RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490447.6

YIPF3-208, Transcript of Yip1 domain family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene YIPF3, Length 1,321 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3-208ENST00000490447 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.16■■■□□ 2.26
YIPF3-208ENST00000490447 KIF14Q15058 1648 aa29.15■■■□□ 2.26
YIPF3-208ENST00000490447 CLIP1P30622 1438 aa29.14■■■□□ 2.26
YIPF3-208ENST00000490447 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.14■■■□□ 2.26
YIPF3-208ENST00000490447 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
YIPF3-208ENST00000490447 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
YIPF3-208ENST00000490447 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
YIPF3-208ENST00000490447 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.07■■■□□ 2.24
YIPF3-208ENST00000490447 MLECQ14165 292 aa29.06■■■□□ 2.24
YIPF3-208ENST00000490447 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.05■■■□□ 2.24
YIPF3-208ENST00000490447 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.03■■■□□ 2.24
YIPF3-208ENST00000490447 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.03■■■□□ 2.24
YIPF3-208ENST00000490447 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.02■■■□□ 2.24
YIPF3-208ENST00000490447 ATP10AO60312 1499 aa29.01■■■□□ 2.24
YIPF3-208ENST00000490447 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.01■■■□□ 2.23
YIPF3-208ENST00000490447 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.01■■■□□ 2.23
YIPF3-208ENST00000490447 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.01■■■□□ 2.23
YIPF3-208ENST00000490447 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29■■■□□ 2.23
YIPF3-208ENST00000490447 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.98■■■□□ 2.23
YIPF3-208ENST00000490447 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.95■■■□□ 2.22
YIPF3-208ENST00000490447 AFAP1Q8N556 730 aa28.94■■■□□ 2.22
YIPF3-208ENST00000490447 KDM5CP41229 1560 aa28.92■■■□□ 2.22
YIPF3-208ENST00000490447 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.9■■■□□ 2.22
YIPF3-208ENST00000490447 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.9■■■□□ 2.22
YIPF3-208ENST00000490447 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.89■■■□□ 2.22
YIPF3-208ENST00000490447 PREX2Q70Z35 1606 aa28.89■■■□□ 2.21
YIPF3-208ENST00000490447 HSPA2P54652 639 aa28.88■■■□□ 2.21
YIPF3-208ENST00000490447 FBXO41Q8TF61 875 aa28.86■■■□□ 2.21
YIPF3-208ENST00000490447 ABCC1P33527 1531 aa28.84■■■□□ 2.21
YIPF3-208ENST00000490447 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.83■■■□□ 2.21
YIPF3-208ENST00000490447 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.83■■■□□ 2.21
YIPF3-208ENST00000490447 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.8■■■□□ 2.2
YIPF3-208ENST00000490447 REREQ9P2R6 1566 aa28.79■■■□□ 2.2
YIPF3-208ENST00000490447 ABCA6Q8N139 1617 aa28.78■■■□□ 2.2
YIPF3-208ENST00000490447 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.78■■■□□ 2.2
YIPF3-208ENST00000490447 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
YIPF3-208ENST00000490447 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
YIPF3-208ENST00000490447 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.76■■■□□ 2.19
YIPF3-208ENST00000490447 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
YIPF3-208ENST00000490447 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.73■■■□□ 2.19
YIPF3-208ENST00000490447 AGLP35573 1532 aa28.7■■■□□ 2.18
YIPF3-208ENST00000490447 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
YIPF3-208ENST00000490447 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.68■■■□□ 2.18
YIPF3-208ENST00000490447 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.67■■■□□ 2.18
YIPF3-208ENST00000490447 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.66■■■□□ 2.18
YIPF3-208ENST00000490447 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.66■■■□□ 2.18
YIPF3-208ENST00000490447 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.66■■■□□ 2.18
