RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498448.1

C1orf109-212, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf109, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-212ENST00000498448 RAPGEF3O95398 923 aa28.56■■■□□ 2.16
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C1orf109-212ENST00000498448 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.53■■■□□ 2.16
C1orf109-212ENST00000498448 PREX2Q70Z35 1606 aa28.52■■■□□ 2.16
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C1orf109-212ENST00000498448 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.39■■■□□ 2.14
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C1orf109-212ENST00000498448 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.28■■■□□ 2.12
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C1orf109-212ENST00000498448 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.24■■■□□ 2.11
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C1orf109-212ENST00000498448 MBD5Q9P267 1494 aa28.2■■■□□ 2.1
C1orf109-212ENST00000498448 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.16■■■□□ 2.1
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C1orf109-212ENST00000498448 ABCA6Q8N139 1617 aa28.05■■■□□ 2.08
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C1orf109-212ENST00000498448 KIF3BO15066 747 aa27.81■■■□□ 2.04
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C1orf109-212ENST00000498448 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.81■■■□□ 2.04
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C1orf109-212ENST00000498448 KIF15Q9NS87 1388 aa27.8■■■□□ 2.04
C1orf109-212ENST00000498448 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.79■■■□□ 2.04
C1orf109-212ENST00000498448 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
C1orf109-212ENST00000498448 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.77■■■□□ 2.04
C1orf109-212ENST00000498448 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
C1orf109-212ENST00000498448 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.76■■■□□ 2.03
C1orf109-212ENST00000498448 NCOA1Q15788 1441 aa27.75■■■□□ 2.03
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C1orf109-212ENST00000498448 ERBINQ96RT1 1412 aa27.71■■■□□ 2.03
C1orf109-212ENST00000498448 ITGAEP38570 1179 aa27.7■■■□□ 2.02
C1orf109-212ENST00000498448 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.7■■■□□ 2.02
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