RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486125.5

WDR13-208, Transcript of WD repeat domain 13, human

TSL 2

Gene WDR13, Length 936 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
WDR13-208	ENST00000486125	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
WDR13-208	ENST00000486125	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.48	■■■□□ 2.95
WDR13-208	ENST00000486125	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		33.46	■■■□□ 2.95
WDR13-208	ENST00000486125	ATP10A	O60312	1499 aa		33.41	■■■□□ 2.94
WDR13-208	ENST00000486125	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.41	■■■□□ 2.94
WDR13-208	ENST00000486125	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.4	■■■□□ 2.94
WDR13-208	ENST00000486125	KIF14	Q15058	1648 aa		33.39	■■■□□ 2.93
WDR13-208	ENST00000486125	CLIP1	P30622	1438 aa		33.38	■■■□□ 2.93
WDR13-208	ENST00000486125	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.37	■■■□□ 2.93
WDR13-208	ENST00000486125	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
WDR13-208	ENST00000486125	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.36	■■■□□ 2.93
WDR13-208	ENST00000486125	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
WDR13-208	ENST00000486125	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.34	■■■□□ 2.93
WDR13-208	ENST00000486125	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.31	■■■□□ 2.92
WDR13-208	ENST00000486125	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.3	■■■□□ 2.92
WDR13-208	ENST00000486125	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.29	■■■□□ 2.92
WDR13-208	ENST00000486125	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.28	■■■□□ 2.92
WDR13-208	ENST00000486125	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.28	■■■□□ 2.92
WDR13-208	ENST00000486125	MLEC	Q14165	292 aa		33.27	■■■□□ 2.92
WDR13-208	ENST00000486125	KDM5C	P41229	1560 aa		33.26	■■■□□ 2.92
WDR13-208	ENST00000486125	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.24	■■■□□ 2.91
WDR13-208	ENST00000486125	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.24	■■■□□ 2.91
WDR13-208	ENST00000486125	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.22	■■■□□ 2.91
WDR13-208	ENST00000486125	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.21	■■■□□ 2.91
WDR13-208	ENST00000486125	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
WDR13-208	ENST00000486125	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.17	■■■□□ 2.9
WDR13-208	ENST00000486125	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.16	■■■□□ 2.9
WDR13-208	ENST00000486125	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.16	■■■□□ 2.9
WDR13-208	ENST00000486125	HSPA2	P54652	639 aa		33.15	■■■□□ 2.9
WDR13-208	ENST00000486125	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.12	■■■□□ 2.89
WDR13-208	ENST00000486125	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.11	■■■□□ 2.89
WDR13-208	ENST00000486125	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.11	■■■□□ 2.89
WDR13-208	ENST00000486125	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.1	■■■□□ 2.89
WDR13-208	ENST00000486125	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.09	■■■□□ 2.89
WDR13-208	ENST00000486125	ABCC1	P33527	1531 aa		33.08	■■■□□ 2.89
WDR13-208	ENST00000486125	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
WDR13-208	ENST00000486125	AGL	P35573	1532 aa		33.07	■■■□□ 2.89
WDR13-208	ENST00000486125	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.04	■■■□□ 2.88
WDR13-208	ENST00000486125	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
WDR13-208	ENST00000486125	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.02	■■■□□ 2.88
WDR13-208	ENST00000486125	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.01	■■■□□ 2.88
WDR13-208	ENST00000486125	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.99	■■■□□ 2.87
WDR13-208	ENST00000486125	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.97	■■■□□ 2.87
WDR13-208	ENST00000486125	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.95	■■■□□ 2.87
WDR13-208	ENST00000486125	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
WDR13-208	ENST00000486125	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.94	■■■□□ 2.86
WDR13-208	ENST00000486125	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.93	■■■□□ 2.86
WDR13-208	ENST00000486125	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
WDR13-208	ENST00000486125	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
WDR13-208	ENST00000486125	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
