RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486229.5

NBPF3-212, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 3

Gene NBPF3, Length 933 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-212ENST00000486229 PLCH2O75038 1416 aa35.34■■■■□ 3.25
NBPF3-212ENST00000486229 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.34■■■■□ 3.25
NBPF3-212ENST00000486229 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.33■■■■□ 3.25
NBPF3-212ENST00000486229 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.31■■■■□ 3.24
NBPF3-212ENST00000486229 PREX2Q70Z35 1606 aa35.3■■■■□ 3.24
NBPF3-212ENST00000486229 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.29■■■■□ 3.24
NBPF3-212ENST00000486229 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.27■■■■□ 3.24
NBPF3-212ENST00000486229 NEO1Q92859 1461 aa35.26■■■■□ 3.23
NBPF3-212ENST00000486229 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.26■■■■□ 3.23
NBPF3-212ENST00000486229 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
NBPF3-212ENST00000486229 FANCAO15360 1455 aa35.24■■■■□ 3.23
NBPF3-212ENST00000486229 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
NBPF3-212ENST00000486229 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.22■■■■□ 3.23
NBPF3-212ENST00000486229 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.17■■■■□ 3.22
NBPF3-212ENST00000486229 MIA2Q96PC5 1412 aa35.15■■■■□ 3.22
NBPF3-212ENST00000486229 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.13■■■■□ 3.21
NBPF3-212ENST00000486229 AKNAQ7Z591 1439 aa35.13■■■■□ 3.21
NBPF3-212ENST00000486229 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
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NBPF3-212ENST00000486229 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.01■■■■□ 3.2
NBPF3-212ENST00000486229 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.01■■■■□ 3.2
NBPF3-212ENST00000486229 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35■■■■□ 3.19
NBPF3-212ENST00000486229 ABCC1P33527 1531 aa35■■■■□ 3.19
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NBPF3-212ENST00000486229 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.98■■■■□ 3.19
NBPF3-212ENST00000486229 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.97■■■■□ 3.19
NBPF3-212ENST00000486229 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.97■■■■□ 3.19
NBPF3-212ENST00000486229 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.95■■■■□ 3.19
NBPF3-212ENST00000486229 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.91■■■■□ 3.18
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NBPF3-212ENST00000486229 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.9■■■■□ 3.18
NBPF3-212ENST00000486229 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.89■■■■□ 3.18
NBPF3-212ENST00000486229 RICTORQ6R327 1708 aa34.86■■■■□ 3.17
NBPF3-212ENST00000486229 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
NBPF3-212ENST00000486229 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.85■■■■□ 3.17
NBPF3-212ENST00000486229 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.84■■■■□ 3.17
NBPF3-212ENST00000486229 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.84■■■■□ 3.17
NBPF3-212ENST00000486229 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
NBPF3-212ENST00000486229 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
NBPF3-212ENST00000486229 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.81■■■■□ 3.16
NBPF3-212ENST00000486229 RAPGEF3O95398 923 aa34.81■■■■□ 3.16
NBPF3-212ENST00000486229 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.81■■■■□ 3.16
NBPF3-212ENST00000486229 MBD5Q9P267 1494 aa34.8■■■■□ 3.16
NBPF3-212ENST00000486229 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.79■■■■□ 3.16
NBPF3-212ENST00000486229 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.79■■■■□ 3.16
NBPF3-212ENST00000486229 KDM5CP41229 1560 aa34.79■■■■□ 3.16
NBPF3-212ENST00000486229 TSPY4P0CV99 314 aa34.78■■■■□ 3.16
NBPF3-212ENST00000486229 TSPY10P0CW01 314 aa34.78■■■■□ 3.16
NBPF3-212ENST00000486229 FBXO41Q8TF61 875 aa34.78■■■■□ 3.16
NBPF3-212ENST00000486229 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.78■■■■□ 3.16
NBPF3-212ENST00000486229 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.77■■■■□ 3.16
NBPF3-212ENST00000486229 AFAP1Q8N556 730 aa34.75■■■■□ 3.15
NBPF3-212ENST00000486229 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.75■■■■□ 3.15
NBPF3-212ENST00000486229 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.74■■■■□ 3.15
NBPF3-212ENST00000486229 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
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NBPF3-212ENST00000486229 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.71■■■■□ 3.15
NBPF3-212ENST00000486229 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.68■■■■□ 3.14
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NBPF3-212ENST00000486229 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.67■■■■□ 3.14
NBPF3-212ENST00000486229 DAPK1P53355 1430 aa34.67■■■■□ 3.14
NBPF3-212ENST00000486229 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.66■■■■□ 3.14
NBPF3-212ENST00000486229 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.65■■■■□ 3.14
NBPF3-212ENST00000486229 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.65■■■■□ 3.14
NBPF3-212ENST00000486229 ABCC5O15440 1437 aa34.64■■■■□ 3.14
NBPF3-212ENST00000486229 ATP7AQ04656 1500 aa34.63■■■■□ 3.13
NBPF3-212ENST00000486229 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
NBPF3-212ENST00000486229 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.61■■■■□ 3.13
NBPF3-212ENST00000486229 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.59■■■■□ 3.13
NBPF3-212ENST00000486229 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.59■■■■□ 3.13
NBPF3-212ENST00000486229 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.56■■■■□ 3.12
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NBPF3-212ENST00000486229 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.53■■■■□ 3.12
NBPF3-212ENST00000486229 ATP10AO60312 1499 aa34.52■■■■□ 3.12
NBPF3-212ENST00000486229 PLXNC1O60486 1568 aa34.51■■■■□ 3.12
NBPF3-212ENST00000486229 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.5■■■■□ 3.11
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NBPF3-212ENST00000486229 ITGAEP38570 1179 aa34.49■■■■□ 3.11
NBPF3-212ENST00000486229 ABCA6Q8N139 1617 aa34.48■■■■□ 3.11
NBPF3-212ENST00000486229 MADDQ8WXG6 1647 aa34.48■■■■□ 3.11
NBPF3-212ENST00000486229 ADGRL2O95490 1459 aa34.47■■■■□ 3.11
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NBPF3-212ENST00000486229 ROCK1Q13464 1354 aa34.47■■■■□ 3.11
NBPF3-212ENST00000486229 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.44■■■■□ 3.1
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NBPF3-212ENST00000486229 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.4■■■■□ 3.1
NBPF3-212ENST00000486229 KIF15Q9NS87 1388 aa34.39■■■■□ 3.1
NBPF3-212ENST00000486229 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
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NBPF3-212ENST00000486229 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.35■■■■□ 3.09
NBPF3-212ENST00000486229 AGLP35573 1532 aa34.35■■■■□ 3.09
NBPF3-212ENST00000486229 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
NBPF3-212ENST00000486229 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
NBPF3-212ENST00000486229 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
NBPF3-212ENST00000486229 ERBINQ96RT1 1412 aa34.31■■■■□ 3.08
NBPF3-212ENST00000486229 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
NBPF3-212ENST00000486229 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.24■■■■□ 3.07
NBPF3-212ENST00000486229 HFM1A2PYH4 1435 aa34.22■■■■□ 3.07
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