RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CEP162Q5TB80 1403 aa30.95■■■□□ 2.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.92■■■□□ 2.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AFAP1Q8N556 730 aa30.9■■■□□ 2.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PTPRMP28827 1452 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PREX2Q70Z35 1606 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MLECQ14165 292 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATP10AO60312 1499 aa30.8■■■□□ 2.52
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 MADDQ8WXG6 1647 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.74■■■□□ 2.51
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.74■■■□□ 2.51
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.73■■■□□ 2.51
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ABCC1P33527 1531 aa30.73■■■□□ 2.51
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KDM5CP41229 1560 aa30.72■■■□□ 2.51
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.71■■■□□ 2.51
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.7■■■□□ 2.51
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.69■■■□□ 2.5
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.68■■■□□ 2.5
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
HOXB-AS3-215ENST00000494420 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ABCA6Q8N139 1617 aa30.56■■■□□ 2.48
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TIAM1Q13009 1591 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXB-AS3-215ENST00000494420 REREQ9P2R6 1566 aa30.52■■■□□ 2.48
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.51■■■□□ 2.48
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NCOA2Q15596 1464 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.44■■■□□ 2.46
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.44■■■□□ 2.46
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATP7AQ04656 1500 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HSPA2P54652 639 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MBD5Q9P267 1494 aa30.4■■■□□ 2.46
HOXB-AS3-215ENST00000494420 APLP2Q06481 763 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAP3K1Q13233 1512 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A2MP01023 1474 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXB-AS3-215ENST00000494420 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GGT6Q6P531 493 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TSPY4P0CV99 314 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TSPY10P0CW01 314 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PLXNC1O60486 1568 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZMYM3Q14202 1370 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C3P01024 1663 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KIF3BO15066 747 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MIA2Q96PC5 1412 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MROH2AA6NES4 1674 aa30.11■■■□□ 2.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NPATQ14207 1427 aa30.09■■■□□ 2.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PTPRKQ15262 1439 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.01■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FBXO41Q8TF61 875 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ABCC5O15440 1437 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 STRCQ7RTU9 1775 aa29.95■■■□□ 2.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
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