RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490709.1

GLIS3-216, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 768 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-216ENST00000490709 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.53■■■□□ 2.8
GLIS3-216ENST00000490709 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.5■■■□□ 2.79
GLIS3-216ENST00000490709 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.5■■■□□ 2.79
GLIS3-216ENST00000490709 PREX2Q70Z35 1606 aa32.49■■■□□ 2.79
GLIS3-216ENST00000490709 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.49■■■□□ 2.79
GLIS3-216ENST00000490709 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
GLIS3-216ENST00000490709 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.46■■■□□ 2.79
GLIS3-216ENST00000490709 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.45■■■□□ 2.78
GLIS3-216ENST00000490709 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
GLIS3-216ENST00000490709 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.42■■■□□ 2.78
GLIS3-216ENST00000490709 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.42■■■□□ 2.78
GLIS3-216ENST00000490709 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.41■■■□□ 2.78
GLIS3-216ENST00000490709 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.38■■■□□ 2.77
GLIS3-216ENST00000490709 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.37■■■□□ 2.77
GLIS3-216ENST00000490709 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.37■■■□□ 2.77
GLIS3-216ENST00000490709 AFAP1Q8N556 730 aa32.34■■■□□ 2.77
GLIS3-216ENST00000490709 ABCC1P33527 1531 aa32.33■■■□□ 2.77
GLIS3-216ENST00000490709 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.33■■■□□ 2.77
GLIS3-216ENST00000490709 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
GLIS3-216ENST00000490709 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
GLIS3-216ENST00000490709 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.32■■■□□ 2.76
GLIS3-216ENST00000490709 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.31■■■□□ 2.76
GLIS3-216ENST00000490709 KDM5CP41229 1560 aa32.3■■■□□ 2.76
GLIS3-216ENST00000490709 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.3■■■□□ 2.76
GLIS3-216ENST00000490709 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.29■■■□□ 2.76
GLIS3-216ENST00000490709 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.29■■■□□ 2.76
GLIS3-216ENST00000490709 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.28■■■□□ 2.76
GLIS3-216ENST00000490709 MADDQ8WXG6 1647 aa32.28■■■□□ 2.76
GLIS3-216ENST00000490709 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.27■■■□□ 2.76
GLIS3-216ENST00000490709 ATP10AO60312 1499 aa32.27■■■□□ 2.76
GLIS3-216ENST00000490709 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.26■■■□□ 2.75
GLIS3-216ENST00000490709 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.26■■■□□ 2.75
GLIS3-216ENST00000490709 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
GLIS3-216ENST00000490709 PTPRMP28827 1452 aa32.23■■■□□ 2.75
GLIS3-216ENST00000490709 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.23■■■□□ 2.75
GLIS3-216ENST00000490709 TIAM1Q13009 1591 aa32.21■■■□□ 2.75
GLIS3-216ENST00000490709 MLECQ14165 292 aa32.21■■■□□ 2.75
GLIS3-216ENST00000490709 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
GLIS3-216ENST00000490709 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.19■■■□□ 2.74
GLIS3-216ENST00000490709 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.18■■■□□ 2.74
GLIS3-216ENST00000490709 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.17■■■□□ 2.74
GLIS3-216ENST00000490709 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
GLIS3-216ENST00000490709 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.16■■■□□ 2.74
GLIS3-216ENST00000490709 ABCA6Q8N139 1617 aa32.15■■■□□ 2.74
GLIS3-216ENST00000490709 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.14■■■□□ 2.74
GLIS3-216ENST00000490709 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.12■■■□□ 2.73
GLIS3-216ENST00000490709 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.12■■■□□ 2.73
