RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494800.1

HDAC4-211, Transcript of histone deacetylase 4, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC4, Length 451 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4-211ENST00000494800 RICTORQ6R327 1708 aa28.03■■■□□ 2.08
HDAC4-211ENST00000494800 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.01■■■□□ 2.07
HDAC4-211ENST00000494800 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.01■■■□□ 2.07
HDAC4-211ENST00000494800 PREX2Q70Z35 1606 aa28■■■□□ 2.07
HDAC4-211ENST00000494800 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.97■■■□□ 2.07
HDAC4-211ENST00000494800 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.97■■■□□ 2.07
HDAC4-211ENST00000494800 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.96■■■□□ 2.07
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HDAC4-211ENST00000494800 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.95■■■□□ 2.06
HDAC4-211ENST00000494800 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.95■■■□□ 2.06
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HDAC4-211ENST00000494800 AFAP1Q8N556 730 aa27.85■■■□□ 2.05
HDAC4-211ENST00000494800 KDM5CP41229 1560 aa27.83■■■□□ 2.05
HDAC4-211ENST00000494800 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.82■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 APLP2Q06481 763 aa27.8■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.79■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 MAP3K1Q13233 1512 aa27.79■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 ATP10AO60312 1499 aa27.79■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.78■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.78■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.78■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.78■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.77■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 NCOA2Q15596 1464 aa27.76■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.76■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.76■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.76■■■□□ 2.04
HDAC4-211ENST00000494800 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.75■■■□□ 2.03
HDAC4-211ENST00000494800 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.75■■■□□ 2.03
HDAC4-211ENST00000494800 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.73■■■□□ 2.03
HDAC4-211ENST00000494800 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.03
HDAC4-211ENST00000494800 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
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HDAC4-211ENST00000494800 PTPRMP28827 1452 aa27.65■■■□□ 2.02
HDAC4-211ENST00000494800 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
HDAC4-211ENST00000494800 MADDQ8WXG6 1647 aa27.65■■■□□ 2.02
HDAC4-211ENST00000494800 REREQ9P2R6 1566 aa27.64■■■□□ 2.01
HDAC4-211ENST00000494800 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
HDAC4-211ENST00000494800 ABCA6Q8N139 1617 aa27.63■■■□□ 2.01
HDAC4-211ENST00000494800 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.61■■■□□ 2.01
HDAC4-211ENST00000494800 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.6■■■□□ 2.01
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HDAC4-211ENST00000494800 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.58■■■□□ 2.01
HDAC4-211ENST00000494800 ATP7AQ04656 1500 aa27.58■■■□□ 2.01
HDAC4-211ENST00000494800 MBD5Q9P267 1494 aa27.57■■■□□ 2
HDAC4-211ENST00000494800 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
HDAC4-211ENST00000494800 AGLP35573 1532 aa27.56■■■□□ 2
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HDAC4-211ENST00000494800 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.54■■■□□ 2
HDAC4-211ENST00000494800 MIA2Q96PC5 1412 aa27.53■■■□□ 2
HDAC4-211ENST00000494800 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.53■■■□□ 2
HDAC4-211ENST00000494800 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
HDAC4-211ENST00000494800 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.51■■□□□ 1.99
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HDAC4-211ENST00000494800 TSPY10P0CW01 314 aa27.49■■□□□ 1.99
HDAC4-211ENST00000494800 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.48■■□□□ 1.99
HDAC4-211ENST00000494800 A2MP01023 1474 aa27.48■■□□□ 1.99
HDAC4-211ENST00000494800 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.47■■□□□ 1.99
HDAC4-211ENST00000494800 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.43■■□□□ 1.98
HDAC4-211ENST00000494800 PLXNC1O60486 1568 aa27.41■■□□□ 1.98
HDAC4-211ENST00000494800 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.4■■□□□ 1.98
HDAC4-211ENST00000494800 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
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HDAC4-211ENST00000494800 GGT6Q6P531 493 aa27.34■■□□□ 1.97
HDAC4-211ENST00000494800 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.34■■□□□ 1.97
HDAC4-211ENST00000494800 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
HDAC4-211ENST00000494800 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.32■■□□□ 1.96
HDAC4-211ENST00000494800 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.31■■□□□ 1.96
HDAC4-211ENST00000494800 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.3■■□□□ 1.96
HDAC4-211ENST00000494800 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
HDAC4-211ENST00000494800 KIF3BO15066 747 aa27.27■■□□□ 1.96
HDAC4-211ENST00000494800 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.25■■□□□ 1.95
HDAC4-211ENST00000494800 MROH2AA6NES4 1674 aa27.24■■□□□ 1.95
HDAC4-211ENST00000494800 C3P01024 1663 aa27.24■■□□□ 1.95
HDAC4-211ENST00000494800 ABCC5O15440 1437 aa27.23■■□□□ 1.95
HDAC4-211ENST00000494800 ZMYM3Q14202 1370 aa27.22■■□□□ 1.95
HDAC4-211ENST00000494800 DAPK1P53355 1430 aa27.22■■□□□ 1.95
HDAC4-211ENST00000494800 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.21■■□□□ 1.95
HDAC4-211ENST00000494800 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.21■■□□□ 1.95
HDAC4-211ENST00000494800 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
HDAC4-211ENST00000494800 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
HDAC4-211ENST00000494800 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
HDAC4-211ENST00000494800 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.18■■□□□ 1.94
HDAC4-211ENST00000494800 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.18■■□□□ 1.94
HDAC4-211ENST00000494800 NPATQ14207 1427 aa27.17■■□□□ 1.94
HDAC4-211ENST00000494800 HSPA2P54652 639 aa27.17■■□□□ 1.94
HDAC4-211ENST00000494800 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.16■■□□□ 1.94
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