RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP162Q5TB80 1403 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-201ENST00000509870 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AFAP1Q8N556 730 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTPRMP28827 1452 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP10AO60312 1499 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PREX2Q70Z35 1606 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KDM5CP41229 1560 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MADDQ8WXG6 1647 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCC1P33527 1531 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MLECQ14165 292 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 REREQ9P2R6 1566 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AGLP35573 1532 aa24■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCA6Q8N139 1617 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TIAM1Q13009 1591 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAP3K1Q13233 1512 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MBD5Q9P267 1494 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A2MP01023 1474 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-201ENST00000509870 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSPA2P54652 639 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APLP2Q06481 763 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSPY4P0CV99 314 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSPY10P0CW01 314 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLXNC1O60486 1568 aa23.78■■□□□ 1.4
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GGT6Q6P531 493 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZMYM3Q14202 1370 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MIA2Q96PC5 1412 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C3P01024 1663 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NPATQ14207 1427 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIF3BO15066 747 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MROH2AA6NES4 1674 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO41Q8TF61 875 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTPRKQ15262 1439 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.58■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STRCQ7RTU9 1775 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTPRTO14522 1441 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.53■■□□□ 1.36
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