RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 RICTORQ6R327 1708 aa33.29■■■□□ 2.92
SH3BP2-210ENST00000505941 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.29■■■□□ 2.92
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SH3BP2-210ENST00000505941 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.26■■■□□ 2.92
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
SH3BP2-210ENST00000505941 PREX2Q70Z35 1606 aa33.26■■■□□ 2.91
SH3BP2-210ENST00000505941 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.26■■■□□ 2.91
SH3BP2-210ENST00000505941 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.25■■■□□ 2.91
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SH3BP2-210ENST00000505941 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
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SH3BP2-210ENST00000505941 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
SH3BP2-210ENST00000505941 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.24■■■□□ 2.91
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SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.02■■■□□ 2.88
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SH3BP2-210ENST00000505941 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.99■■■□□ 2.87
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SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.94■■■□□ 2.86
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SH3BP2-210ENST00000505941 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.75■■■□□ 2.83
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SH3BP2-210ENST00000505941 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.73■■■□□ 2.83
SH3BP2-210ENST00000505941 AGLP35573 1532 aa32.72■■■□□ 2.83
SH3BP2-210ENST00000505941 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
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SH3BP2-210ENST00000505941 A2MP01023 1474 aa32.67■■■□□ 2.82
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.66■■■□□ 2.82
SH3BP2-210ENST00000505941 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.62■■■□□ 2.81
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SH3BP2-210ENST00000505941 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.56■■■□□ 2.8
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.55■■■□□ 2.8
SH3BP2-210ENST00000505941 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.55■■■□□ 2.8
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SH3BP2-210ENST00000505941 PLXNC1O60486 1568 aa32.53■■■□□ 2.8
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.53■■■□□ 2.8
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF3BO15066 747 aa32.51■■■□□ 2.79
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SH3BP2-210ENST00000505941 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.47■■■□□ 2.79
SH3BP2-210ENST00000505941 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
SH3BP2-210ENST00000505941 ABCC5O15440 1437 aa32.43■■■□□ 2.78
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SH3BP2-210ENST00000505941 DAPK1P53355 1430 aa32.41■■■□□ 2.78
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SH3BP2-210ENST00000505941 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.39■■■□□ 2.78
SH3BP2-210ENST00000505941 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.37■■■□□ 2.77
SH3BP2-210ENST00000505941 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
SH3BP2-210ENST00000505941 C3P01024 1663 aa32.37■■■□□ 2.77
SH3BP2-210ENST00000505941 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.36■■■□□ 2.77
SH3BP2-210ENST00000505941 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.36■■■□□ 2.77
SH3BP2-210ENST00000505941 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
SH3BP2-210ENST00000505941 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.35■■■□□ 2.77
SH3BP2-210ENST00000505941 MROH2AA6NES4 1674 aa32.35■■■□□ 2.77
SH3BP2-210ENST00000505941 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.33■■■□□ 2.77
SH3BP2-210ENST00000505941 KIF15Q9NS87 1388 aa32.32■■■□□ 2.77
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