RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.46■■■■□ 3.43
SENP6-211ENST00000493959 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.46■■■■□ 3.43
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SENP6-211ENST00000493959 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.41■■■■□ 3.42
SENP6-211ENST00000493959 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.41■■■■□ 3.42
SENP6-211ENST00000493959 AFAP1Q8N556 730 aa36.41■■■■□ 3.42
SENP6-211ENST00000493959 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.4■■■■□ 3.42
SENP6-211ENST00000493959 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.37■■■■□ 3.41
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SENP6-211ENST00000493959 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.32■■■■□ 3.4
SENP6-211ENST00000493959 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.3■■■■□ 3.4
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SENP6-211ENST00000493959 MLECQ14165 292 aa36.27■■■■□ 3.4
SENP6-211ENST00000493959 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.26■■■■□ 3.4
SENP6-211ENST00000493959 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.26■■■■□ 3.39
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SENP6-211ENST00000493959 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.19■■■■□ 3.38
SENP6-211ENST00000493959 KDM5CP41229 1560 aa36.19■■■■□ 3.38
SENP6-211ENST00000493959 ABCC1P33527 1531 aa36.18■■■■□ 3.38
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SENP6-211ENST00000493959 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.15■■■■□ 3.38
SENP6-211ENST00000493959 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.14■■■■□ 3.38
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SENP6-211ENST00000493959 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
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SENP6-211ENST00000493959 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.03■■■■□ 3.36
SENP6-211ENST00000493959 ABCA6Q8N139 1617 aa36.03■■■■□ 3.36
SENP6-211ENST00000493959 TIAM1Q13009 1591 aa36■■■■□ 3.35
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SENP6-211ENST00000493959 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.93■■■■□ 3.34
SENP6-211ENST00000493959 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
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SENP6-211ENST00000493959 AGLP35573 1532 aa35.84■■■■□ 3.33
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SENP6-211ENST00000493959 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.65■■■■□ 3.3
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SENP6-211ENST00000493959 PLXNC1O60486 1568 aa35.64■■■■□ 3.3
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SENP6-211ENST00000493959 TSPY4P0CV99 314 aa35.57■■■■□ 3.28
SENP6-211ENST00000493959 TSPY10P0CW01 314 aa35.57■■■■□ 3.28
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SENP6-211ENST00000493959 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.56■■■■□ 3.28
SENP6-211ENST00000493959 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.54■■■■□ 3.28
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SENP6-211ENST00000493959 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.34■■■■□ 3.25
SENP6-211ENST00000493959 STRCQ7RTU9 1775 aa35.33■■■■□ 3.25
SENP6-211ENST00000493959 ABCC5O15440 1437 aa35.32■■■■□ 3.25
SENP6-211ENST00000493959 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.32■■■■□ 3.25
SENP6-211ENST00000493959 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
SENP6-211ENST00000493959 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.31■■■■□ 3.24
SENP6-211ENST00000493959 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.31■■■■□ 3.24
SENP6-211ENST00000493959 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.26■■■■□ 3.24
SENP6-211ENST00000493959 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.24■■■■□ 3.23
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