GLIS3-216ENST00000490709 NCOA2Q15596 1464 aa32.11■■■□□ 2.73
GLIS3-216ENST00000490709 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.1■■■□□ 2.73
GLIS3-216ENST00000490709 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.08■■■□□ 2.73
GLIS3-216ENST00000490709 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.07■■■□□ 2.72
GLIS3-216ENST00000490709 REREQ9P2R6 1566 aa32.07■■■□□ 2.72
GLIS3-216ENST00000490709 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
GLIS3-216ENST00000490709 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
GLIS3-216ENST00000490709 MAP3K1Q13233 1512 aa32.02■■■□□ 2.72
GLIS3-216ENST00000490709 ATP7AQ04656 1500 aa32■■■□□ 2.71
GLIS3-216ENST00000490709 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
GLIS3-216ENST00000490709 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
GLIS3-216ENST00000490709 AGLP35573 1532 aa31.96■■■□□ 2.71
GLIS3-216ENST00000490709 APLP2Q06481 763 aa31.96■■■□□ 2.71
GLIS3-216ENST00000490709 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.94■■■□□ 2.7
GLIS3-216ENST00000490709 MBD5Q9P267 1494 aa31.94■■■□□ 2.7
GLIS3-216ENST00000490709 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
GLIS3-216ENST00000490709 A2MP01023 1474 aa31.86■■■□□ 2.69
GLIS3-216ENST00000490709 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
GLIS3-216ENST00000490709 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.86■■■□□ 2.69
GLIS3-216ENST00000490709 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.85■■■□□ 2.69
GLIS3-216ENST00000490709 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.84■■■□□ 2.69
GLIS3-216ENST00000490709 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.82■■■□□ 2.68
GLIS3-216ENST00000490709 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.82■■■□□ 2.68
GLIS3-216ENST00000490709 PLXNC1O60486 1568 aa31.81■■■□□ 2.68
GLIS3-216ENST00000490709 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.8■■■□□ 2.68
GLIS3-216ENST00000490709 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.79■■■□□ 2.68
GLIS3-216ENST00000490709 FBXO41Q8TF61 875 aa31.78■■■□□ 2.68
GLIS3-216ENST00000490709 C3P01024 1663 aa31.78■■■□□ 2.68
GLIS3-216ENST00000490709 MIA2Q96PC5 1412 aa31.75■■■□□ 2.67
GLIS3-216ENST00000490709 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.74■■■□□ 2.67
GLIS3-216ENST00000490709 TSPY4P0CV99 314 aa31.74■■■□□ 2.67
GLIS3-216ENST00000490709 TSPY10P0CW01 314 aa31.74■■■□□ 2.67
GLIS3-216ENST00000490709 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.74■■■□□ 2.67
GLIS3-216ENST00000490709 HSPA2P54652 639 aa31.73■■■□□ 2.67
GLIS3-216ENST00000490709 GGT6Q6P531 493 aa31.73■■■□□ 2.67
GLIS3-216ENST00000490709 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
GLIS3-216ENST00000490709 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
GLIS3-216ENST00000490709 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
GLIS3-216ENST00000490709 MROH2AA6NES4 1674 aa31.68■■■□□ 2.66
GLIS3-216ENST00000490709 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.64■■■□□ 2.65
GLIS3-216ENST00000490709 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.63■■■□□ 2.65
GLIS3-216ENST00000490709 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.63■■■□□ 2.65
GLIS3-216ENST00000490709 KIF3BO15066 747 aa31.62■■■□□ 2.65
GLIS3-216ENST00000490709 ZMYM3Q14202 1370 aa31.62■■■□□ 2.65
GLIS3-216ENST00000490709 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.58■■■□□ 2.65
GLIS3-216ENST00000490709 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.57■■■□□ 2.64
GLIS3-216ENST00000490709 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.53■■■□□ 2.64
GLIS3-216ENST00000490709 NPATQ14207 1427 aa31.51■■■□□ 2.64
GLIS3-216ENST00000490709 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
GLIS3-216ENST00000490709 ABCC5O15440 1437 aa31.49■■■□□ 2.63
GLIS3-216ENST00000490709 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
GLIS3-216ENST00000490709 DAPK1P53355 1430 aa31.47■■■□□ 2.63
GLIS3-216ENST00000490709 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms