RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484893.1

GINS1-204, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene GINS1, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-204ENST00000484893 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.37■□□□□ 0.85
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GINS1-204ENST00000484893 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.36■□□□□ 0.85
GINS1-204ENST00000484893 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.35■□□□□ 0.85
GINS1-204ENST00000484893 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.34■□□□□ 0.85
GINS1-204ENST00000484893 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.34■□□□□ 0.85
GINS1-204ENST00000484893 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.34■□□□□ 0.85
GINS1-204ENST00000484893 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.33■□□□□ 0.85
GINS1-204ENST00000484893 KDM6BO15054 1643 aa20.33■□□□□ 0.84
GINS1-204ENST00000484893 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.32■□□□□ 0.84
GINS1-204ENST00000484893 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.31■□□□□ 0.84
GINS1-204ENST00000484893 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
GINS1-204ENST00000484893 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.3■□□□□ 0.84
GINS1-204ENST00000484893 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GINS1-204ENST00000484893 RICTORQ6R327 1708 aa20.3■□□□□ 0.84
GINS1-204ENST00000484893 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
GINS1-204ENST00000484893 ABCC1P33527 1531 aa20.29■□□□□ 0.84
GINS1-204ENST00000484893 ADGRL1O94910 1474 aa20.29■□□□□ 0.84
GINS1-204ENST00000484893 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.27■□□□□ 0.84
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GINS1-204ENST00000484893 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.25■□□□□ 0.83
GINS1-204ENST00000484893 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
GINS1-204ENST00000484893 MBD5Q9P267 1494 aa20.24■□□□□ 0.83
GINS1-204ENST00000484893 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.24■□□□□ 0.83
GINS1-204ENST00000484893 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.23■□□□□ 0.83
GINS1-204ENST00000484893 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GINS1-204ENST00000484893 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.22■□□□□ 0.83
GINS1-204ENST00000484893 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.22■□□□□ 0.83
GINS1-204ENST00000484893 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.22■□□□□ 0.83
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GINS1-204ENST00000484893 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
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GINS1-204ENST00000484893 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.19■□□□□ 0.82
GINS1-204ENST00000484893 AFAP1Q8N556 730 aa20.19■□□□□ 0.82
GINS1-204ENST00000484893 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.19■□□□□ 0.82
GINS1-204ENST00000484893 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.17■□□□□ 0.82
GINS1-204ENST00000484893 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.15■□□□□ 0.82
GINS1-204ENST00000484893 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.12■□□□□ 0.81
GINS1-204ENST00000484893 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.12■□□□□ 0.81
GINS1-204ENST00000484893 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.11■□□□□ 0.81
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GINS1-204ENST00000484893 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GINS1-204ENST00000484893 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.09■□□□□ 0.81
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GINS1-204ENST00000484893 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.07■□□□□ 0.8
GINS1-204ENST00000484893 ABCA6Q8N139 1617 aa20.06■□□□□ 0.8
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GINS1-204ENST00000484893 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
GINS1-204ENST00000484893 ATP10AO60312 1499 aa20.01■□□□□ 0.79
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GINS1-204ENST00000484893 TSPY10P0CW01 314 aa19.95■□□□□ 0.78
GINS1-204ENST00000484893 ADGRL2O95490 1459 aa19.93■□□□□ 0.78
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GINS1-204ENST00000484893 A2MP01023 1474 aa19.91■□□□□ 0.78
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GINS1-204ENST00000484893 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
GINS1-204ENST00000484893 BCORL1Q5H9F3 1711 aa19.88■□□□□ 0.77
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GINS1-204ENST00000484893 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.85■□□□□ 0.77
GINS1-204ENST00000484893 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa19.85■□□□□ 0.77
GINS1-204ENST00000484893 ITGAEP38570 1179 aa19.85■□□□□ 0.77
GINS1-204ENST00000484893 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.85■□□□□ 0.77
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GINS1-204ENST00000484893 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
GINS1-204ENST00000484893 MROH1Q8NDA8 1641 aa19.79■□□□□ 0.76
GINS1-204ENST00000484893 ERBINQ96RT1 1412 aa19.78■□□□□ 0.76
GINS1-204ENST00000484893 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
GINS1-204ENST00000484893 NAIPQ13075 1403 aa19.76■□□□□ 0.75
GINS1-204ENST00000484893 MADDQ8WXG6 1647 aa19.76■□□□□ 0.75
GINS1-204ENST00000484893 KIF3BO15066 747 aa19.76■□□□□ 0.75
GINS1-204ENST00000484893 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa19.76■□□□□ 0.75
GINS1-204ENST00000484893 MLECQ14165 292 aa19.75■□□□□ 0.75
GINS1-204ENST00000484893 DEPDC5O75140 1603 aa19.75■□□□□ 0.75
GINS1-204ENST00000484893 HFM1A2PYH4 1435 aa19.74■□□□□ 0.75
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