RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498535.1

MKRN1-216, Transcript of makorin ring finger protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKRN1, Length 607 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN1-216ENST00000498535 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.54■■■■■ 4.24
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MKRN1-216ENST00000498535 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
MKRN1-216ENST00000498535 CLIP1P30622 1438 aa41.51■■■■■ 4.24
MKRN1-216ENST00000498535 KIF14Q15058 1648 aa41.51■■■■■ 4.23
MKRN1-216ENST00000498535 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
MKRN1-216ENST00000498535 MLECQ14165 292 aa41.41■■■■■ 4.22
MKRN1-216ENST00000498535 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.4■■■■■ 4.22
MKRN1-216ENST00000498535 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
MKRN1-216ENST00000498535 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.38■■■■■ 4.22
MKRN1-216ENST00000498535 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.38■■■■■ 4.21
MKRN1-216ENST00000498535 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.37■■■■■ 4.21
MKRN1-216ENST00000498535 ATP10AO60312 1499 aa41.36■■■■■ 4.21
MKRN1-216ENST00000498535 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.35■■■■■ 4.21
MKRN1-216ENST00000498535 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.34■■■■■ 4.21
MKRN1-216ENST00000498535 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.34■■■■■ 4.21
MKRN1-216ENST00000498535 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.33■■■■■ 4.21
MKRN1-216ENST00000498535 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.31■■■■■ 4.2
MKRN1-216ENST00000498535 AFAP1Q8N556 730 aa41.29■■■■■ 4.2
MKRN1-216ENST00000498535 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.29■■■■■ 4.2
MKRN1-216ENST00000498535 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.25■■■■■ 4.19
MKRN1-216ENST00000498535 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.21■■■■■ 4.19
MKRN1-216ENST00000498535 KDM5CP41229 1560 aa41.2■■■■■ 4.19
MKRN1-216ENST00000498535 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.18■■■■■ 4.18
MKRN1-216ENST00000498535 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.18■■■■■ 4.18
MKRN1-216ENST00000498535 HSPA2P54652 639 aa41.17■■■■■ 4.18
MKRN1-216ENST00000498535 PREX2Q70Z35 1606 aa41.16■■■■■ 4.18
MKRN1-216ENST00000498535 FBXO41Q8TF61 875 aa41.13■■■■■ 4.17
MKRN1-216ENST00000498535 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.09■■■■■ 4.17
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MKRN1-216ENST00000498535 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.07■■■■■ 4.16
MKRN1-216ENST00000498535 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.06■■■■■ 4.16
MKRN1-216ENST00000498535 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.02■■■■■ 4.16
MKRN1-216ENST00000498535 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
MKRN1-216ENST00000498535 REREQ9P2R6 1566 aa41.01■■■■■ 4.16
MKRN1-216ENST00000498535 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.01■■■■■ 4.15
MKRN1-216ENST00000498535 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
MKRN1-216ENST00000498535 ABCA6Q8N139 1617 aa41■■■■■ 4.15
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MKRN1-216ENST00000498535 AGLP35573 1532 aa40.91■■■■■ 4.14
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MKRN1-216ENST00000498535 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.84■■■■■ 4.13
MKRN1-216ENST00000498535 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.84■■■■■ 4.13
MKRN1-216ENST00000498535 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.83■■■■■ 4.13
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MKRN1-216ENST00000498535 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.83■■■■■ 4.13
MKRN1-216ENST00000498535 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.83■■■■■ 4.13
MKRN1-216ENST00000498535 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.78■■■■■ 4.12
MKRN1-216ENST00000498535 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.76■■■■■ 4.12
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MKRN1-216ENST00000498535 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.74■■■■■ 4.11
MKRN1-216ENST00000498535 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.74■■■■■ 4.11
MKRN1-216ENST00000498535 CERKQ8TCT0 537 aa40.71■■■■■ 4.11
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MKRN1-216ENST00000498535 CEP162Q5TB80 1403 aa40.65■■■■■ 4.1
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MKRN1-216ENST00000498535 TIAM1Q13009 1591 aa40.57■■■■■ 4.09
MKRN1-216ENST00000498535 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
MKRN1-216ENST00000498535 ZMYM3Q14202 1370 aa40.55■■■■■ 4.08
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MKRN1-216ENST00000498535 NPATQ14207 1427 aa40.51■■■■■ 4.08
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MKRN1-216ENST00000498535 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.41■■■■■ 4.06
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MKRN1-216ENST00000498535 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.26■■■■■ 4.04
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MKRN1-216ENST00000498535 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.22■■■■■ 4.03
MKRN1-216ENST00000498535 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
MKRN1-216ENST00000498535 TSPY4P0CV99 314 aa40.2■■■■■ 4.03
MKRN1-216ENST00000498535 TSPY10P0CW01 314 aa40.2■■■■■ 4.03
MKRN1-216ENST00000498535 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
MKRN1-216ENST00000498535 PKD2Q13563 968 aa40.18■■■■■ 4.02
MKRN1-216ENST00000498535 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.17■■■■■ 4.02
MKRN1-216ENST00000498535 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.17■■■■■ 4.02
MKRN1-216ENST00000498535 PLA2R1Q13018 1463 aa40.16■■■■■ 4.02
MKRN1-216ENST00000498535 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.14■■■■■ 4.02
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