RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.87□□□□□ -0.03
CTPS1-210ENST00000486889 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-210ENST00000486889 MIA2Q96PC5 1412 aa14.86□□□□□ -0.03
CTPS1-210ENST00000486889 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CTPS1-210ENST00000486889 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.84□□□□□ -0.03
CTPS1-210ENST00000486889 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.84□□□□□ -0.03
CTPS1-210ENST00000486889 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.84□□□□□ -0.03
CTPS1-210ENST00000486889 FANCAO15360 1455 aa14.82□□□□□ -0.04
CTPS1-210ENST00000486889 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CTPS1-210ENST00000486889 PREX2Q70Z35 1606 aa14.82□□□□□ -0.04
CTPS1-210ENST00000486889 NEO1Q92859 1461 aa14.82□□□□□ -0.04
CTPS1-210ENST00000486889 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CTPS1-210ENST00000486889 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.79□□□□□ -0.04
CTPS1-210ENST00000486889 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.79□□□□□ -0.04
CTPS1-210ENST00000486889 AKNAQ7Z591 1439 aa14.77□□□□□ -0.04
CTPS1-210ENST00000486889 TSPY4P0CV99 314 aa14.77□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 TSPY10P0CW01 314 aa14.77□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.76□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 ADGRL1O94910 1474 aa14.76□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.75□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.75□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.74□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.73□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.7□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.7□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.061e-8■■■■■ 50.4
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 ABCC1P33527 1531 aa14.69□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.68□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.68□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.67□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.67□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.67□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 ITGAEP38570 1179 aa14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.66□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTPS1-210ENST00000486889 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-210ENST00000486889 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-210ENST00000486889 AFAP1Q8N556 730 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-210ENST00000486889 DAPK1P53355 1430 aa14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-210ENST00000486889 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTPS1-210ENST00000486889 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-210ENST00000486889 RAPGEF3O95398 923 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-210ENST00000486889 MBD5Q9P267 1494 aa14.62□□□□□ -0.07
CTPS1-210ENST00000486889 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.62□□□□□ -0.07
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CTPS1-210ENST00000486889 ABCC5O15440 1437 aa14.58□□□□□ -0.07
CTPS1-210ENST00000486889 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.58□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.58□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 KDM5CP41229 1560 aa14.58□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.58□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 ROCK1Q13464 1354 aa14.58□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 RICTORQ6R327 1708 aa14.58□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.57□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.57□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 ATP7AQ04656 1500 aa14.56□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.56□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.56□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.55□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.53□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 PLXNC1O60486 1568 aa14.52□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 ATP10AO60312 1499 aa14.52□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 ADGRL2O95490 1459 aa14.52□□□□□ -0.08
CTPS1-210ENST00000486889 KIF15Q9NS87 1388 aa14.52□□□□□ -0.08
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CTPS1-210ENST00000486889 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-210ENST00000486889 NCOA1Q15788 1441 aa14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-210ENST00000486889 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTPS1-210ENST00000486889 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.51□□□□□ -0.09
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CTPS1-210ENST00000486889 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
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CTPS1-210ENST00000486889 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.48□□□□□ -0.09
CTPS1-210ENST00000486889 HFM1A2PYH4 1435 aa14.48□□□□□ -0.09
CTPS1-210ENST00000486889 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.47□□□□□ -0.09
CTPS1-210ENST00000486889 KANK1Q14678 1352 aa14.47□□□□□ -0.09
CTPS1-210ENST00000486889 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.46□□□□□ -0.09
CTPS1-210ENST00000486889 KIF3BO15066 747 aa14.45□□□□□ -0.1
CTPS1-210ENST00000486889 REREQ9P2R6 1566 aa14.45□□□□□ -0.1
CTPS1-210ENST00000486889 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.45□□□□□ -0.1
CTPS1-210ENST00000486889 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.45□□□□□ -0.1
CTPS1-210ENST00000486889 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.45□□□□□ -0.1
CTPS1-210ENST00000486889 PTPRKQ15262 1439 aa14.44□□□□□ -0.1
CTPS1-210ENST00000486889 HRCP23327 699 aa14.44□□□□□ -0.1
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