YIPF3-208ENST00000490447 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.65■■■□□ 2.18
YIPF3-208ENST00000490447 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
YIPF3-208ENST00000490447 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
YIPF3-208ENST00000490447 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.62■■■□□ 2.17
YIPF3-208ENST00000490447 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
YIPF3-208ENST00000490447 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.59■■■□□ 2.17
YIPF3-208ENST00000490447 C3P01024 1663 aa28.59■■■□□ 2.17
YIPF3-208ENST00000490447 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.58■■■□□ 2.17
YIPF3-208ENST00000490447 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.58■■■□□ 2.17
YIPF3-208ENST00000490447 CERKQ8TCT0 537 aa28.56■■■□□ 2.16
YIPF3-208ENST00000490447 ATP7AQ04656 1500 aa28.55■■■□□ 2.16
YIPF3-208ENST00000490447 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
YIPF3-208ENST00000490447 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.53■■■□□ 2.16
YIPF3-208ENST00000490447 CEP162Q5TB80 1403 aa28.52■■■□□ 2.16
YIPF3-208ENST00000490447 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
YIPF3-208ENST00000490447 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
YIPF3-208ENST00000490447 A2MP01023 1474 aa28.48■■■□□ 2.15
YIPF3-208ENST00000490447 TIAM1Q13009 1591 aa28.48■■■□□ 2.15
YIPF3-208ENST00000490447 STRCQ7RTU9 1775 aa28.46■■■□□ 2.15
YIPF3-208ENST00000490447 MROH2AA6NES4 1674 aa28.45■■■□□ 2.14
YIPF3-208ENST00000490447 PLXNC1O60486 1568 aa28.45■■■□□ 2.14
YIPF3-208ENST00000490447 NPATQ14207 1427 aa28.44■■■□□ 2.14
YIPF3-208ENST00000490447 ZMYM3Q14202 1370 aa28.44■■■□□ 2.14
YIPF3-208ENST00000490447 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
YIPF3-208ENST00000490447 GGT6Q6P531 493 aa28.42■■■□□ 2.14
YIPF3-208ENST00000490447 PTPRTO14522 1441 aa28.4■■■□□ 2.14
YIPF3-208ENST00000490447 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.38■■■□□ 2.13
YIPF3-208ENST00000490447 MBD5Q9P267 1494 aa28.37■■■□□ 2.13
YIPF3-208ENST00000490447 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
YIPF3-208ENST00000490447 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.35■■■□□ 2.13
YIPF3-208ENST00000490447 NCOA1Q15788 1441 aa28.35■■■□□ 2.13
YIPF3-208ENST00000490447 NCOA2Q15596 1464 aa28.34■■■□□ 2.13
YIPF3-208ENST00000490447 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.34■■■□□ 2.13
YIPF3-208ENST00000490447 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.31■■■□□ 2.12
YIPF3-208ENST00000490447 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.31■■■□□ 2.12
YIPF3-208ENST00000490447 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.29■■■□□ 2.12
YIPF3-208ENST00000490447 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
YIPF3-208ENST00000490447 PTPRKQ15262 1439 aa28.27■■■□□ 2.12
YIPF3-208ENST00000490447 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.27■■■□□ 2.12
YIPF3-208ENST00000490447 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.27■■■□□ 2.12
YIPF3-208ENST00000490447 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.24■■■□□ 2.11
YIPF3-208ENST00000490447 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
YIPF3-208ENST00000490447 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
YIPF3-208ENST00000490447 KIF3BO15066 747 aa28.21■■■□□ 2.11
YIPF3-208ENST00000490447 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.2■■■□□ 2.11
YIPF3-208ENST00000490447 PLA2R1Q13018 1463 aa28.2■■■□□ 2.1
YIPF3-208ENST00000490447 TSPY4P0CV99 314 aa28.19■■■□□ 2.1
YIPF3-208ENST00000490447 TSPY10P0CW01 314 aa28.19■■■□□ 2.1
YIPF3-208ENST00000490447 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.19■■■□□ 2.1
YIPF3-208ENST00000490447 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.18■■■□□ 2.1
YIPF3-208ENST00000490447 PKD2Q13563 968 aa28.18■■■□□ 2.1
YIPF3-208ENST00000490447 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.18■■■□□ 2.1
YIPF3-208ENST00000490447 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms