RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa15.53■□□□□ 0.08
GTPBP1-211ENST00000487538 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.52■□□□□ 0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 ITGAEP38570 1179 aa15.51■□□□□ 0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNH8Q96L42 1107 aa15.51■□□□□ 0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.5■□□□□ 0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 MIA2Q96PC5 1412 aa15.5■□□□□ 0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 NEO1Q92859 1461 aa15.48■□□□□ 0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 ADGRL1O94910 1474 aa15.46■□□□□ 0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.46■□□□□ 0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.46■□□□□ 0.07
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF14Q15058 1648 aa15.45■□□□□ 0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 RICTORQ6R327 1708 aa15.45■□□□□ 0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.44■□□□□ 0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.43■□□□□ 0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.43■□□□□ 0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.42■□□□□ 0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 FANCAO15360 1455 aa15.4■□□□□ 0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.4■□□□□ 0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.4■□□□□ 0.06
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPRKQ15262 1439 aa15.39■□□□□ 0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.39■□□□□ 0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.38■□□□□ 0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 HFM1A2PYH4 1435 aa15.37■□□□□ 0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 AKNAQ7Z591 1439 aa15.35■□□□□ 0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 PREX2Q70Z35 1606 aa15.35■□□□□ 0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 PLCH2O75038 1416 aa15.34■□□□□ 0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.34■□□□□ 0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa15.34■□□□□ 0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.05
GTPBP1-211ENST00000487538 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.33■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.32■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 DAPK1P53355 1430 aa15.32■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.32■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAMTSL3P82987 1691 aa15.32■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.32■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 RAPGEF3O95398 923 aa15.31■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 NAIPQ13075 1403 aa15.31■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ABCC5O15440 1437 aa15.3■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.3■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 KDM5CP41229 1560 aa15.29■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ROCK1Q13464 1354 aa15.29■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.28■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ABCC1P33527 1531 aa15.27■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.27■□□□□ 0.04
GTPBP1-211ENST00000487538 YEATS2Q9ULM3 1422 aa15.26■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.26■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.26■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 MADDQ8WXG6 1647 aa15.25■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.25■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.25■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.24■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.24■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.23■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.23■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ADGRL2O95490 1459 aa15.22■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.22■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.22■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.22■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.21■□□□□ 0.03
GTPBP1-211ENST00000487538 ABCA6Q8N139 1617 aa15.21■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa15.2■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPRMP28827 1452 aa15.19■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.19■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 REREQ9P2R6 1566 aa15.19■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 NCOA1Q15788 1441 aa15.17■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 MBD5Q9P267 1494 aa15.17■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.17■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.17■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.17■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.17■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.16■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.16■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa15.16■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.15■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa15.15■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.15■□□□□ 0.02
GTPBP1-211ENST00000487538 MLH3Q9UHC1 1453 aa15.14■□□□□ 0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP10AO60312 1499 aa15.14■□□□□ 0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.12■□□□□ 0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 TSPY4P0CV99 314 aa15.12■□□□□ 0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 TSPY10P0CW01 314 aa15.12■□□□□ 0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.12■□□□□ 0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM52Q96A61 297 aa15.11■□□□□ 0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 AFAP1Q8N556 730 aa15.09■□□□□ 0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 AGLP35573 1532 aa15.08■□□□□ 0.01
GTPBP1-211ENST00000487538 PLXNC1O60486 1568 aa15.08■□□□□ 0
GTPBP1-211ENST00000487538 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
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