RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489824.1

RPS6KB1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B1, human

TSL 3

Gene RPS6KB1, Length 909 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KIF14	Q15058	1648 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RPS6KB1-208	ENST00000489824	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RPS6KB1-208	ENST00000489824	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.68	■■■□□ 2.66
RPS6KB1-208	ENST00000489824	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.68	■■■□□ 2.66
RPS6KB1-208	ENST00000489824	MLEC	Q14165	292 aa		31.68	■■■□□ 2.66
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.67	■■■□□ 2.66
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RPS6KB1-208	ENST00000489824	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.64	■■■□□ 2.66
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ATP10A	O60312	1499 aa		31.64	■■■□□ 2.66
RPS6KB1-208	ENST00000489824	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RPS6KB1-208	ENST00000489824	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RPS6KB1-208	ENST00000489824	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.58	■■■□□ 2.65
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.58	■■■□□ 2.65
RPS6KB1-208	ENST00000489824	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		31.57	■■■□□ 2.64
RPS6KB1-208	ENST00000489824	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.57	■■■□□ 2.64
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KDM5C	P41229	1560 aa		31.51	■■■□□ 2.64
RPS6KB1-208	ENST00000489824	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.51	■■■□□ 2.63
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.49	■■■□□ 2.63
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.49	■■■□□ 2.63
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.48	■■■□□ 2.63
RPS6KB1-208	ENST00000489824	HSPA2	P54652	639 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ABCC1	P33527	1531 aa		31.44	■■■□□ 2.62
RPS6KB1-208	ENST00000489824	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.43	■■■□□ 2.62
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.42	■■■□□ 2.62
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
RPS6KB1-208	ENST00000489824	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.41	■■■□□ 2.62
RPS6KB1-208	ENST00000489824	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.37	■■■□□ 2.61
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.36	■■■□□ 2.61
RPS6KB1-208	ENST00000489824	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.36	■■■□□ 2.61
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.35	■■■□□ 2.61
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.35	■■■□□ 2.61
RPS6KB1-208	ENST00000489824	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.32	■■■□□ 2.6
RPS6KB1-208	ENST00000489824	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.3	■■■□□ 2.6
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.3	■■■□□ 2.6
RPS6KB1-208	ENST00000489824	AGL	P35573	1532 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.26	■■■□□ 2.6
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.26	■■■□□ 2.59
RPS6KB1-208	ENST00000489824	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.26	■■■□□ 2.59	5e-7	■■■□□ 15.3
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.25	■■■□□ 2.59
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RPS6KB1-208	ENST00000489824	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.17	■■■□□ 2.58
RPS6KB1-208	ENST00000489824	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.15	■■■□□ 2.58
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.14	■■■□□ 2.57
RPS6KB1-208	ENST00000489824	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.13	■■■□□ 2.57
RPS6KB1-208	ENST00000489824	C3	P01024	1663 aa		31.12	■■■□□ 2.57
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.08	■■■□□ 2.57
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.07	■■■□□ 2.56
RPS6KB1-208	ENST00000489824	A2M	P01023	1474 aa		31.07	■■■□□ 2.56
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
RPS6KB1-208	ENST00000489824	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.04	■■■□□ 2.56
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.01	■■■□□ 2.55
RPS6KB1-208	ENST00000489824	GGT6	Q6P531	493 aa		31	■■■□□ 2.55
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PLXNC1	O60486	1568 aa		31	■■■□□ 2.55
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NPAT	Q14207	1427 aa		30.98	■■■□□ 2.55
RPS6KB1-208	ENST00000489824	MROH2A	A6NES4	1674 aa		30.98	■■■□□ 2.55
RPS6KB1-208	ENST00000489824	STRC	Q7RTU9	1775 aa		30.97	■■■□□ 2.55
RPS6KB1-208	ENST00000489824	MBD5	Q9P267	1494 aa		30.96	■■■□□ 2.55
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NCOA2	Q15596	1464 aa		30.95	■■■□□ 2.55
RPS6KB1-208	ENST00000489824	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		30.93	■■■□□ 2.54
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		30.93	■■■□□ 2.54
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PTPRT	O14522	1441 aa		30.92	■■■□□ 2.54
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		30.92	■■■□□ 2.54
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	30.9	■■■□□ 2.54
RPS6KB1-208	ENST00000489824	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		30.9	■■■□□ 2.54
RPS6KB1-208	ENST00000489824	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		30.89	■■■□□ 2.54
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		30.89	■■■□□ 2.53
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		30.89	■■■□□ 2.53
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NCOA1	Q15788	1441 aa		30.88	■■■□□ 2.53
RPS6KB1-208	ENST00000489824	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		30.88	■■■□□ 2.53
RPS6KB1-208	ENST00000489824	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	30.87	■■■□□ 2.53
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PTPRK	Q15262	1439 aa		30.82	■■■□□ 2.52
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		30.82	■■■□□ 2.52
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KIF3B	O15066	747 aa		30.81	■■■□□ 2.52
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TSPY4	P0CV99	314 aa		30.81	■■■□□ 2.52
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TSPY10	P0CW01	314 aa		30.81	■■■□□ 2.52
RPS6KB1-208	ENST00000489824	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		30.8	■■■□□ 2.52
RPS6KB1-208	ENST00000489824	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		30.76	■■■□□ 2.52
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		30.74	■■■□□ 2.51
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	30.74	■■■□□ 2.51
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		30.73	■■■□□ 2.51
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PKD2	Q13563	968 aa		30.72	■■■□□ 2.51
RPS6KB1-208	ENST00000489824	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		30.72	■■■□□ 2.51
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	30.71	■■■□□ 2.51
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PLA2R1	Q13018	1463 aa		30.7	■■■□□ 2.51

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