RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 TSPOAP1O95153 1857 aa18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1-208ENST00000494664 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 PLCH2O75038 1416 aa18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 MYT1Q01538 1121 aa18■□□□□ 0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18■□□□□ 0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.99■□□□□ 0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 FGD6Q6ZV73 1430 aa17.97■□□□□ 0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 FANCAO15360 1455 aa17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARAP3Q8WWN8 1544 aa17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
TIMMDC1-208ENST00000494664 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
TIMMDC1-208ENST00000494664 MIA2Q96PC5 1412 aa17.93■□□□□ 0.46
TIMMDC1-208ENST00000494664 PTPN23Q9H3S7 1636 aa17.92■□□□□ 0.46
TIMMDC1-208ENST00000494664 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa17.91■□□□□ 0.46
TIMMDC1-208ENST00000494664 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa17.9■□□□□ 0.46
TIMMDC1-208ENST00000494664 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1-208ENST00000494664 TEX14Q8IWB6 1497 aa17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1-208ENST00000494664 AKNAQ7Z591 1439 aa17.89■□□□□ 0.45
TIMMDC1-208ENST00000494664 NEO1Q92859 1461 aa17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1-208ENST00000494664 ABCC1P33527 1531 aa17.88■□□□□ 0.45
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TIMMDC1-208ENST00000494664 CFAP74Q9C0B2 1584 aa17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1-208ENST00000494664 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.88■□□□□ 0.45
TIMMDC1-208ENST00000494664 ADGRL1O94910 1474 aa17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1-208ENST00000494664 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
TIMMDC1-208ENST00000494664 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 22.9
TIMMDC1-208ENST00000494664 MBD5Q9P267 1494 aa17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1-208ENST00000494664 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1-208ENST00000494664 SCAPERQ9BY12 1400 aa17.83■□□□□ 0.45
TIMMDC1-208ENST00000494664 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1-208ENST00000494664 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1-208ENST00000494664 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.81■□□□□ 0.44
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TIMMDC1-208ENST00000494664 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1-208ENST00000494664 AFAP1Q8N556 730 aa17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1-208ENST00000494664 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1-208ENST00000494664 POGZQ7Z3K3 1410 aa17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1-208ENST00000494664 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARHGEF5Q12774 1597 aa17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1-208ENST00000494664 ABCC5O15440 1437 aa17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1-208ENST00000494664 RICTORQ6R327 1708 aa17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1-208ENST00000494664 PTPRKQ15262 1439 aa17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1-208ENST00000494664 ITGAEP38570 1179 aa17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1-208ENST00000494664 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.77■□□□□ 0.43
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TIMMDC1-208ENST00000494664 CROCC2H7BZ55 1655 aa17.76■□□□□ 0.43
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa17.75■□□□□ 0.43
TIMMDC1-208ENST00000494664 KDM6BO15054 1643 aa17.75■□□□□ 0.43
TIMMDC1-208ENST00000494664 KDM5CP41229 1560 aa17.74■□□□□ 0.43
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa17.71■□□□□ 0.43
TIMMDC1-208ENST00000494664 CHIC2Q9UKJ5 165 aa17.71■□□□□ 0.43
TIMMDC1-208ENST00000494664 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.71■□□□□ 0.43
TIMMDC1-208ENST00000494664 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 SHANK2Q9UPX8 1470 aa17.69■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa17.69■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa17.68■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 RSPH4AQ5TD94 716 aa17.68■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 HECW2Q9P2P5 1572 aa17.68■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 ATP7AQ04656 1500 aa17.68■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 MAST1Q9Y2H9 1570 aa17.67■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 TSPY4P0CV99 314 aa17.67■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 TSPY10P0CW01 314 aa17.67■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 YEATS2Q9ULM3 1422 aa17.67■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 MLH3Q9UHC1 1453 aa17.66■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 ADGBQ8N7X0 1667 aa17.65■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 ABCA6Q8N139 1617 aa17.64■□□□□ 0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 ADGRL2O95490 1459 aa17.64■□□□□ 0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 NCOA1Q15788 1441 aa17.64■□□□□ 0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.63■□□□□ 0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 MYT1LQ9UL68 1186 aa17.62■□□□□ 0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa17.62■□□□□ 0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 PLXNC1O60486 1568 aa17.62■□□□□ 0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa17.62■□□□□ 0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ROCK1Q13464 1354 aa17.6■□□□□ 0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 MAGI2Q86UL8 1455 aa17.6■□□□□ 0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa17.6■□□□□ 0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 KIF15Q9NS87 1388 aa17.6■□□□□ 0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa17.59■□□□□ 0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 NAIPQ13075 1403 aa17.58■□□□□ 0.4
TIMMDC1-208ENST00000494664 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1-208ENST00000494664 HFM1A2PYH4 1435 aa17.57■□□□□ 0.4
TIMMDC1-208ENST00000494664 GCC2Q8IWJ2 1684 aa17.55■□□□□ 0.4
TIMMDC1-208ENST00000494664 ATP10AO60312 1499 aa17.54■□□□□ 0.4
TIMMDC1-208ENST00000494664 A2MP01023 1474 aa17.54■□□□□ 0.4
TIMMDC1-208ENST00000494664 DUOX2Q9NRD8 1548 aa17.54■□□□□ 0.4
TIMMDC1-208ENST00000494664 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
TIMMDC1-208ENST00000494664 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.52■□□□□ 0.39
TIMMDC1-208ENST00000494664 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
TIMMDC1-208ENST00000494664 NEUROD1Q13562 356 aa17.5■□□□□ 0.39
TIMMDC1-208ENST00000494664 REREQ9P2R6 1566 aa17.5■□□□□ 0.39
TIMMDC1-208ENST00000494664 ERBINQ96RT1 1412 aa17.49■□□□□ 0.39
TIMMDC1-208ENST00000494664 SETD5Q9C0A6 1442 aa17.49■□□□□ 0.39
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