RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.72■■■■□ 3.95
CXCL3-202ENST00000502974 PREX2Q70Z35 1606 aa39.69■■■■□ 3.94
CXCL3-202ENST00000502974 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.68■■■■□ 3.94
CXCL3-202ENST00000502974 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.66■■■■□ 3.94
CXCL3-202ENST00000502974 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.66■■■■□ 3.94
CXCL3-202ENST00000502974 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.66■■■■□ 3.94
CXCL3-202ENST00000502974 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.65■■■■□ 3.94
CXCL3-202ENST00000502974 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.62■■■■□ 3.93
CXCL3-202ENST00000502974 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.59■■■■□ 3.93
CXCL3-202ENST00000502974 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.58■■■■□ 3.93
CXCL3-202ENST00000502974 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.57■■■■□ 3.93
CXCL3-202ENST00000502974 TIAM1Q13009 1591 aa39.56■■■■□ 3.92
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.53■■■■□ 3.92
CXCL3-202ENST00000502974 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
CXCL3-202ENST00000502974 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.5■■■■□ 3.91
CXCL3-202ENST00000502974 ABCC1P33527 1531 aa39.49■■■■□ 3.91
CXCL3-202ENST00000502974 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
CXCL3-202ENST00000502974 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.47■■■■□ 3.91
CXCL3-202ENST00000502974 KDM5CP41229 1560 aa39.45■■■■□ 3.91
CXCL3-202ENST00000502974 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.45■■■■□ 3.91
CXCL3-202ENST00000502974 AFAP1Q8N556 730 aa39.43■■■■□ 3.9
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
CXCL3-202ENST00000502974 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.43■■■■□ 3.9
CXCL3-202ENST00000502974 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.4■■■■□ 3.9
CXCL3-202ENST00000502974 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
CXCL3-202ENST00000502974 MAP3K1Q13233 1512 aa39.4■■■■□ 3.9
CXCL3-202ENST00000502974 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.39■■■■□ 3.9
CXCL3-202ENST00000502974 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
CXCL3-202ENST00000502974 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.39■■■■□ 3.9
CXCL3-202ENST00000502974 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.38■■■■□ 3.9
CXCL3-202ENST00000502974 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.38■■■■□ 3.89
CXCL3-202ENST00000502974 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.37■■■■□ 3.89
CXCL3-202ENST00000502974 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.36■■■■□ 3.89
CXCL3-202ENST00000502974 ATP10AO60312 1499 aa39.34■■■■□ 3.89
CXCL3-202ENST00000502974 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.32■■■■□ 3.89
CXCL3-202ENST00000502974 NCOA2Q15596 1464 aa39.32■■■■□ 3.89
CXCL3-202ENST00000502974 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.32■■■■□ 3.89
CXCL3-202ENST00000502974 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.31■■■■□ 3.88
CXCL3-202ENST00000502974 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.3■■■■□ 3.88
CXCL3-202ENST00000502974 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.3■■■■□ 3.88
CXCL3-202ENST00000502974 APLP2Q06481 763 aa39.29■■■■□ 3.88
CXCL3-202ENST00000502974 MADDQ8WXG6 1647 aa39.29■■■■□ 3.88
CXCL3-202ENST00000502974 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
CXCL3-202ENST00000502974 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.25■■■■□ 3.87
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.24■■■■□ 3.87
CXCL3-202ENST00000502974 PTPRMP28827 1452 aa39.23■■■■□ 3.87
CXCL3-202ENST00000502974 ABCA6Q8N139 1617 aa39.22■■■■□ 3.87
CXCL3-202ENST00000502974 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.22■■■■□ 3.87
