RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486311.5

SREBF1-214, Transcript of sterol regulatory element binding transcription factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene SREBF1, Length 473 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1-214ENST00000486311 KIF14Q15058 1648 aa36.56■■■■□ 3.44
SREBF1-214ENST00000486311 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.55■■■■□ 3.44
SREBF1-214ENST00000486311 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.54■■■■□ 3.44
SREBF1-214ENST00000486311 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.53■■■■□ 3.44
SREBF1-214ENST00000486311 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.51■■■■□ 3.44
SREBF1-214ENST00000486311 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
SREBF1-214ENST00000486311 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.5■■■■□ 3.43
SREBF1-214ENST00000486311 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.5■■■■□ 3.43
SREBF1-214ENST00000486311 MADDQ8WXG6 1647 aa36.45■■■■□ 3.43
SREBF1-214ENST00000486311 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.44■■■■□ 3.42
SREBF1-214ENST00000486311 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.43■■■■□ 3.42
SREBF1-214ENST00000486311 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.37■■■■□ 3.41
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SREBF1-214ENST00000486311 AFAP1Q8N556 730 aa36.34■■■■□ 3.41
SREBF1-214ENST00000486311 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.34■■■■□ 3.41
SREBF1-214ENST00000486311 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.32■■■■□ 3.4
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SREBF1-214ENST00000486311 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
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SREBF1-214ENST00000486311 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.26■■■■□ 3.4
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SREBF1-214ENST00000486311 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.22■■■■□ 3.39
SREBF1-214ENST00000486311 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.21■■■■□ 3.39
SREBF1-214ENST00000486311 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.2■■■■□ 3.39
SREBF1-214ENST00000486311 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.19■■■■□ 3.38
SREBF1-214ENST00000486311 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.18■■■■□ 3.38
SREBF1-214ENST00000486311 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.15■■■■□ 3.38
SREBF1-214ENST00000486311 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.14■■■■□ 3.38
SREBF1-214ENST00000486311 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.38
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SREBF1-214ENST00000486311 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.1■■■■□ 3.37
SREBF1-214ENST00000486311 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.09■■■■□ 3.37
SREBF1-214ENST00000486311 CEP162Q5TB80 1403 aa36.08■■■■□ 3.37
SREBF1-214ENST00000486311 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
SREBF1-214ENST00000486311 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.06■■■■□ 3.36
SREBF1-214ENST00000486311 ABCA6Q8N139 1617 aa36.06■■■■□ 3.36
SREBF1-214ENST00000486311 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.03■■■■□ 3.36
SREBF1-214ENST00000486311 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.02■■■■□ 3.36
SREBF1-214ENST00000486311 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
SREBF1-214ENST00000486311 HSPA2P54652 639 aa36.01■■■■□ 3.36
SREBF1-214ENST00000486311 AGLP35573 1532 aa36.01■■■■□ 3.36
SREBF1-214ENST00000486311 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36■■■■□ 3.35
SREBF1-214ENST00000486311 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.98■■■■□ 3.35
SREBF1-214ENST00000486311 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.98■■■■□ 3.35
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SREBF1-214ENST00000486311 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
SREBF1-214ENST00000486311 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.97■■■■□ 3.35
SREBF1-214ENST00000486311 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.96■■■■□ 3.35
SREBF1-214ENST00000486311 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
SREBF1-214ENST00000486311 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.92■■■■□ 3.34
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SREBF1-214ENST00000486311 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
SREBF1-214ENST00000486311 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.81■■■■□ 3.32
SREBF1-214ENST00000486311 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.8■■■■□ 3.32
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SREBF1-214ENST00000486311 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
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SREBF1-214ENST00000486311 MBD5Q9P267 1494 aa35.76■■■■□ 3.32
SREBF1-214ENST00000486311 A2MP01023 1474 aa35.74■■■■□ 3.31
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SREBF1-214ENST00000486311 C3P01024 1663 aa35.72■■■■□ 3.31
SREBF1-214ENST00000486311 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.72■■■■□ 3.31
SREBF1-214ENST00000486311 PLXNC1O60486 1568 aa35.72■■■■□ 3.31
SREBF1-214ENST00000486311 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
SREBF1-214ENST00000486311 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.66■■■■□ 3.3
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SREBF1-214ENST00000486311 ZMYM3Q14202 1370 aa35.64■■■■□ 3.3
SREBF1-214ENST00000486311 NPATQ14207 1427 aa35.61■■■■□ 3.29
SREBF1-214ENST00000486311 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.6■■■■□ 3.29
SREBF1-214ENST00000486311 MROH2AA6NES4 1674 aa35.59■■■■□ 3.29
SREBF1-214ENST00000486311 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.59■■■■□ 3.29
SREBF1-214ENST00000486311 GGT6Q6P531 493 aa35.59■■■■□ 3.29
SREBF1-214ENST00000486311 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.59■■■■□ 3.29
SREBF1-214ENST00000486311 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.59■■■■□ 3.29
SREBF1-214ENST00000486311 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.59■■■■□ 3.29
SREBF1-214ENST00000486311 STRCQ7RTU9 1775 aa35.59■■■■□ 3.29
SREBF1-214ENST00000486311 CERKQ8TCT0 537 aa35.57■■■■□ 3.28
SREBF1-214ENST00000486311 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.57■■■■□ 3.28
SREBF1-214ENST00000486311 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.56■■■■□ 3.28
SREBF1-214ENST00000486311 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
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SREBF1-214ENST00000486311 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
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SREBF1-214ENST00000486311 PTPRTO14522 1441 aa35.47■■■■□ 3.27
SREBF1-214ENST00000486311 PTPRKQ15262 1439 aa35.46■■■■□ 3.27
SREBF1-214ENST00000486311 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.45■■■■□ 3.27
SREBF1-214ENST00000486311 NCOA1Q15788 1441 aa35.44■■■■□ 3.26
SREBF1-214ENST00000486311 TSPY4P0CV99 314 aa35.43■■■■□ 3.26
SREBF1-214ENST00000486311 TSPY10P0CW01 314 aa35.43■■■■□ 3.26
SREBF1-214ENST00000486311 KIF3BO15066 747 aa35.41■■■■□ 3.26
SREBF1-214ENST00000486311 MIA2Q96PC5 1412 aa35.36■■■■□ 3.25
SREBF1-214ENST00000486311 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.35■■■■□ 3.25
SREBF1-214ENST00000486311 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.35■■■■□ 3.25
SREBF1-214ENST00000486311 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.32■■■■□ 3.24
SREBF1-214ENST00000486311 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.32■■■■□ 3.24
SREBF1-214ENST00000486311 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
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