RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491859.5

USP19-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-215	ENST00000491859	ADGRL1	O94910	1474 aa		29.5	■■■□□ 2.31
USP19-215	ENST00000491859	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		29.47	■■■□□ 2.31
USP19-215	ENST00000491859	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		29.47	■■■□□ 2.31
USP19-215	ENST00000491859	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	29.44	■■■□□ 2.3
USP19-215	ENST00000491859	TIAM1	Q13009	1591 aa		29.43	■■■□□ 2.3
USP19-215	ENST00000491859	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		29.43	■■■□□ 2.3
USP19-215	ENST00000491859	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		29.4	■■■□□ 2.3
USP19-215	ENST00000491859	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		29.4	■■■□□ 2.3
USP19-215	ENST00000491859	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		29.39	■■■□□ 2.3
USP19-215	ENST00000491859	ABCC1	P33527	1531 aa		29.35	■■■□□ 2.29
USP19-215	ENST00000491859	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	29.35	■■■□□ 2.29
USP19-215	ENST00000491859	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
USP19-215	ENST00000491859	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		29.34	■■■□□ 2.29
USP19-215	ENST00000491859	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		29.34	■■■□□ 2.29
USP19-215	ENST00000491859	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		29.34	■■■□□ 2.29
USP19-215	ENST00000491859	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		29.32	■■■□□ 2.28
USP19-215	ENST00000491859	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		29.3	■■■□□ 2.28
USP19-215	ENST00000491859	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		29.3	■■■□□ 2.28
USP19-215	ENST00000491859	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		29.28	■■■□□ 2.28
USP19-215	ENST00000491859	MAP3K1	Q13233	1512 aa		29.27	■■■□□ 2.28
USP19-215	ENST00000491859	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
USP19-215	ENST00000491859	KDM5C	P41229	1560 aa		29.26	■■■□□ 2.28
USP19-215	ENST00000491859	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		29.26	■■■□□ 2.27
USP19-215	ENST00000491859	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		29.26	■■■□□ 2.27
USP19-215	ENST00000491859	NCOA2	Q15596	1464 aa		29.25	■■■□□ 2.27
USP19-215	ENST00000491859	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		29.25	■■■□□ 2.27
USP19-215	ENST00000491859	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		29.24	■■■□□ 2.27
USP19-215	ENST00000491859	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
USP19-215	ENST00000491859	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		29.24	■■■□□ 2.27
USP19-215	ENST00000491859	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		29.2	■■■□□ 2.27
USP19-215	ENST00000491859	AFAP1	Q8N556	730 aa		29.2	■■■□□ 2.26
USP19-215	ENST00000491859	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
USP19-215	ENST00000491859	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		29.18	■■■□□ 2.26
USP19-215	ENST00000491859	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		29.17	■■■□□ 2.26
USP19-215	ENST00000491859	APLP2	Q06481	763 aa		29.17	■■■□□ 2.26
USP19-215	ENST00000491859	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		29.17	■■■□□ 2.26
USP19-215	ENST00000491859	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		29.17	■■■□□ 2.26
USP19-215	ENST00000491859	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
USP19-215	ENST00000491859	ABCA6	Q8N139	1617 aa		29.13	■■■□□ 2.25
USP19-215	ENST00000491859	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		29.13	■■■□□ 2.25
USP19-215	ENST00000491859	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		29.12	■■■□□ 2.25
USP19-215	ENST00000491859	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		29.12	■■■□□ 2.25
USP19-215	ENST00000491859	ATP10A	O60312	1499 aa		29.12	■■■□□ 2.25
USP19-215	ENST00000491859	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		29.12	■■■□□ 2.25
USP19-215	ENST00000491859	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		29.11	■■■□□ 2.25
USP19-215	ENST00000491859	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		29.11	■■■□□ 2.25
USP19-215	ENST00000491859	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	29.1	■■■□□ 2.25
