ 2.01
SH3BP2-223ENST00000512131 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
SH3BP2-223ENST00000512131 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
SH3BP2-223ENST00000512131 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP2-223ENST00000512131 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.59■■■□□ 2.01
SH3BP2-223ENST00000512131 PLCH2O75038 1416 aa27.58■■■□□ 2
SH3BP2-223ENST00000512131 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.56■■■□□ 2
SH3BP2-223ENST00000512131 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.55■■■□□ 2
SH3BP2-223ENST00000512131 HSPA2P54652 639 aa27.54■■■□□ 2
SH3BP2-223ENST00000512131 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.54■■■□□ 2
SH3BP2-223ENST00000512131 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.54■■■□□ 2
SH3BP2-223ENST00000512131 MLECQ14165 292 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP2-223ENST00000512131 KIF14Q15058 1648 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP2-223ENST00000512131 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP2-223ENST00000512131 ATP10AO60312 1499 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP2-223ENST00000512131 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2-223ENST00000512131 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2-223ENST00000512131 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP2-223ENST00000512131 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP2-223ENST00000512131 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-223ENST00000512131 TIAM1Q13009 1591 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP2-223ENST00000512131 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP2-223ENST00000512131 MAP3K1Q13233 1512 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP2-223ENST00000512131 AFAP1Q8N556 730 aa27.34■■□□□ 1.97
SH3BP2-223ENST00000512131 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.33■■□□□ 1.97
SH3BP2-223ENST00000512131 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SH3BP2-223ENST00000512131 CERKQ8TCT0 537 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP2-223ENST00000512131 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.31■■□□□ 1.96
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SH3BP2-223ENST00000512131 PREX2Q70Z35 1606 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-223ENST00000512131 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-223ENST00000512131 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
SH3BP2-223ENST00000512131 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-223ENST00000512131 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-223ENST00000512131 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP2-223ENST00000512131 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-223ENST00000512131 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-223ENST00000512131 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-223ENST00000512131 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-223ENST00000512131 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-223ENST00000512131 REREQ9P2R6 1566 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-223ENST00000512131 NCOA2Q15596 1464 aa27.19■■□□□ 1.94
SH3BP2-223ENST00000512131 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP2-223ENST00000512131 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP2-223ENST00000512131 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
SH3BP2-223ENST00000512131 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP2-223ENST00000512131 ABCA6Q8N139 1617 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP2-223ENST00000512131 ABCC1P33527 1531 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP2-223ENST00000512131 APLP2Q06481 763 aa27.14■■□□□ 1.94
SH3BP2-223ENST00000512131 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
SH3BP2-223ENST00000512131 AGLP35573 1532 aa27.14■■□□□ 1.94
SH3BP2-223ENST00000512131 STRCQ7RTU9 1775 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP2-223ENST00000512131 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-223ENST00000512131 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-223ENST00000512131 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-223ENST00000512131 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-223ENST00000512131 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.08■■□□□ 1.93
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SH3BP2-223ENST00000512131 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.06■■□□□ 1.92
SH3BP2-223ENST00000512131 C3P01024 1663 aa27.05■■□□□ 1.92
SH3BP2-223ENST00000512131 PTPRTO14522 1441 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BP2-223ENST00000512131 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BP2-223ENST00000512131 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BP2-223ENST00000512131 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SH3BP2-223ENST00000512131 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP2-223ENST00000512131 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.916e-9■□□□□ 10
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SH3BP2-223ENST00000512131 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2-223ENST00000512131 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SH3BP2-223ENST00000512131 MIA2Q96PC5 1412 aa26.96■■□□□ 1.91
SH3BP2-223ENST00000512131 NCOA1Q15788 1441 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP2-223ENST00000512131 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-223ENST00000512131 NPATQ14207 1427 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-223ENST00000512131 ZMYM3Q14202 1370 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-223ENST00000512131 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-223ENST00000512131 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-223ENST00000512131 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP2-223ENST00000512131 MROH2AA6NES4 1674 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP2-223ENST00000512131 ATP7AQ04656 1500 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP2-223ENST00000512131 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2-223ENST00000512131 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2-223ENST00000512131 PLXNC1O60486 1568 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2-223ENST00000512131 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SH3BP2-223ENST00000512131 A2MP01023 1474 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP2-223ENST00000512131 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP2-223ENST00000512131 ILDR2Q71H61 639 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP2-223ENST00000512131 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BP2-223ENST00000512131 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BP2-223ENST00000512131 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BP2-223ENST00000512131 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BP2-223ENST00000512131 GGT6Q6P531 493 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP2-223ENST00000512131 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SH3BP2-223ENST00000512131 PTPRKQ15262 1439 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-223ENST00000512131 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-223ENST00000512131 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
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