CXCL3-202ENST00000502974 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
CXCL3-202ENST00000502974 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.18■■■■□ 3.86
CXCL3-202ENST00000502974 MLECQ14165 292 aa39.18■■■■□ 3.86
CXCL3-202ENST00000502974 REREQ9P2R6 1566 aa39.16■■■■□ 3.86
CXCL3-202ENST00000502974 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.13■■■■□ 3.85
CXCL3-202ENST00000502974 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.12■■■■□ 3.85
CXCL3-202ENST00000502974 ATP7AQ04656 1500 aa39.08■■■■□ 3.85
CXCL3-202ENST00000502974 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.05■■■■□ 3.84
CXCL3-202ENST00000502974 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
CXCL3-202ENST00000502974 MBD5Q9P267 1494 aa39.03■■■■□ 3.84
CXCL3-202ENST00000502974 AGLP35573 1532 aa39.02■■■■□ 3.84
CXCL3-202ENST00000502974 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.99■■■■□ 3.83
CXCL3-202ENST00000502974 PLPPR3Q6T4P5 718 aa38.96■■■■□ 3.83
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.95■■■■□ 3.83
CXCL3-202ENST00000502974 MIA2Q96PC5 1412 aa38.91■■■■□ 3.82
CXCL3-202ENST00000502974 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.9■■■■□ 3.82
CXCL3-202ENST00000502974 A2MP01023 1474 aa38.89■■■■□ 3.82
CXCL3-202ENST00000502974 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.89■■■■□ 3.82
CXCL3-202ENST00000502974 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.89■■■■□ 3.82
CXCL3-202ENST00000502974 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.87■■■■□ 3.81
CXCL3-202ENST00000502974 PLXNC1O60486 1568 aa38.87■■■■□ 3.81
CXCL3-202ENST00000502974 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
CXCL3-202ENST00000502974 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.79■■■■□ 3.8
CXCL3-202ENST00000502974 TSPY4P0CV99 314 aa38.77■■■■□ 3.8
CXCL3-202ENST00000502974 TSPY10P0CW01 314 aa38.77■■■■□ 3.8
CXCL3-202ENST00000502974 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.76■■■■□ 3.8
CXCL3-202ENST00000502974 LMTK3Q96Q04 1460 aa38.75■■■■□ 3.79
CXCL3-202ENST00000502974 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.74■■■■□ 3.79
CXCL3-202ENST00000502974 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
CXCL3-202ENST00000502974 C3P01024 1663 aa38.71■■■■□ 3.79
CXCL3-202ENST00000502974 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.78
CXCL3-202ENST00000502974 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.67■■■■□ 3.78
CXCL3-202ENST00000502974 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
CXCL3-202ENST00000502974 GGT6Q6P531 493 aa38.66■■■■□ 3.78
CXCL3-202ENST00000502974 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
CXCL3-202ENST00000502974 MROH2AA6NES4 1674 aa38.65■■■■□ 3.78
CXCL3-202ENST00000502974 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.65■■■■□ 3.78
CXCL3-202ENST00000502974 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
CXCL3-202ENST00000502974 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP38.61■■■■□ 3.77
CXCL3-202ENST00000502974 CROCC2H7BZ55 1655 aa38.6■■■■□ 3.77
CXCL3-202ENST00000502974 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.77
CXCL3-202ENST00000502974 ABCC5O15440 1437 aa38.56■■■■□ 3.76
CXCL3-202ENST00000502974 KIF3BO15066 747 aa38.56■■■■□ 3.76
CXCL3-202ENST00000502974 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.56■■■■□ 3.76
CXCL3-202ENST00000502974 HSPA2P54652 639 aa38.55■■■■□ 3.76
CXCL3-202ENST00000502974 DAPK1P53355 1430 aa38.55■■■■□ 3.76
CXCL3-202ENST00000502974 ZMYM3Q14202 1370 aa38.54■■■■□ 3.76
CXCL3-202ENST00000502974 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.54■■■■□ 3.76
CXCL3-202ENST00000502974 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.53■■■■□ 3.76
CXCL3-202ENST00000502974 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
CXCL3-202ENST00000502974 NPATQ14207 1427 aa38.46■■■■□ 3.75
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