RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-210	ENST00000505941	RICTOR	Q6R327	1708 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SH3BP2-210	ENST00000505941	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SH3BP2-210	ENST00000505941	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SH3BP2-210	ENST00000505941	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.26	■■■□□ 2.92
SH3BP2-210	ENST00000505941	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
SH3BP2-210	ENST00000505941	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SH3BP2-210	ENST00000505941	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SH3BP2-210	ENST00000505941	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SH3BP2-210	ENST00000505941	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SH3BP2-210	ENST00000505941	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
SH3BP2-210	ENST00000505941	APLP2	Q06481	763 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SH3BP2-210	ENST00000505941	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
SH3BP2-210	ENST00000505941	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SH3BP2-210	ENST00000505941	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SH3BP2-210	ENST00000505941	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
SH3BP2-210	ENST00000505941	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SH3BP2-210	ENST00000505941	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SH3BP2-210	ENST00000505941	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SH3BP2-210	ENST00000505941	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SH3BP2-210	ENST00000505941	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SH3BP2-210	ENST00000505941	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SH3BP2-210	ENST00000505941	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SH3BP2-210	ENST00000505941	ABCC1	P33527	1531 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SH3BP2-210	ENST00000505941	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SH3BP2-210	ENST00000505941	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
SH3BP2-210	ENST00000505941	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SH3BP2-210	ENST00000505941	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SH3BP2-210	ENST00000505941	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.06	■■■□□ 2.88
SH3BP2-210	ENST00000505941	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SH3BP2-210	ENST00000505941	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SH3BP2-210	ENST00000505941	ATP10A	O60312	1499 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SH3BP2-210	ENST00000505941	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SH3BP2-210	ENST00000505941	KDM5C	P41229	1560 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SH3BP2-210	ENST00000505941	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SH3BP2-210	ENST00000505941	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SH3BP2-210	ENST00000505941	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SH3BP2-210	ENST00000505941	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33	■■■□□ 2.87
SH3BP2-210	ENST00000505941	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
SH3BP2-210	ENST00000505941	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33	■■■□□ 2.87
SH3BP2-210	ENST00000505941	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SH3BP2-210	ENST00000505941	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
SH3BP2-210	ENST00000505941	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SH3BP2-210	ENST00000505941	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SH3BP2-210	ENST00000505941	MLEC	Q14165	292 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SH3BP2-210	ENST00000505941	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
SH3BP2-210	ENST00000505941	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SH3BP2-210	ENST00000505941	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SH3BP2-210	ENST00000505941	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SH3BP2-210	ENST00000505941	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SH3BP2-210	ENST00000505941	PTPRM	P28827	1452 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SH3BP2-210	ENST00000505941	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SH3BP2-210	ENST00000505941	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SH3BP2-210	ENST00000505941	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SH3BP2-210	ENST00000505941	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SH3BP2-210	ENST00000505941	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SH3BP2-210	ENST00000505941	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SH3BP2-210	ENST00000505941	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SH3BP2-210	ENST00000505941	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SH3BP2-210	ENST00000505941	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SH3BP2-210	ENST00000505941	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SH3BP2-210	ENST00000505941	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SH3BP2-210	ENST00000505941	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SH3BP2-210	ENST00000505941	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SH3BP2-210	ENST00000505941	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SH3BP2-210	ENST00000505941	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
SH3BP2-210	ENST00000505941	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SH3BP2-210	ENST00000505941	AGL	P35573	1532 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SH3BP2-210	ENST00000505941	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
SH3BP2-210	ENST00000505941	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SH3BP2-210	ENST00000505941	A2M	P01023	1474 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SH3BP2-210	ENST00000505941	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SH3BP2-210	ENST00000505941	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SH3BP2-210	ENST00000505941	GGT6	Q6P531	493 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SH3BP2-210	ENST00000505941	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
SH3BP2-210	ENST00000505941	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SH3BP2-210	ENST00000505941	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SH3BP2-210	ENST00000505941	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SH3BP2-210	ENST00000505941	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
SH3BP2-210	ENST00000505941	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SH3BP2-210	ENST00000505941	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SH3BP2-210	ENST00000505941	KIF3B	O15066	747 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SH3BP2-210	ENST00000505941	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SH3BP2-210	ENST00000505941	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SH3BP2-210	ENST00000505941	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
SH3BP2-210	ENST00000505941	ABCC5	O15440	1437 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SH3BP2-210	ENST00000505941	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SH3BP2-210	ENST00000505941	DAPK1	P53355	1430 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SH3BP2-210	ENST00000505941	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SH3BP2-210	ENST00000505941	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SH3BP2-210	ENST00000505941	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SH3BP2-210	ENST00000505941	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
SH3BP2-210	ENST00000505941	C3	P01024	1663 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SH3BP2-210	ENST00000505941	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SH3BP2-210	ENST00000505941	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SH3BP2-210	ENST00000505941	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
SH3BP2-210	ENST00000505941	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SH3BP2-210	ENST00000505941	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SH3BP2-210	ENST00000505941	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
SH3BP2-210	ENST00000505941	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SH3BP2-210	ENST00000505941	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.32	■■■□□ 2.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms