RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491295.1

GGA1-223, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1, human

TSL 4

Gene GGA1, Length 594 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA1-223	ENST00000491295	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		29.27	■■■□□ 2.28
GGA1-223	ENST00000491295	KIF14	Q15058	1648 aa		29.27	■■■□□ 2.28
GGA1-223	ENST00000491295	MADD	Q8WXG6	1647 aa		29.23	■■■□□ 2.27
GGA1-223	ENST00000491295	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		29.23	■■■□□ 2.27
GGA1-223	ENST00000491295	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		29.23	■■■□□ 2.27
GGA1-223	ENST00000491295	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		29.22	■■■□□ 2.27
GGA1-223	ENST00000491295	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
GGA1-223	ENST00000491295	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		29.17	■■■□□ 2.26
GGA1-223	ENST00000491295	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GGA1-223	ENST00000491295	ATP10A	O60312	1499 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GGA1-223	ENST00000491295	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		29.16	■■■□□ 2.26
GGA1-223	ENST00000491295	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
GGA1-223	ENST00000491295	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
GGA1-223	ENST00000491295	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GGA1-223	ENST00000491295	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GGA1-223	ENST00000491295	AFAP1	Q8N556	730 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GGA1-223	ENST00000491295	KDM5C	P41229	1560 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GGA1-223	ENST00000491295	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GGA1-223	ENST00000491295	MLEC	Q14165	292 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GGA1-223	ENST00000491295	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GGA1-223	ENST00000491295	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GGA1-223	ENST00000491295	PREX2	Q70Z35	1606 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GGA1-223	ENST00000491295	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		29.02	■■■□□ 2.24
GGA1-223	ENST00000491295	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GGA1-223	ENST00000491295	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		29.01	■■■□□ 2.23
GGA1-223	ENST00000491295	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GGA1-223	ENST00000491295	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GGA1-223	ENST00000491295	ABCC1	P33527	1531 aa		28.96	■■■□□ 2.23
GGA1-223	ENST00000491295	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GGA1-223	ENST00000491295	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GGA1-223	ENST00000491295	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GGA1-223	ENST00000491295	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.92	■■■□□ 2.22
GGA1-223	ENST00000491295	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.89	■■■□□ 2.22
GGA1-223	ENST00000491295	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.21
GGA1-223	ENST00000491295	AGL	P35573	1532 aa		28.88	■■■□□ 2.21
GGA1-223	ENST00000491295	HSPA2	P54652	639 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GGA1-223	ENST00000491295	FBXO41	Q8TF61	875 aa		28.87	■■■□□ 2.21
GGA1-223	ENST00000491295	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
GGA1-223	ENST00000491295	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GGA1-223	ENST00000491295	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.84	■■■□□ 2.21
GGA1-223	ENST00000491295	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
GGA1-223	ENST00000491295	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GGA1-223	ENST00000491295	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GGA1-223	ENST00000491295	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
GGA1-223	ENST00000491295	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.81	■■■□□ 2.2
GGA1-223	ENST00000491295	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.81	■■■□□ 2.2
GGA1-223	ENST00000491295	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
GGA1-223	ENST00000491295	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		28.8	■■■□□ 2.2
GGA1-223	ENST00000491295	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
GGA1-223	ENST00000491295	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
GGA1-223	ENST00000491295	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.79	■■■□□ 2.2
GGA1-223	ENST00000491295	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	28.78	■■■□□ 2.2
GGA1-223	ENST00000491295	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GGA1-223	ENST00000491295	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GGA1-223	ENST00000491295	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.74	■■■□□ 2.19
GGA1-223	ENST00000491295	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GGA1-223	ENST00000491295	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GGA1-223	ENST00000491295	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GGA1-223	ENST00000491295	C3	P01024	1663 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GGA1-223	ENST00000491295	ATP7A	Q04656	1500 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GGA1-223	ENST00000491295	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GGA1-223	ENST00000491295	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
GGA1-223	ENST00000491295	A2M	P01023	1474 aa		28.62	■■■□□ 2.17
GGA1-223	ENST00000491295	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GGA1-223	ENST00000491295	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GGA1-223	ENST00000491295	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GGA1-223	ENST00000491295	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
GGA1-223	ENST00000491295	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GGA1-223	ENST00000491295	NPAT	Q14207	1427 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GGA1-223	ENST00000491295	MBD5	Q9P267	1494 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GGA1-223	ENST00000491295	PLXNC1	O60486	1568 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GGA1-223	ENST00000491295	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GGA1-223	ENST00000491295	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GGA1-223	ENST00000491295	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
GGA1-223	ENST00000491295	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.55	■■■□□ 2.16
GGA1-223	ENST00000491295	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GGA1-223	ENST00000491295	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.52	■■■□□ 2.16
GGA1-223	ENST00000491295	GGT6	Q6P531	493 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GGA1-223	ENST00000491295	PTPRT	O14522	1441 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GGA1-223	ENST00000491295	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
GGA1-223	ENST00000491295	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.47	■■■□□ 2.15
GGA1-223	ENST00000491295	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GGA1-223	ENST00000491295	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GGA1-223	ENST00000491295	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
GGA1-223	ENST00000491295	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GGA1-223	ENST00000491295	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GGA1-223	ENST00000491295	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GGA1-223	ENST00000491295	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.4	■■■□□ 2.14
GGA1-223	ENST00000491295	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.4	■■■□□ 2.14
GGA1-223	ENST00000491295	TSPY4	P0CV99	314 aa		28.4	■■■□□ 2.14
GGA1-223	ENST00000491295	TSPY10	P0CW01	314 aa		28.4	■■■□□ 2.14
GGA1-223	ENST00000491295	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GGA1-223	ENST00000491295	KIF3B	O15066	747 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GGA1-223	ENST00000491295	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GGA1-223	ENST00000491295	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GGA1-223	ENST00000491295	PKD2	Q13563	968 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GGA1-223	ENST00000491295	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
GGA1-223	ENST00000491295	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GGA1-223	ENST00000491295	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GGA1-223	ENST00000491295	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12

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