WDR13-208	ENST00000486125	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.89	■■■□□ 2.86
WDR13-208	ENST00000486125	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.89	■■■□□ 2.86
WDR13-208	ENST00000486125	C3	P01024	1663 aa		32.88	■■■□□ 2.85
WDR13-208	ENST00000486125	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.87	■■■□□ 2.85
WDR13-208	ENST00000486125	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.87	■■■□□ 2.85
WDR13-208	ENST00000486125	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.87	■■■□□ 2.85
WDR13-208	ENST00000486125	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.86	■■■□□ 2.85
WDR13-208	ENST00000486125	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.85	■■■□□ 2.85
WDR13-208	ENST00000486125	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.82	■■■□□ 2.85
WDR13-208	ENST00000486125	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.79	■■■□□ 2.84
WDR13-208	ENST00000486125	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.77	■■■□□ 2.84
WDR13-208	ENST00000486125	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.75	■■■□□ 2.83
WDR13-208	ENST00000486125	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.75	■■■□□ 2.83
WDR13-208	ENST00000486125	NPAT	Q14207	1427 aa		32.74	■■■□□ 2.83
WDR13-208	ENST00000486125	PTPRT	O14522	1441 aa		32.73	■■■□□ 2.83
WDR13-208	ENST00000486125	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.73	■■■□□ 2.83
WDR13-208	ENST00000486125	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
WDR13-208	ENST00000486125	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.73	■■■□□ 2.83
WDR13-208	ENST00000486125	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
WDR13-208	ENST00000486125	A2M	P01023	1474 aa		32.72	■■■□□ 2.83
WDR13-208	ENST00000486125	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
WDR13-208	ENST00000486125	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.7	■■■□□ 2.82
WDR13-208	ENST00000486125	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.69	■■■□□ 2.82
WDR13-208	ENST00000486125	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.69	■■■□□ 2.82
WDR13-208	ENST00000486125	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.67	■■■□□ 2.82
WDR13-208	ENST00000486125	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.67	■■■□□ 2.82
WDR13-208	ENST00000486125	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.63	■■■□□ 2.81
WDR13-208	ENST00000486125	GGT6	Q6P531	493 aa		32.62	■■■□□ 2.81
WDR13-208	ENST00000486125	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
WDR13-208	ENST00000486125	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.59	■■■□□ 2.81
WDR13-208	ENST00000486125	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
WDR13-208	ENST00000486125	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.56	■■■□□ 2.8
WDR13-208	ENST00000486125	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.53	■■■□□ 2.8
WDR13-208	ENST00000486125	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.49	■■■□□ 2.79
WDR13-208	ENST00000486125	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.48	■■■□□ 2.79
WDR13-208	ENST00000486125	PKD2	Q13563	968 aa		32.48	■■■□□ 2.79
WDR13-208	ENST00000486125	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.48	■■■□□ 2.79
WDR13-208	ENST00000486125	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.45	■■■□□ 2.79
WDR13-208	ENST00000486125	KIF3B	O15066	747 aa		32.44	■■■□□ 2.78
WDR13-208	ENST00000486125	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.43	■■■□□ 2.78
WDR13-208	ENST00000486125	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.43	■■■□□ 2.78
WDR13-208	ENST00000486125	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.43	■■■□□ 2.78
WDR13-208	ENST00000486125	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.43	■■■□□ 2.78
WDR13-208	ENST00000486125	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
WDR13-208	ENST00000486125	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.42	■■■□□ 2.78
WDR13-208	ENST00000486125	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.42	■■■□□ 2.78
WDR13-208	ENST00000486125	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.42	■■■□□ 2.78
WDR13-208	ENST00000486125	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.41	■■■□□ 2.78
WDR13-208	ENST00000486125	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.4	■■■□□ 2.78
WDR13-208	ENST00000486125	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.4	■■■□□ 2.78

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