RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510308.5

JADE1-208, Transcript of jade family PHD finger 1, human

TSL 2

Gene JADE1, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JADE1-208	ENST00000510308	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.06	■■■□□ 2.88
JADE1-208	ENST00000510308	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		33.04	■■■□□ 2.88
JADE1-208	ENST00000510308	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
JADE1-208	ENST00000510308	KIF14	Q15058	1648 aa		33.02	■■■□□ 2.88
JADE1-208	ENST00000510308	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
JADE1-208	ENST00000510308	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.99	■■■□□ 2.87
JADE1-208	ENST00000510308	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.99	■■■□□ 2.87
JADE1-208	ENST00000510308	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
JADE1-208	ENST00000510308	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.97	■■■□□ 2.87
JADE1-208	ENST00000510308	CLIP1	P30622	1438 aa		32.91	■■■□□ 2.86
JADE1-208	ENST00000510308	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.89	■■■□□ 2.86
JADE1-208	ENST00000510308	ATP10A	O60312	1499 aa		32.89	■■■□□ 2.86
JADE1-208	ENST00000510308	MLEC	Q14165	292 aa		32.89	■■■□□ 2.86
JADE1-208	ENST00000510308	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.87	■■■□□ 2.85
JADE1-208	ENST00000510308	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.86	■■■□□ 2.85
JADE1-208	ENST00000510308	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.86	■■■□□ 2.85
JADE1-208	ENST00000510308	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.86	■■■□□ 2.85
JADE1-208	ENST00000510308	KDM5C	P41229	1560 aa		32.83	■■■□□ 2.85
JADE1-208	ENST00000510308	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.83	■■■□□ 2.85
JADE1-208	ENST00000510308	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.82	■■■□□ 2.85
JADE1-208	ENST00000510308	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.81	■■■□□ 2.84
JADE1-208	ENST00000510308	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.8	■■■□□ 2.84
JADE1-208	ENST00000510308	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.8	■■■□□ 2.84
JADE1-208	ENST00000510308	HSPA2	P54652	639 aa		32.78	■■■□□ 2.84
JADE1-208	ENST00000510308	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.77	■■■□□ 2.84
JADE1-208	ENST00000510308	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.77	■■■□□ 2.84
JADE1-208	ENST00000510308	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.73	■■■□□ 2.83
JADE1-208	ENST00000510308	ABCC1	P33527	1531 aa		32.71	■■■□□ 2.83
JADE1-208	ENST00000510308	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.69	■■■□□ 2.82
JADE1-208	ENST00000510308	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.68	■■■□□ 2.82
JADE1-208	ENST00000510308	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.68	■■■□□ 2.82
JADE1-208	ENST00000510308	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.68	■■■□□ 2.82
JADE1-208	ENST00000510308	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.67	■■■□□ 2.82
JADE1-208	ENST00000510308	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.67	■■■□□ 2.82
JADE1-208	ENST00000510308	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.66	■■■□□ 2.82
JADE1-208	ENST00000510308	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.65	■■■□□ 2.82
JADE1-208	ENST00000510308	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
JADE1-208	ENST00000510308	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.62	■■■□□ 2.81
JADE1-208	ENST00000510308	AGL	P35573	1532 aa		32.56	■■■□□ 2.8
JADE1-208	ENST00000510308	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.55	■■■□□ 2.8
JADE1-208	ENST00000510308	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.53	■■■□□ 2.8
JADE1-208	ENST00000510308	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.8
JADE1-208	ENST00000510308	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
JADE1-208	ENST00000510308	C3	P01024	1663 aa		32.49	■■■□□ 2.79
JADE1-208	ENST00000510308	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.48	■■■□□ 2.79
JADE1-208	ENST00000510308	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.47	■■■□□ 2.79
JADE1-208	ENST00000510308	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
JADE1-208	ENST00000510308	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.42	■■■□□ 2.78
JADE1-208	ENST00000510308	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.41	■■■□□ 2.78
JADE1-208	ENST00000510308	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
JADE1-208	ENST00000510308	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.4	■■■□□ 2.78	9e-6	■■■■□ 19.8
JADE1-208	ENST00000510308	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
JADE1-208	ENST00000510308	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.37	■■■□□ 2.77
JADE1-208	ENST00000510308	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.37	■■■□□ 2.77
JADE1-208	ENST00000510308	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.37	■■■□□ 2.77
JADE1-208	ENST00000510308	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
JADE1-208	ENST00000510308	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.36	■■■□□ 2.77
JADE1-208	ENST00000510308	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.36	■■■□□ 2.77
JADE1-208	ENST00000510308	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.35	■■■□□ 2.77
JADE1-208	ENST00000510308	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
JADE1-208	ENST00000510308	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.33	■■■□□ 2.77
JADE1-208	ENST00000510308	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
JADE1-208	ENST00000510308	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.3	■■■□□ 2.76
JADE1-208	ENST00000510308	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.3	■■■□□ 2.76
JADE1-208	ENST00000510308	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.28	■■■□□ 2.76
JADE1-208	ENST00000510308	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.27	■■■□□ 2.76
JADE1-208	ENST00000510308	A2M	P01023	1474 aa		32.26	■■■□□ 2.75
JADE1-208	ENST00000510308	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.23	■■■□□ 2.75
JADE1-208	ENST00000510308	PTPRT	O14522	1441 aa		32.23	■■■□□ 2.75
JADE1-208	ENST00000510308	NPAT	Q14207	1427 aa		32.23	■■■□□ 2.75
JADE1-208	ENST00000510308	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.23	■■■□□ 2.75
JADE1-208	ENST00000510308	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
JADE1-208	ENST00000510308	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.74
JADE1-208	ENST00000510308	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.19	■■■□□ 2.74
JADE1-208	ENST00000510308	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.18	■■■□□ 2.74
JADE1-208	ENST00000510308	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.17	■■■□□ 2.74
JADE1-208	ENST00000510308	GGT6	Q6P531	493 aa		32.13	■■■□□ 2.73
JADE1-208	ENST00000510308	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.12	■■■□□ 2.73
JADE1-208	ENST00000510308	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.1	■■■□□ 2.73
JADE1-208	ENST00000510308	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.09	■■■□□ 2.73
JADE1-208	ENST00000510308	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.08	■■■□□ 2.73
JADE1-208	ENST00000510308	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.08	■■■□□ 2.73
JADE1-208	ENST00000510308	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.07	■■■□□ 2.72
JADE1-208	ENST00000510308	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
JADE1-208	ENST00000510308	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.05	■■■□□ 2.72
JADE1-208	ENST00000510308	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
JADE1-208	ENST00000510308	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.03	■■■□□ 2.72
JADE1-208	ENST00000510308	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.03	■■■□□ 2.72
JADE1-208	ENST00000510308	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
JADE1-208	ENST00000510308	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.99	■■■□□ 2.71
JADE1-208	ENST00000510308	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.98	■■■□□ 2.71
JADE1-208	ENST00000510308	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.95	■■■□□ 2.7
JADE1-208	ENST00000510308	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
JADE1-208	ENST00000510308	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.93	■■■□□ 2.7
JADE1-208	ENST00000510308	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.91	■■■□□ 2.7
JADE1-208	ENST00000510308	KIF3B	O15066	747 aa		31.91	■■■□□ 2.7
JADE1-208	ENST00000510308	PKD2	Q13563	968 aa		31.91	■■■□□ 2.7
JADE1-208	ENST00000510308	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.91	■■■□□ 2.7
JADE1-208	ENST00000510308	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.89	■■■□□ 2.7
JADE1-208	ENST00000510308	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.89	■■■□□ 2.7

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