RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.9■■■□□ 2.86
NELFE-212ENST00000492539 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
NELFE-212ENST00000492539 KIF14Q15058 1648 aa32.9■■■□□ 2.86
NELFE-212ENST00000492539 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.9■■■□□ 2.86
NELFE-212ENST00000492539 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
NELFE-212ENST00000492539 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
NELFE-212ENST00000492539 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.86■■■□□ 2.85
NELFE-212ENST00000492539 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
NELFE-212ENST00000492539 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.8■■■□□ 2.84
NELFE-212ENST00000492539 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.78■■■□□ 2.84
NELFE-212ENST00000492539 CLIP1P30622 1438 aa32.77■■■□□ 2.84
NELFE-212ENST00000492539 ATP10AO60312 1499 aa32.75■■■□□ 2.83
NELFE-212ENST00000492539 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.74■■■□□ 2.83
NELFE-212ENST00000492539 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.73■■■□□ 2.83
NELFE-212ENST00000492539 KDM5CP41229 1560 aa32.73■■■□□ 2.83
NELFE-212ENST00000492539 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.73■■■□□ 2.83
NELFE-212ENST00000492539 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.72■■■□□ 2.83
NELFE-212ENST00000492539 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.71■■■□□ 2.83
NELFE-212ENST00000492539 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.69■■■□□ 2.82
NELFE-212ENST00000492539 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.68■■■□□ 2.82
NELFE-212ENST00000492539 MLECQ14165 292 aa32.67■■■□□ 2.82
NELFE-212ENST00000492539 PREX2Q70Z35 1606 aa32.66■■■□□ 2.82
NELFE-212ENST00000492539 FBXO41Q8TF61 875 aa32.62■■■□□ 2.81
NELFE-212ENST00000492539 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.62■■■□□ 2.81
NELFE-212ENST00000492539 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.61■■■□□ 2.81
NELFE-212ENST00000492539 AFAP1Q8N556 730 aa32.61■■■□□ 2.81
NELFE-212ENST00000492539 REREQ9P2R6 1566 aa32.59■■■□□ 2.81
NELFE-212ENST00000492539 ABCC1P33527 1531 aa32.59■■■□□ 2.81
NELFE-212ENST00000492539 HSPA2P54652 639 aa32.58■■■□□ 2.81
NELFE-212ENST00000492539 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.57■■■□□ 2.8
NELFE-212ENST00000492539 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.57■■■□□ 2.8
NELFE-212ENST00000492539 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.56■■■□□ 2.8
NELFE-212ENST00000492539 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.56■■■□□ 2.8
NELFE-212ENST00000492539 ABCA6Q8N139 1617 aa32.56■■■□□ 2.8
NELFE-212ENST00000492539 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.54■■■□□ 2.8
NELFE-212ENST00000492539 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.51■■■□□ 2.79
NELFE-212ENST00000492539 AGLP35573 1532 aa32.46■■■□□ 2.79
NELFE-212ENST00000492539 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.46■■■□□ 2.79
NELFE-212ENST00000492539 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.45■■■□□ 2.79
NELFE-212ENST00000492539 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
NELFE-212ENST00000492539 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
NELFE-212ENST00000492539 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.41■■■□□ 2.78
NELFE-212ENST00000492539 C3P01024 1663 aa32.39■■■□□ 2.78
NELFE-212ENST00000492539 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
NELFE-212ENST00000492539 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.34■■■□□ 2.77
NELFE-212ENST00000492539 STRCQ7RTU9 1775 aa32.33■■■□□ 2.77
NELFE-212ENST00000492539 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.33■■■□□ 2.77
NELFE-212ENST00000492539 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
NELFE-212ENST00000492539 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.26■■■□□ 2.75
NELFE-212ENST00000492539 CERKQ8TCT0 537 aa32.25■■■□□ 2.75
NELFE-212ENST00000492539 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.25■■■□□ 2.75
NELFE-212ENST00000492539 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
NELFE-212ENST00000492539 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.23■■■□□ 2.75
NELFE-212ENST00000492539 ATP7AQ04656 1500 aa32.22■■■□□ 2.75
NELFE-212ENST00000492539 MROH2AA6NES4 1674 aa32.22■■■□□ 2.75
NELFE-212ENST00000492539 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
NELFE-212ENST00000492539 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.21■■■□□ 2.75
NELFE-212ENST00000492539 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
NELFE-212ENST00000492539 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.2■■■□□ 2.75
NELFE-212ENST00000492539 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
NELFE-212ENST00000492539 PLXNC1O60486 1568 aa32.19■■■□□ 2.74
NELFE-212ENST00000492539 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
NELFE-212ENST00000492539 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.19■■■□□ 2.74
NELFE-212ENST00000492539 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.18■■■□□ 2.74
NELFE-212ENST00000492539 TIAM1Q13009 1591 aa32.16■■■□□ 2.74
NELFE-212ENST00000492539 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.16■■■□□ 2.74
NELFE-212ENST00000492539 A2MP01023 1474 aa32.12■■■□□ 2.73
NELFE-212ENST00000492539 PTPRTO14522 1441 aa32.11■■■□□ 2.73
NELFE-212ENST00000492539 NPATQ14207 1427 aa32.11■■■□□ 2.73
NELFE-212ENST00000492539 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.09■■■□□ 2.73
NELFE-212ENST00000492539 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
NELFE-212ENST00000492539 ZMYM3Q14202 1370 aa32.07■■■□□ 2.73
NELFE-212ENST00000492539 CEP162Q5TB80 1403 aa32.07■■■□□ 2.72
NELFE-212ENST00000492539 MBD5Q9P267 1494 aa32.05■■■□□ 2.72
NELFE-212ENST00000492539 NCOA1Q15788 1441 aa32.05■■■□□ 2.72
NELFE-212ENST00000492539 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
NELFE-212ENST00000492539 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
NELFE-212ENST00000492539 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.99■■■□□ 2.71
NELFE-212ENST00000492539 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.98■■■□□ 2.71
NELFE-212ENST00000492539 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.98■■■□□ 2.71
NELFE-212ENST00000492539 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.96■■■□□ 2.71
NELFE-212ENST00000492539 PTPRKQ15262 1439 aa31.95■■■□□ 2.71
NELFE-212ENST00000492539 GGT6Q6P531 493 aa31.93■■■□□ 2.7
NELFE-212ENST00000492539 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.93■■■□□ 2.7
NELFE-212ENST00000492539 NCOA2Q15596 1464 aa31.92■■■□□ 2.7
NELFE-212ENST00000492539 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
NELFE-212ENST00000492539 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.89■■■□□ 2.7
NELFE-212ENST00000492539 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.89■■■□□ 2.7
NELFE-212ENST00000492539 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
NELFE-212ENST00000492539 PLA2R1Q13018 1463 aa31.87■■■□□ 2.69
NELFE-212ENST00000492539 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.85■■■□□ 2.69
NELFE-212ENST00000492539 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
NELFE-212ENST00000492539 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.81■■■□□ 2.68
NELFE-212ENST00000492539 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.8■■■□□ 2.68
NELFE-212ENST00000492539 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.8■■■□□ 2.68
NELFE-212ENST00000492539 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.8■■■□□ 2.68
NELFE-212ENST00000492539 PKD2Q13563 968 aa31.77■■■□□ 2.68
NELFE-212ENST00000492539 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.77■■■□□ 2.68
NELFE-212ENST00000492539 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.76■■■□□ 2.68
NELFE-212ENST00000492539 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.76■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms