RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484349.1

CHTF18-210, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-210ENST00000484349 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.57■■■□□ 2.32
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CHTF18-210ENST00000484349 PREX2Q70Z35 1606 aa29.56■■■□□ 2.32
CHTF18-210ENST00000484349 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.54■■■□□ 2.32
CHTF18-210ENST00000484349 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.53■■■□□ 2.32
CHTF18-210ENST00000484349 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.52■■■□□ 2.32
CHTF18-210ENST00000484349 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.51■■■□□ 2.31
CHTF18-210ENST00000484349 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.48■■■□□ 2.31
CHTF18-210ENST00000484349 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.48■■■□□ 2.31
CHTF18-210ENST00000484349 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.47■■■□□ 2.31
CHTF18-210ENST00000484349 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
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CHTF18-210ENST00000484349 AFAP1Q8N556 730 aa29.42■■■□□ 2.3
CHTF18-210ENST00000484349 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.42■■■□□ 2.3
CHTF18-210ENST00000484349 TIAM1Q13009 1591 aa29.42■■■□□ 2.3
CHTF18-210ENST00000484349 ABCC1P33527 1531 aa29.41■■■□□ 2.3
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CHTF18-210ENST00000484349 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.37■■■□□ 2.29
CHTF18-210ENST00000484349 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.35■■■□□ 2.29
CHTF18-210ENST00000484349 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.35■■■□□ 2.29
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CHTF18-210ENST00000484349 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.31■■■□□ 2.28
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CHTF18-210ENST00000484349 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.28■■■□□ 2.28
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CHTF18-210ENST00000484349 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.28■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.27■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.25■■■□□ 2.27
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CHTF18-210ENST00000484349 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
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CHTF18-210ENST00000484349 ABCA6Q8N139 1617 aa29.2■■■□□ 2.26
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CHTF18-210ENST00000484349 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.03■■■□□ 2.24
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CHTF18-210ENST00000484349 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.01■■■□□ 2.23
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CHTF18-210ENST00000484349 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.98■■■□□ 2.23
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CHTF18-210ENST00000484349 TSPY10P0CW01 314 aa28.95■■■□□ 2.22
CHTF18-210ENST00000484349 PLXNC1O60486 1568 aa28.94■■■□□ 2.22
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CHTF18-210ENST00000484349 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.86■■■□□ 2.21
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CHTF18-210ENST00000484349 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.84■■■□□ 2.21
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CHTF18-210ENST00000484349 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.8■■■□□ 2.2
CHTF18-210ENST00000484349 C3P01024 1663 aa28.79■■■□□ 2.2
CHTF18-210ENST00000484349 KIF3BO15066 747 aa28.77■■■□□ 2.2
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CHTF18-210ENST00000484349 ABCC5O15440 1437 aa28.76■■■□□ 2.19
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CHTF18-210ENST00000484349 ZMYM3Q14202 1370 aa28.73■■■□□ 2.19
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CHTF18-210ENST00000484349 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CHTF18-210ENST00000484349 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.72■■■□□ 2.19
CHTF18-210ENST00000484349 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.71■■■□□ 2.19
CHTF18-210ENST00000484349 HSPA2P54652 639 aa28.68■■■□□ 2.18
CHTF18-210ENST00000484349 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CHTF18-210ENST00000484349 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CHTF18-210ENST00000484349 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.66■■■□□ 2.18
CHTF18-210ENST00000484349 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CHTF18-210ENST00000484349 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.64■■■□□ 2.18
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