RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491530.5

CHTF18-211, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 819 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-211ENST00000491530 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CHTF18-211ENST00000491530 AKNAQ7Z591 1439 aa24.4■■□□□ 1.5
CHTF18-211ENST00000491530 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CHTF18-211ENST00000491530 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.38■■□□□ 1.49
CHTF18-211ENST00000491530 PREX2Q70Z35 1606 aa24.36■■□□□ 1.49
CHTF18-211ENST00000491530 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.36■■□□□ 1.49
CHTF18-211ENST00000491530 TIAM1Q13009 1591 aa24.36■■□□□ 1.49
CHTF18-211ENST00000491530 MADDQ8WXG6 1647 aa24.35■■□□□ 1.49
CHTF18-211ENST00000491530 PLCH2O75038 1416 aa24.34■■□□□ 1.49
CHTF18-211ENST00000491530 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.33■■□□□ 1.49
CHTF18-211ENST00000491530 MAP3K1Q13233 1512 aa24.33■■□□□ 1.49
CHTF18-211ENST00000491530 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.32■■□□□ 1.48
CHTF18-211ENST00000491530 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CHTF18-211ENST00000491530 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.27■■□□□ 1.48
CHTF18-211ENST00000491530 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.27■■□□□ 1.48
CHTF18-211ENST00000491530 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CHTF18-211ENST00000491530 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.27■■□□□ 1.48
CHTF18-211ENST00000491530 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.26■■□□□ 1.47
CHTF18-211ENST00000491530 KDM5CP41229 1560 aa24.25■■□□□ 1.47
CHTF18-211ENST00000491530 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.24■■□□□ 1.47
CHTF18-211ENST00000491530 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.24■■□□□ 1.47
CHTF18-211ENST00000491530 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.24■■□□□ 1.47
CHTF18-211ENST00000491530 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.23■■□□□ 1.47
CHTF18-211ENST00000491530 ABCC1P33527 1531 aa24.21■■□□□ 1.47
CHTF18-211ENST00000491530 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.21■■□□□ 1.47
CHTF18-211ENST00000491530 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.21■■□□□ 1.47
CHTF18-211ENST00000491530 MLECQ14165 292 aa24.21■■□□□ 1.47
CHTF18-211ENST00000491530 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CHTF18-211ENST00000491530 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.2■■□□□ 1.47
CHTF18-211ENST00000491530 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.19■■□□□ 1.46
CHTF18-211ENST00000491530 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.18■■□□□ 1.46
CHTF18-211ENST00000491530 APLP2Q06481 763 aa24.17■■□□□ 1.46
CHTF18-211ENST00000491530 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.14■■□□□ 1.46
CHTF18-211ENST00000491530 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.13■■□□□ 1.45
CHTF18-211ENST00000491530 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.12■■□□□ 1.45
CHTF18-211ENST00000491530 HSPA2P54652 639 aa24.12■■□□□ 1.45
CHTF18-211ENST00000491530 ABCA6Q8N139 1617 aa24.12■■□□□ 1.45
CHTF18-211ENST00000491530 FBXO41Q8TF61 875 aa24.11■■□□□ 1.45
CHTF18-211ENST00000491530 REREQ9P2R6 1566 aa24.11■■□□□ 1.45
CHTF18-211ENST00000491530 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.1■■□□□ 1.45
CHTF18-211ENST00000491530 ATP10AO60312 1499 aa24.1■■□□□ 1.45
CHTF18-211ENST00000491530 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.1■■□□□ 1.45
CHTF18-211ENST00000491530 NCOA2Q15596 1464 aa24.09■■□□□ 1.45
CHTF18-211ENST00000491530 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.08■■□□□ 1.45
CHTF18-211ENST00000491530 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.08■■□□□ 1.44
CHTF18-211ENST00000491530 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.07■■□□□ 1.44
CHTF18-211ENST00000491530 AFAP1Q8N556 730 aa24.06■■□□□ 1.44
CHTF18-211ENST00000491530 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CHTF18-211ENST00000491530 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.03■■□□□ 1.44
CHTF18-211ENST00000491530 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.02■■□□□ 1.44
CHTF18-211ENST00000491530 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CHTF18-211ENST00000491530 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.01■■□□□ 1.43
CHTF18-211ENST00000491530 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CHTF18-211ENST00000491530 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24■■□□□ 1.43
CHTF18-211ENST00000491530 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CHTF18-211ENST00000491530 AGLP35573 1532 aa23.94■■□□□ 1.42
CHTF18-211ENST00000491530 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.93■■□□□ 1.42
CHTF18-211ENST00000491530 PLXNC1O60486 1568 aa23.91■■□□□ 1.42
CHTF18-211ENST00000491530 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.91■■□□□ 1.42
CHTF18-211ENST00000491530 ATP7AQ04656 1500 aa23.9■■□□□ 1.42
CHTF18-211ENST00000491530 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.9■■□□□ 1.42
CHTF18-211ENST00000491530 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.9■■□□□ 1.42
CHTF18-211ENST00000491530 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CHTF18-211ENST00000491530 MIA2Q96PC5 1412 aa23.85■■□□□ 1.41
CHTF18-211ENST00000491530 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CHTF18-211ENST00000491530 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.85■■□□□ 1.41
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CHTF18-211ENST00000491530 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.84■■□□□ 1.41
CHTF18-211ENST00000491530 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.84■■□□□ 1.41
CHTF18-211ENST00000491530 C3P01024 1663 aa23.83■■□□□ 1.41
CHTF18-211ENST00000491530 CERKQ8TCT0 537 aa23.83■■□□□ 1.41
CHTF18-211ENST00000491530 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.82■■□□□ 1.4
CHTF18-211ENST00000491530 MBD5Q9P267 1494 aa23.82■■□□□ 1.4
CHTF18-211ENST00000491530 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.82■■□□□ 1.4
CHTF18-211ENST00000491530 MROH2AA6NES4 1674 aa23.81■■□□□ 1.4
CHTF18-211ENST00000491530 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CHTF18-211ENST00000491530 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.78■■□□□ 1.4
CHTF18-211ENST00000491530 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.43e-7■■■□□ 16
CHTF18-211ENST00000491530 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CHTF18-211ENST00000491530 STRCQ7RTU9 1775 aa23.74■■□□□ 1.39
CHTF18-211ENST00000491530 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.74■■□□□ 1.39
CHTF18-211ENST00000491530 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.72■■□□□ 1.39
CHTF18-211ENST00000491530 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CHTF18-211ENST00000491530 A2MP01023 1474 aa23.7■■□□□ 1.38
CHTF18-211ENST00000491530 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.7■■□□□ 1.38
CHTF18-211ENST00000491530 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CHTF18-211ENST00000491530 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.69■■□□□ 1.38
CHTF18-211ENST00000491530 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CHTF18-211ENST00000491530 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.68■■□□□ 1.38
CHTF18-211ENST00000491530 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.68■■□□□ 1.38
CHTF18-211ENST00000491530 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CHTF18-211ENST00000491530 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CHTF18-211ENST00000491530 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
CHTF18-211ENST00000491530 ABCC5O15440 1437 aa23.63■■□□□ 1.37
CHTF18-211ENST00000491530 ZMYM3Q14202 1370 aa23.63■■□□□ 1.37
CHTF18-211ENST00000491530 PTPRTO14522 1441 aa23.62■■□□□ 1.37
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CHTF18-211ENST00000491530 DAPK1P53355 1430 aa23.61■■□□□ 1.37
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