RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491472.2

EBF4-208, Transcript of early B cell factor 4, humanhuman

TSL 5

Gene EBF4, Length 665 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4-208ENST00000491472 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.41■■■■□ 3.42
EBF4-208ENST00000491472 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.39■■■■□ 3.42
EBF4-208ENST00000491472 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.39■■■■□ 3.42
EBF4-208ENST00000491472 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.34■■■■□ 3.41
EBF4-208ENST00000491472 PREX2Q70Z35 1606 aa36.34■■■■□ 3.41
EBF4-208ENST00000491472 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.32■■■■□ 3.4
EBF4-208ENST00000491472 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.29■■■■□ 3.4
EBF4-208ENST00000491472 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
EBF4-208ENST00000491472 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.27■■■■□ 3.4
EBF4-208ENST00000491472 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.26■■■■□ 3.39
EBF4-208ENST00000491472 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.25■■■■□ 3.39
EBF4-208ENST00000491472 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.24■■■■□ 3.39
EBF4-208ENST00000491472 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.24■■■■□ 3.39
EBF4-208ENST00000491472 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.23■■■■□ 3.39
EBF4-208ENST00000491472 KDM5CP41229 1560 aa36.19■■■■□ 3.38
EBF4-208ENST00000491472 ABCC1P33527 1531 aa36.17■■■■□ 3.38
EBF4-208ENST00000491472 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
EBF4-208ENST00000491472 ATP10AO60312 1499 aa36.17■■■■□ 3.38
EBF4-208ENST00000491472 AFAP1Q8N556 730 aa36.16■■■■□ 3.38
EBF4-208ENST00000491472 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.14■■■■□ 3.38
EBF4-208ENST00000491472 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.13■■■■□ 3.37
EBF4-208ENST00000491472 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.12■■■■□ 3.37
EBF4-208ENST00000491472 PTPRMP28827 1452 aa36.11■■■■□ 3.37
EBF4-208ENST00000491472 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.1■■■■□ 3.37
EBF4-208ENST00000491472 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.1■■■■□ 3.37
EBF4-208ENST00000491472 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.1■■■■□ 3.37
EBF4-208ENST00000491472 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.09■■■■□ 3.37
EBF4-208ENST00000491472 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.08■■■■□ 3.37
EBF4-208ENST00000491472 MADDQ8WXG6 1647 aa36.08■■■■□ 3.37
EBF4-208ENST00000491472 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
EBF4-208ENST00000491472 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.06■■■■□ 3.36
EBF4-208ENST00000491472 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.05■■■■□ 3.36
EBF4-208ENST00000491472 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
EBF4-208ENST00000491472 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.05■■■■□ 3.36
EBF4-208ENST00000491472 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.04■■■■□ 3.36
EBF4-208ENST00000491472 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.03■■■■□ 3.36
EBF4-208ENST00000491472 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.02■■■■□ 3.36
EBF4-208ENST00000491472 TIAM1Q13009 1591 aa36■■■■□ 3.35
EBF4-208ENST00000491472 REREQ9P2R6 1566 aa36■■■■□ 3.35
EBF4-208ENST00000491472 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.98■■■■□ 3.35
EBF4-208ENST00000491472 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
EBF4-208ENST00000491472 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.96■■■■□ 3.35
EBF4-208ENST00000491472 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
EBF4-208ENST00000491472 ABCA6Q8N139 1617 aa35.94■■■■□ 3.34
EBF4-208ENST00000491472 MAP3K1Q13233 1512 aa35.93■■■■□ 3.34
EBF4-208ENST00000491472 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.92■■■■□ 3.34
EBF4-208ENST00000491472 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.92■■■■□ 3.34
EBF4-208ENST00000491472 MLECQ14165 292 aa35.92■■■■□ 3.34
EBF4-208ENST00000491472 NCOA2Q15596 1464 aa35.9■■■■□ 3.34
EBF4-208ENST00000491472 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.89■■■■□ 3.34
EBF4-208ENST00000491472 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
EBF4-208ENST00000491472 AGLP35573 1532 aa35.87■■■■□ 3.33
EBF4-208ENST00000491472 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.86■■■■□ 3.33
EBF4-208ENST00000491472 ATP7AQ04656 1500 aa35.8■■■■□ 3.32
EBF4-208ENST00000491472 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
EBF4-208ENST00000491472 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
EBF4-208ENST00000491472 MBD5Q9P267 1494 aa35.77■■■■□ 3.32
EBF4-208ENST00000491472 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.75■■■■□ 3.31
EBF4-208ENST00000491472 APLP2Q06481 763 aa35.73■■■■□ 3.31
EBF4-208ENST00000491472 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.71■■■■□ 3.31
EBF4-208ENST00000491472 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.69■■■■□ 3.3
EBF4-208ENST00000491472 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
EBF4-208ENST00000491472 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
EBF4-208ENST00000491472 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.67■■■■□ 3.3
EBF4-208ENST00000491472 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.66■■■■□ 3.3
EBF4-208ENST00000491472 A2MP01023 1474 aa35.66■■■■□ 3.3
EBF4-208ENST00000491472 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.65■■■■□ 3.3
EBF4-208ENST00000491472 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.65■■■■□ 3.3
EBF4-208ENST00000491472 PLXNC1O60486 1568 aa35.64■■■■□ 3.3
EBF4-208ENST00000491472 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.63■■■■□ 3.29
EBF4-208ENST00000491472 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.61■■■■□ 3.29
EBF4-208ENST00000491472 MIA2Q96PC5 1412 aa35.6■■■■□ 3.29
EBF4-208ENST00000491472 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.58■■■■□ 3.29
EBF4-208ENST00000491472 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
EBF4-208ENST00000491472 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
EBF4-208ENST00000491472 TSPY4P0CV99 314 aa35.55■■■■□ 3.28
EBF4-208ENST00000491472 TSPY10P0CW01 314 aa35.55■■■■□ 3.28
EBF4-208ENST00000491472 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.54■■■■□ 3.28
EBF4-208ENST00000491472 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.53■■■■□ 3.28
EBF4-208ENST00000491472 C3P01024 1663 aa35.52■■■■□ 3.28
EBF4-208ENST00000491472 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
EBF4-208ENST00000491472 MROH2AA6NES4 1674 aa35.51■■■■□ 3.28
EBF4-208ENST00000491472 GGT6Q6P531 493 aa35.44■■■■□ 3.26
EBF4-208ENST00000491472 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.43■■■■□ 3.26
EBF4-208ENST00000491472 HSPA2P54652 639 aa35.43■■■■□ 3.26
EBF4-208ENST00000491472 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.42■■■■□ 3.26
EBF4-208ENST00000491472 ZMYM3Q14202 1370 aa35.41■■■■□ 3.26
EBF4-208ENST00000491472 NPATQ14207 1427 aa35.39■■■■□ 3.26
EBF4-208ENST00000491472 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
EBF4-208ENST00000491472 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.34■■■■□ 3.25
EBF4-208ENST00000491472 KIF3BO15066 747 aa35.34■■■■□ 3.25
EBF4-208ENST00000491472 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.33■■■■□ 3.25
EBF4-208ENST00000491472 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.31■■■■□ 3.24
EBF4-208ENST00000491472 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
EBF4-208ENST00000491472 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.27■■■■□ 3.24
EBF4-208ENST00000491472 PTPRKQ15262 1439 aa35.23■■■■□ 3.23
EBF4-208ENST00000491472 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
EBF4-208ENST00000491472 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.22■■■■□ 3.23
EBF4-208ENST00000491472 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.22■■■■□ 3.23
EBF4-208ENST00000491472 ABCC5O15440 1437 aa35.22■■■■□ 3.23
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