RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492979.2

SSC4D-202, Transcript of scavenger receptor cysteine rich family member with 4 domains, humanhuman

TSL 5

Gene SSC4D, Length 1,224 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4D-202ENST00000492979 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.33■■■□□ 2.45
SSC4D-202ENST00000492979 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.29■■■□□ 2.44
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SSC4D-202ENST00000492979 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.25■■■□□ 2.43
SSC4D-202ENST00000492979 PREX2Q70Z35 1606 aa30.24■■■□□ 2.43
SSC4D-202ENST00000492979 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.24■■■□□ 2.43
SSC4D-202ENST00000492979 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.23■■■□□ 2.43
SSC4D-202ENST00000492979 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.21■■■□□ 2.43
SSC4D-202ENST00000492979 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.2■■■□□ 2.43
SSC4D-202ENST00000492979 KDM5CP41229 1560 aa30.2■■■□□ 2.42
SSC4D-202ENST00000492979 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
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SSC4D-202ENST00000492979 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.16■■■□□ 2.42
SSC4D-202ENST00000492979 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.16■■■□□ 2.42
SSC4D-202ENST00000492979 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.15■■■□□ 2.42
SSC4D-202ENST00000492979 ATP10AO60312 1499 aa30.14■■■□□ 2.42
SSC4D-202ENST00000492979 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.14■■■□□ 2.42
SSC4D-202ENST00000492979 ABCC1P33527 1531 aa30.14■■■□□ 2.42
SSC4D-202ENST00000492979 AFAP1Q8N556 730 aa30.13■■■□□ 2.41
SSC4D-202ENST00000492979 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.13■■■□□ 2.41
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SSC4D-202ENST00000492979 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.11■■■□□ 2.41
SSC4D-202ENST00000492979 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.11■■■□□ 2.41
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SSC4D-202ENST00000492979 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.07■■■□□ 2.4
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SSC4D-202ENST00000492979 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.06■■■□□ 2.4
SSC4D-202ENST00000492979 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.06■■■□□ 2.4
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SSC4D-202ENST00000492979 MAP3K1Q13233 1512 aa30.05■■■□□ 2.4
SSC4D-202ENST00000492979 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
SSC4D-202ENST00000492979 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.03■■■□□ 2.4
SSC4D-202ENST00000492979 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.03■■■□□ 2.4
SSC4D-202ENST00000492979 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.02■■■□□ 2.4
SSC4D-202ENST00000492979 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30■■■□□ 2.39
SSC4D-202ENST00000492979 TIAM1Q13009 1591 aa29.99■■■□□ 2.39
SSC4D-202ENST00000492979 MADDQ8WXG6 1647 aa29.97■■■□□ 2.39
SSC4D-202ENST00000492979 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.97■■■□□ 2.39
SSC4D-202ENST00000492979 AGLP35573 1532 aa29.96■■■□□ 2.39
SSC4D-202ENST00000492979 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
SSC4D-202ENST00000492979 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.92■■■□□ 2.38
SSC4D-202ENST00000492979 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.92■■■□□ 2.38
SSC4D-202ENST00000492979 NCOA2Q15596 1464 aa29.92■■■□□ 2.38
SSC4D-202ENST00000492979 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.92■■■□□ 2.38
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SSC4D-202ENST00000492979 MBD5Q9P267 1494 aa29.9■■■□□ 2.38
SSC4D-202ENST00000492979 ABCA6Q8N139 1617 aa29.89■■■□□ 2.38
SSC4D-202ENST00000492979 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.89■■■□□ 2.38
SSC4D-202ENST00000492979 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
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SSC4D-202ENST00000492979 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.83■■■□□ 2.37
SSC4D-202ENST00000492979 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
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SSC4D-202ENST00000492979 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.79■■■□□ 2.36
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SSC4D-202ENST00000492979 PLXNC1O60486 1568 aa29.73■■■□□ 2.35
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SSC4D-202ENST00000492979 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.72■■■□□ 2.35
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SSC4D-202ENST00000492979 A2MP01023 1474 aa29.71■■■□□ 2.35
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SSC4D-202ENST00000492979 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.7■■■□□ 2.35
SSC4D-202ENST00000492979 APLP2Q06481 763 aa29.68■■■□□ 2.34
SSC4D-202ENST00000492979 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.68■■■□□ 2.34
SSC4D-202ENST00000492979 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
SSC4D-202ENST00000492979 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.66■■■□□ 2.34
SSC4D-202ENST00000492979 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
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SSC4D-202ENST00000492979 TSPY10P0CW01 314 aa29.61■■■□□ 2.33
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SSC4D-202ENST00000492979 MROH2AA6NES4 1674 aa29.56■■■□□ 2.32
SSC4D-202ENST00000492979 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.56■■■□□ 2.32
SSC4D-202ENST00000492979 NPATQ14207 1427 aa29.54■■■□□ 2.32
SSC4D-202ENST00000492979 C3P01024 1663 aa29.53■■■□□ 2.32
SSC4D-202ENST00000492979 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.53■■■□□ 2.32
SSC4D-202ENST00000492979 ZMYM3Q14202 1370 aa29.52■■■□□ 2.32
SSC4D-202ENST00000492979 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.51■■■□□ 2.32
SSC4D-202ENST00000492979 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.47■■■□□ 2.31
SSC4D-202ENST00000492979 GGT6Q6P531 493 aa29.47■■■□□ 2.31
SSC4D-202ENST00000492979 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SSC4D-202ENST00000492979 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.45■■■□□ 2.31
SSC4D-202ENST00000492979 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.45■■■□□ 2.3
SSC4D-202ENST00000492979 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.43■■■□□ 2.3
SSC4D-202ENST00000492979 HSPA2P54652 639 aa29.43■■■□□ 2.3
SSC4D-202ENST00000492979 KIF3BO15066 747 aa29.42■■■□□ 2.3
SSC4D-202ENST00000492979 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.41■■■□□ 2.3
SSC4D-202ENST00000492979 ABCC5O15440 1437 aa29.4■■■□□ 2.3
SSC4D-202ENST00000492979 PTPRKQ15262 1439 aa29.38■■■□□ 2.29
SSC4D-202ENST00000492979 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
SSC4D-202ENST00000492979 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
SSC4D-202ENST00000492979 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.33■■■□□ 2.29
SSC4D-202ENST00000492979 DAPK1P53355 1430 aa29.33■■■□□ 2.29
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