RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
CCZ1B-211ENST00000486840 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.38■■■■■ 4.38
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
CCZ1B-211ENST00000486840 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.36■■■■■ 4.37
CCZ1B-211ENST00000486840 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.33■■■■■ 4.37
CCZ1B-211ENST00000486840 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.32■■■■■ 4.37
CCZ1B-211ENST00000486840 RICTORQ6R327 1708 aa42.3■■■■■ 4.36
CCZ1B-211ENST00000486840 APLP2Q06481 763 aa42.3■■■■■ 4.36
CCZ1B-211ENST00000486840 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
CCZ1B-211ENST00000486840 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.28■■■■■ 4.36
CCZ1B-211ENST00000486840 PREX2Q70Z35 1606 aa42.27■■■■■ 4.36
CCZ1B-211ENST00000486840 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.26■■■■■ 4.36
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.24■■■■■ 4.35
CCZ1B-211ENST00000486840 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.23■■■■■ 4.35
CCZ1B-211ENST00000486840 AFAP1Q8N556 730 aa42.22■■■■■ 4.35
CCZ1B-211ENST00000486840 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.21■■■■■ 4.35
CCZ1B-211ENST00000486840 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.21■■■■■ 4.35
CCZ1B-211ENST00000486840 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.17■■■■■ 4.34
CCZ1B-211ENST00000486840 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.16■■■■■ 4.34
CCZ1B-211ENST00000486840 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.12■■■■■ 4.33
CCZ1B-211ENST00000486840 TIAM1Q13009 1591 aa42.12■■■■■ 4.33
CCZ1B-211ENST00000486840 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.09■■■■■ 4.33
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCC1P33527 1531 aa42.08■■■■■ 4.33
CCZ1B-211ENST00000486840 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.06■■■■■ 4.32
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP10AO60312 1499 aa42.04■■■■■ 4.32
CCZ1B-211ENST00000486840 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.03■■■■■ 4.32
CCZ1B-211ENST00000486840 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
CCZ1B-211ENST00000486840 NCOA2Q15596 1464 aa42.01■■■■■ 4.32
CCZ1B-211ENST00000486840 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.01■■■■■ 4.32
CCZ1B-211ENST00000486840 MAP3K1Q13233 1512 aa42■■■■■ 4.31
CCZ1B-211ENST00000486840 KDM5CP41229 1560 aa41.99■■■■■ 4.31
CCZ1B-211ENST00000486840 MLECQ14165 292 aa41.99■■■■■ 4.31
CCZ1B-211ENST00000486840 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.99■■■■■ 4.31
CCZ1B-211ENST00000486840 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.99■■■■■ 4.31
CCZ1B-211ENST00000486840 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.99■■■■■ 4.31
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.99■■■■■ 4.31
CCZ1B-211ENST00000486840 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
CCZ1B-211ENST00000486840 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.97■■■■■ 4.31
CCZ1B-211ENST00000486840 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.97■■■■■ 4.31
CCZ1B-211ENST00000486840 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.96■■■■■ 4.31
CCZ1B-211ENST00000486840 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.95■■■■■ 4.31
CCZ1B-211ENST00000486840 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
CCZ1B-211ENST00000486840 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.89■■■■■ 4.3
CCZ1B-211ENST00000486840 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.84■■■■■ 4.29
CCZ1B-211ENST00000486840 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.84■■■■■ 4.29
CCZ1B-211ENST00000486840 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
CCZ1B-211ENST00000486840 PTPRMP28827 1452 aa41.8■■■■■ 4.28
CCZ1B-211ENST00000486840 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.78■■■■■ 4.28
CCZ1B-211ENST00000486840 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.78■■■■■ 4.28
CCZ1B-211ENST00000486840 MADDQ8WXG6 1647 aa41.76■■■■■ 4.28
CCZ1B-211ENST00000486840 TSPY4P0CV99 314 aa41.73■■■■■ 4.27
CCZ1B-211ENST00000486840 TSPY10P0CW01 314 aa41.73■■■■■ 4.27
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCA6Q8N139 1617 aa41.73■■■■■ 4.27
CCZ1B-211ENST00000486840 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.72■■■■■ 4.27
CCZ1B-211ENST00000486840 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.7■■■■■ 4.27
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP7AQ04656 1500 aa41.69■■■■■ 4.27
CCZ1B-211ENST00000486840 REREQ9P2R6 1566 aa41.69■■■■■ 4.26
CCZ1B-211ENST00000486840 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.68■■■■■ 4.26
CCZ1B-211ENST00000486840 MBD5Q9P267 1494 aa41.67■■■■■ 4.26
CCZ1B-211ENST00000486840 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
CCZ1B-211ENST00000486840 MIA2Q96PC5 1412 aa41.65■■■■■ 4.26
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.65■■■■■ 4.26
CCZ1B-211ENST00000486840 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.64■■■■■ 4.26
CCZ1B-211ENST00000486840 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.61■■■■■ 4.25
CCZ1B-211ENST00000486840 AGLP35573 1532 aa41.61■■■■■ 4.25
CCZ1B-211ENST00000486840 A2MP01023 1474 aa41.58■■■■■ 4.25
CCZ1B-211ENST00000486840 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
CCZ1B-211ENST00000486840 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.57■■■■■ 4.24
CCZ1B-211ENST00000486840 GGT6Q6P531 493 aa41.49■■■■■ 4.23
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.49■■■■■ 4.23
CCZ1B-211ENST00000486840 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
CCZ1B-211ENST00000486840 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
CCZ1B-211ENST00000486840 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.44■■■■■ 4.22
CCZ1B-211ENST00000486840 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.44■■■■■ 4.22
CCZ1B-211ENST00000486840 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.38■■■■■ 4.22
CCZ1B-211ENST00000486840 KIF3BO15066 747 aa41.38■■■■■ 4.21
CCZ1B-211ENST00000486840 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.38■■■■■ 4.21
CCZ1B-211ENST00000486840 PLXNC1O60486 1568 aa41.35■■■■■ 4.21
CCZ1B-211ENST00000486840 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.35■■■■■ 4.21
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
CCZ1B-211ENST00000486840 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.25■■■■■ 4.19
CCZ1B-211ENST00000486840 ZMYM3Q14202 1370 aa41.24■■■■■ 4.19
CCZ1B-211ENST00000486840 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
CCZ1B-211ENST00000486840 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
CCZ1B-211ENST00000486840 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.21■■■■■ 4.19
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCC5O15440 1437 aa41.2■■■■■ 4.19
CCZ1B-211ENST00000486840 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.19■■■■■ 4.19
CCZ1B-211ENST00000486840 DAPK1P53355 1430 aa41.19■■■■■ 4.18
CCZ1B-211ENST00000486840 HSPA2P54652 639 aa41.18■■■■■ 4.18
CCZ1B-211ENST00000486840 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.18■■■■■ 4.18
CCZ1B-211ENST00000486840 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.18■■■■■ 4.18
CCZ1B-211ENST00000486840 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.17■■■■■ 4.18
CCZ1B-211ENST00000486840 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.17■■■■■ 4.18
CCZ1B-211ENST00000486840 C3P01024 1663 aa41.13■■■■■ 4.18
CCZ1B-211ENST00000486840 KIF15Q9NS87 1388 aa41.13■■■■■ 4.18
CCZ1B-211ENST00000486840 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.12■■■■■ 4.17
CCZ1B-211ENST00000486840 MROH2AA6NES4 1674 aa41.11■■■■■ 4.17
CCZ1B-211ENST00000486840 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
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