USP19-215	ENST00000491859	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
USP19-215	ENST00000491859	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		29.07	■■■□□ 2.24
USP19-215	ENST00000491859	MADD	Q8WXG6	1647 aa		29.07	■■■□□ 2.24
USP19-215	ENST00000491859	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
USP19-215	ENST00000491859	ATP7A	Q04656	1500 aa		29.03	■■■□□ 2.24
USP19-215	ENST00000491859	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
USP19-215	ENST00000491859	RERE	Q9P2R6	1566 aa		29.02	■■■□□ 2.24
USP19-215	ENST00000491859	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
USP19-215	ENST00000491859	MBD5	Q9P267	1494 aa		29	■■■□□ 2.23
USP19-215	ENST00000491859	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		29	■■■□□ 2.23
USP19-215	ENST00000491859	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.99	■■■□□ 2.23
USP19-215	ENST00000491859	MLEC	Q14165	292 aa		28.97	■■■□□ 2.23
USP19-215	ENST00000491859	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		28.96	■■■□□ 2.23
USP19-215	ENST00000491859	PTPRM	P28827	1452 aa		28.95	■■■□□ 2.22
USP19-215	ENST00000491859	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		28.93	■■■□□ 2.22
USP19-215	ENST00000491859	MIA2	Q96PC5	1412 aa		28.93	■■■□□ 2.22
USP19-215	ENST00000491859	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		28.91	■■■□□ 2.22
USP19-215	ENST00000491859	AGL	P35573	1532 aa		28.9	■■■□□ 2.22
USP19-215	ENST00000491859	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		28.87	■■■□□ 2.21
USP19-215	ENST00000491859	PLXNC1	O60486	1568 aa		28.86	■■■□□ 2.21
USP19-215	ENST00000491859	A2M	P01023	1474 aa		28.85	■■■□□ 2.21
USP19-215	ENST00000491859	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.85	■■■□□ 2.21
USP19-215	ENST00000491859	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.84	■■■□□ 2.21
USP19-215	ENST00000491859	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.82	■■■□□ 2.2
USP19-215	ENST00000491859	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		28.79	■■■□□ 2.2
USP19-215	ENST00000491859	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		28.78	■■■□□ 2.2
USP19-215	ENST00000491859	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		28.78	■■■□□ 2.2
USP19-215	ENST00000491859	TSPY4	P0CV99	314 aa		28.77	■■■□□ 2.2
USP19-215	ENST00000491859	TSPY10	P0CW01	314 aa		28.77	■■■□□ 2.2
USP19-215	ENST00000491859	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
USP19-215	ENST00000491859	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
USP19-215	ENST00000491859	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
USP19-215	ENST00000491859	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
USP19-215	ENST00000491859	C3	P01024	1663 aa		28.69	■■■□□ 2.18
USP19-215	ENST00000491859	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		28.67	■■■□□ 2.18
USP19-215	ENST00000491859	ABCC5	O15440	1437 aa		28.67	■■■□□ 2.18
USP19-215	ENST00000491859	DAPK1	P53355	1430 aa		28.67	■■■□□ 2.18
USP19-215	ENST00000491859	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
USP19-215	ENST00000491859	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.66	■■■□□ 2.18
USP19-215	ENST00000491859	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.66	■■■□□ 2.18
USP19-215	ENST00000491859	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
USP19-215	ENST00000491859	GGT6	Q6P531	493 aa		28.64	■■■□□ 2.18
USP19-215	ENST00000491859	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
USP19-215	ENST00000491859	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
USP19-215	ENST00000491859	KIF3B	O15066	747 aa		28.6	■■■□□ 2.17
USP19-215	ENST00000491859	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.6	■■■□□ 2.17
USP19-215	ENST00000491859	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		28.59	■■■□□ 2.17
USP19-215	ENST00000491859	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
USP19-215	ENST00000491859	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		28.57	■■■□□ 2.16
USP19-215	ENST00000491859	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
USP19-215	ENST00000491859	KIF15	Q9NS87	1388 aa		28.55	■■■□□ 2.16
USP19-215	ENST00000491859	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
USP19-215	ENST00000491859	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		28.52	■■■□□ 2.16

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms